Gene
Gene Model ID | aug_v2a.01251 |
---|---|
Locus | scaf491 : 7968 ... 11175 : - |
To GenomeBrowser | scaf491:7968..11175 |
Genes list of scaffold | scaf491 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 53-1 |
Description | This gene model contains RVT_2 and BACK domains. |
mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.01251.t1 | gi|149245841|ref|XP_001527393.1| | conserved hypothetical protein [Lodderomyces elongisporus NRRL YB-4239] | 0.0 |
aug_v2a.01251.t1 | gi|642925593|ref|XP_008194613.1| | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC658801 [Tribolium castaneum] | 0.0 |
aug_v2a.01251.t1 | gi|698481554|ref|XP_009787759.1| | PREDICTED: uncharacterized protein LOC104235647 [Nicotiana sylvestris] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.01251.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01251.t1 taaaacattcaaagctaggtttgttgccaagggttacagccaagtgagaggtattgattttcaagaaacctttgcaccaa ctgctaatctcacatcattgcgtgtgctaatgcaaatggcagcacaacacaatttggttttgcaccaaatggatgtgaaa actgcatatctcaatgcccctattgattgtgagatttatatggatcaagctgaaggctttgaggttccctcaaagagtgg agggagacttgtgtacaaattgaacaaatctttgtatggcctaaagcagtcaggtagaaattggaaccatgtattagact gttttttgttggagaacagttatattcaaagccctgttgacaattgtgtgtataccaagcatgttggaagtggatttgtt gctatgcttatctgggtagatgacataattatagcagcaagtaacatgttgctaatgtctgaagctaaaggaatgctgaa ggagaggtttcatatgaaagatctgggaagactttcatactttttgggtattcattttgaacaaaaagatggttttgtaa agatgaatcaaaaggggtatatcactaaggtgcttgagagatttgagatgtctaattgtaagccaaggtctacaccttca gaacagaagcttgagtttgatggtgaaacccctgtggatcctaaacgataccgagaagcagtaggtagtttggtgtatgc tatgacatgcactagaccagacatatgctgggttgttactaagttgtcacagttcctggttgctcccatgatgggacact ggatagctttaaaacatgtgttgcgatacttgaaggggactcttgattttgaattgtgctatagaaagtgtgatgatggt cttagactgataggctacagtgatgctgattgggcatcatctaaagatgatagacgtagtatcagtgggttttgtttcag tttgaacagagctggtcctcttatttcttggaaatcaaggaaacaaccaacagtggctctgtcatcatgtgaagctgagt atattgctctggcagcagcagtccaagaaggtatgtatctcactcaaatgacaaaggacattggtgaggtaagtggccct gttttgatttttgaggacaaccaaggtacaatcgccttgtccaagaacccagtcaatcaccaaaggtcgaaacatattga tattcgataccatttcattcgcagcacgcagaatgcaggcaagataatcattaagtattgtcccacaactgacatggtag ctgatgtcatgaccaaaccagttactaaatttaagttgcaaaagtttagaaattatatttttggttcttaagacatgagt atacaagtaatatgcaagcatattgttattattgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnngatgtattatcagctcttctctgtcgagaggacctcagaactccatcggagaacttcgtcttcaaatcag tgatgcagtggatcaagtacaggaaagaagaaaggatagatgtgggagctaaagctatcggagctgttcgtttgggactg gtggacagcaaggatttgatcgaggaactcgatactgtggaaatgaaggcgattccagaaataaacatgctgttacagga agcattaatacgcaattacaggccttcgaggagttcagcgctcgcactggagaaaggaaaaccaagatctatgaagagtc tttaagtttgcacgaagacgttgtttgtaattactttttgctcaatagcgacgcgcggacgcactaaaaatagattacgt cacttttg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.01251.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01251.t1 MQMAAQHNLVLHQMDVKTAYLNAPIDCEIYMDQAEGFEVPSKSGGRLVYKLNKSLYGLKQSGRNWNHVLDCFLLENSYIQ SPVDNCVYTKHVGSGFVAMLIWVDDIIIAASNMLLMSEAKGMLKERFHMKDLGRLSYFLGIHFEQKDGFVKMNQKGYITK VLERFEMSNCKPRSTPSEQKLEFDGETPVDPKRYREAVGSLVYAMTCTRPDICWVVTKLSQFLVAPMMGHWIALKHVLRY LKGTLDFELCYRKCDDGLRLIGYSDADWASSKDDRRSISGFCFSLNRAGPLISWKSRKQPTVALSSCEAEYIALAAAVQE GMYLTQMTKDIGEVSGPVLIFEDNQALLCREDLRTPSENFVFKSVMQWIKYRKEERIDVGAKAIGAVRLGLVDSKDLIEE LDTVEMKAIPEINMLLQEALIRNYRPSRSSALALEKGKPRSMKSL* |