Gene
Gene Model ID | aug_v2a.01957 |
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Locus | scaf665 : 82919 ... 86925 : - |
To GenomeBrowser | scaf665:82919..86925 |
Genes list of scaffold | scaf665 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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low quality protein: serine arginine-rich splicing factor 6-like | GO:0097159 GO:1901363 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.01957.t1 | gi|347972221|ref|XP_003436860.1| | AGAP004592-PE [Anopheles gambiae str. PEST] | 1.0e-28 |
aug_v2a.01957.t1 | gi|347972223|ref|XP_315232.3| | AGAP004592-PA [Anopheles gambiae str. PEST] | 1.0e-28 |
aug_v2a.01957.t1 | gi|683448070|gb|KFZ46606.1| | Serine/arginine-rich splicing factor 6, partial [Caprimulgus carolinensis] | 3.0e-28 |
aug_v2a.01957.t1 | gi|679243386|gb|KFW96361.1| | 5.0e-28 | |
aug_v2a.01957.t1 | gi|704303252|ref|XP_010163566.1| | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: serine/arginine-rich splicing factor 6-like [Caprimulgus carolinensis] | 6.0e-28 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.01957.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.01957.t1 ataatgatggaaaaaacgaaagaatagagggaaagaaaaactctgaaggcgccctgtgaaataaaagaaccagaaaatgg caggttggaatgccttccattagggcctacagtctagttgggagactgtgcgtaggactgtatgtaccattcactcgcct tgttttggtatgaaaagaaaaaaagatacaagtatttaatgctcctggaaagatgtaaaagccgggactctcttaaaact ttgtaaaaattttttgtatctcaatcaaagagttttctaactgatcaccataatgggccactttggaaaataccataata ctcttggtttgcccctccaaattttacataagcattgtttccagtttctcatgggacttacattggtctccaagagaaaa caaaagcagtgcttatgcaaaattgaggggacaaacaaagagtattatggtattttcccgaaatggcctataacaaagct tgacatgtttagactgcttttgttaatggagagatgaaccagggtttgggtgtaaaaaaaaaataattctctctgcaact tcaacaagatacagtacatgttggtttgcattgaggggcatgttatcaggtgagtgttctggatagtgcattttaaaagc tgtgcctagaaatcttttcaaattcaaggtgcatggttttcatgcatgcatgaatcactgtagcaatgtgttcgttagtc ccttgttgaaaatagctattattatttgttaaacatgaatatttatacatacttttttctgtttctccccaactgggggt ctagatatggtccgccagtgagaaccaaataccgtgtcattgtagaaaacatgtcaagtcgtacaagttggcaggtatgt gtaaggctagagagctgtggtttaaatgttatgcttaaaggtttaacacttacagttttcaatgttcagcctgcaatggc tattgtcaatgttatgtttgaacagcagtaaattttgaccataggaaaaaagacctatttatgtaatcaaagtaatcact tgttatgtaaagtttgttttgcacaatgagtaacataagtgatagtactcatgagtgtggatatgtctgctagtgttgtt tgtcttttagatgtgcaaattgtggtaatggtccctgaatgtggaaaccaacaaaaaacttttttataccagtagcaaat ccccatttttactttacatttatttatttgttgacagggcgttaaggaataagctcttgataatgactaaacattctgtt caaaagatgttggatgttttcctaaactcagaggtgttgcttttgcgtgtcgccctgcccttacaatggttgagaaagct tgcaaattaacgatgagcgtgaagtgtgaaaatgtgttaagcacacatgcaatagatgggaagccaacttgaggtccttg aggattctaagccaggctactaaactaaatctgtgatttgtgagaatttgacgaaggtattgtccaggtaaggtacagag agaagctgacaataacctccatttctgggtcactgacaaatcatcagaagtgaatagtgagaggattgcacaactttgtg taaaatggtcacgagaaatgaaaacaaattgtgacaaatttttttggaaccaccgaagataaaaccgtaaccctcgaaga gtatcgatgtaaccatagttatcaacaccctgcaaaagttgcttgtcaaggtatgcgtaatcatggaaaaattaatggat ttgaacagaagtgaagatgtaggattttaatgtcttgtaaagttcaggggggtccttaaatttctaaaagttattggatt tattccagatgtagcagtttcctggtgattaacaatatgtcttggaaactttctcttacattcataggacttgaaagacc atctcagacaggttagcagcaattccaaactgacttacgccgacgcgcacaagaagagagttggagaagggtaaggtgga gtcggaagtgatgttgaggaagctgtgcgctggctgtgtactgaactggttacatgtagtttggtatttcccctgatgtt gaactgtcttctctcacaaagaaaggttgcctaaatggaggctaataattttgtctctcaaccattttctttaaacttcg taaagaaagcccattttaactaaaactagtgtctttagaagtcaggtgatcccttttgattgggtagttactacagttaa agtgtagttcaaaacaatgtttgaacccatttggcttgacttggcatgtagtgtatattttgctgtggcgttgatttaat ttctaaattttcatgattagaaatgtcgaatttgagactcgtgaagacatgatggaatgcatcaggaaagctgataacac agagcttaatggcaggaaaatcagacttacagaggtaaatattttttcacttttagatttggcaattttcttcatcaatt tgaaataatgtttctaaaggtaaaatttttaattttcaataggacagagatcatagctctccgccacccaggcgcagtta cagcagaagatctcggtcgaggtctcggtcaaggtcccgttctcgttcccgctcccgttcacgatcgagatctcgctccc ccaaaaggcgatcaaggtaagcaaactctataattaattgggtgctatgacatctttgatgaaaaaatgaggttatggta ggagtgatttttgaagtgctccagttgccaaaaaaggtagaaaacatttctggactacttgtcttgcaggtcagcatctc gctctaagagtcgatcaccctcaaggtcccctgtgccagttcagagacattctcgctcgccctctccaagagcaccaagg gaagcttctccagatgaaaagcccaacgagagtgatgaatgatcagttgatcattaactcattgtttgcatgtttttttt tcttttatcactactgtgcatttaaatttaactcgaaatgtactgtcaaagctttggcttgattatagcaatataacact ttttattagttggtttgttttcgtatacttcaaaagaaagaatcccatattgttagtagagttgacacacgtttgaatat tgttattattcagaataaagctgaatatttgtagaatggtattacttgcttttagtccttggaatcaaatacacatgtac tgtatttaatcagctttacacttagaaaggcttttttattcagtcaattaatatggatagaactatggtacacatgaagc ataattattgaaataaacttatttcaactttagtttgaacaaaagtgacaatattatcttactgtattttcccagtccca tcctttaagttcaaatttacagccttcaacaaaacaatattgatccattatgtagtaaggtcctggcacacactctgata ggtcaaaaacatagagaataatacatgggagtgcagagatatggaatttctcttcaagtgttacactcaatatctcatga gtgaatgcagcaaacaggcgagataggaaccatgtgttttgtttatgttaacataattattacaaaccgacttaattaac gtttaagagatgcgtagtcctttctttatggtgctaaagtaaagcaagtgacgtgccagaagtggattggctatctcaaa tacaagaaaaattaacttttcatgtgtgatcatacgctttttctcagtggcggaaatccctataaggcactccagtttat attataaatagtggtacaatttatatactttttttcattttttcattacaaattcaacaaattggatgccttccacaaag tttaataattgtacgcaaaactgttgttttaaaagtaactgaggaggcactcttgcgtacacagttaattttacatagat acctgttgactaaatgaaacaaggcaatcatgttcatcttgatttattcttaacttcaacattaatgcataaatttataa gaatctt |
Protein
Protein ID | aug_v2a.01957.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.01957.t1 MNIYTYFFLFLPNWGSRYGPPVRTKYRVIVENMSSRTSWQDLKDHLRQVSSNSKLTYADAHKKRVGEGNVEFETREDMME CIRKADNTELNGRKIRLTEDRDHSSPPPRRSYSRRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSRSPKRRSRSASRSKSRSPSRSPVP VQRHSRSPSPRAPREASPDEKPNESDE* |