Gene
Gene Model ID | aug_v2a.01959 |
---|---|
Locus | scaf665 : 107296 ... 114836 : + |
To GenomeBrowser | scaf665:107296..114836 |
Genes list of scaffold | scaf665 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
syntaxin-8- partial | GO:0008270 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.01959.t1 | gi|156371730|ref|XP_001628915.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 1.0e-25 |
aug_v2a.01959.t1 | gi|291221857|ref|XP_002730935.1| | PREDICTED: syntaxin-8-like [Saccoglossus kowalevskii] | 5.0e-24 |
aug_v2a.01959.t1 | gi|524872531|ref|XP_005093027.1| | PREDICTED: syntaxin-8-like [Aplysia californica] | 3.0e-22 |
aug_v2a.01959.t1 | gi|390370014|ref|XP_799247.2| | PREDICTED: syntaxin-8, partial [Strongylocentrotus purpuratus] | 3.0e-18 |
aug_v2a.01959.t1 | gi|390340081|ref|XP_003725162.1| | PREDICTED: syntaxin-8 [Strongylocentrotus purpuratus] | 3.0e-18 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.01959.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01959.t1 nnnnnnnnnnnggactggaactgaaaggcaaatccaagatggcgccgttcggagaggattcttggtaagtttggactgaa gcatttttattttgttttcagtgaagggaatcaaagtggctgtaacatcgactctcatcaccactcaaaacagtgcataa ttgataagaaggattacaggcgatcatttgtgctcgaaaatcgaagaaaaaaatcgaagaaaatcctataaacagtataa agccagtctctgtgcagtggagacaccggagatcattgtcgcattttgactctgaccattttttctttgctctgttatct ttacagggtctatgtcaattagtgattttgagaagcgaatattaactttcaaggacttgaaaaataggtgttagcaatgt tttttgtgtaagctgttcaaaaccactggctttattcgcacaatggtatctggtcgtttcgttcatccattcatatgatc aattagcgtctaaagattgccgccaggaaagcaactttcgctccatagacacctcggctgcaagtcgtctgaattaatta aagttaccttgatgagaagagatagcctagctgagtaagactggcttcagtaacattattgcttgggtgttttggcagag ctaagacagtgatgtatgagttgggtatcaaagtttgtgaaccagtcagcatacaggaggaagaataccctcagacagtg attgaaataatttgaatttttttcttcatccctgtgttcatcttatctcgttcccttacataaatttccagtccatcttt cttgtcacacatactgtgtttaagttgagatgttattgatgtatcactctattgtcccagtccaatacaatagtcattaa tattataatcatctctgttttcttaacaggttaagcgagtttaaaactgttgaaaagtatggccaagatattatggagaa gatcaatgagcgaaataagctcagacggaatgggggaaactataacaaagtaattcattctttatgttggagaaatcttc tttgctatacgttaaatgggggtttttggtcaacctagtgctttcagccattatagctcctttgagcaacactttacaga agaatgtagattgggttttttaagagaataattatgttgactgtcaaattaagtggatggcttgaagctggttattgcca accaacattaactgtcatggcagcttacataaaacataataaatacaacagtatgttatttatggcatgggtggttgata taagggaaaaaattgtacccaaggtcttgagtacagcctttagtgtaaattagaaatcaaaccactcctaatttaaccta attttactactaatttaactgtacataatgcagattcttttatctgtaagcaagttttttttttcactttattttatgct ggagctgttttcgtccagttttgcacagaagtgcaaggtgatatatgcatgggaatctatgtcccatatgaggtatataa ccttcctgtatcggctcatacactgaaaaaaggacagctgcgaaaccaggaacttccttccctactcttctcaaatggtg tgtgggttctttaacgtcgcacatagaacttataaacatggaaggtattatgagacggggcctacagcctatagtcctta cttgagaagacttgaaagtctaaccataacttatgcaaatgtaatggcaacctcagttattttaagaccctgagtgatgg ttccgccaagagtcaaacccacaacctctgtatgacagccggatgctcaaccaactcagtcaccggggcatggttttgta atgctctacacttgcctaacttgatgtagaaaaatttcctacagacagataaacctttcaggtctgttaagtactttatg tggttctgctgctgcaaattctatttaataattaaagatgccagccattttaaagatatctattattttataaactggag tgtctggggaaaaaccatatctccacacatgaaaaaaaaattatgataatttttcatgagtttttgagatcaccaatcag ctgctctatttagcacaatgaactaatggcaattcgtcctcgttttaaaacagtgaataaagttgacttcttattggaaa ggtaatacatggttgcttgaagatatggaatttctcttcaagtgttcaacttgatgttgagttcaacaggataagagaaa ttctacatctctgtgtgcccatgtattattctttattactgtcatagcttttcaacatgatttaaaattttaatgaaata ctgtacctatttaattctccctgttgttttggtatttgctttgggttttgctaatctgcatgattgtatttcaactcctt ataattgcattaggttcaatcagatgtcaggataatgttgaagaatttttcaaaagacgttaataatctcaagcagtcac ttctgaaggcatcatcaggatatgaaatgtatcctttttcaaaaacattctcctcatgatgcaaaatcctgtttgtatgc ctatactttgtgttattgagcactacccttgggttggtctcgaggaccaacatttgacacaaacaacagggccattttga gaatattaatgggcaaaaataaatttttttaccaatatgcatacagtactacagttggttaggtttttattgccaaggat gcttgaacattctgtaaatgtactagtctttttgtgggtctttgaggcaatctgggatatgaataccttaattttaatgc agagcagaaagagaaatcgacagaagacaaaacatgcttgatcagctgataacaaggtaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnncatgattttgttgagaactgtggtaccttttgcagactaaaatggagaatttggcaagcttatgtgtattaagcct gctgaaataaacaatggaaagtgagaatcaaataattaatcttacaatgtaagcagccaatcaaaattgagaaggtattg aagtgtttctttgtgtttacgtacggcattggtgaaagaaataattattattctgcaggctgttttgttgtcattttttt cggttttactgtattttcccaatgccttccgaagtgatcataatagtaatttacagtttatgttcttggccataaattta tatattttgggaccttctcagagctcattttaaccgcccccccccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacttgactttaaaatggcctgt gatcagaaatactgtacagacagtaaaaaggccatgaagtgcatcccttagggctactcattgtgtaaacaaaaacagaa aaatatggtaaaaacttgtagataagctgcacccccaaatttctagtgtgattttgagaaaaaaaataaaaaggagaaca aatcactttggcatttaaaccttatttgtttgcagttttctgtgataaacttgccaaattgtaatgtacattgtaatgat ttcttgagttgttgcaactgacaagttgtttttatagttgaggccctcgattgaagtgaaaaatttgaagttgtatgaaa gtcaagtgcagctcaattgcaggagaacgtttgcttagtaactactgtattgattggagaaaaacttgtccctaattgag agtttaacaaccccatggacaaatggtcttacacagaagcccgcacccacgattttgagtcaatgtttcagcaaaaaagt gtgactcacacaagtttttacacaaactcaaatgcaaactgtaaccctcgtgatatgatcaggtattttgtgctcagact tgatgaaacacttgtatccaaatttagaatgcaacttatgattattaccagttgcaatcctggacatactttactgttag acctttcgtaaataactagcggcaccctttgcacagcaaagcacaaaaacgttgtttttattttttggtacactaagaac tacatacagaatatattactcatacatttttaaacttgacaactttacaatactaacactactaacgatatggtacttac attatttacaaattatactataatattacttacacttccgtataacgcatatagaatgcagctaattaggtccaatcctg gacatactgttcagtggtaagtaactagaggcaccctttgcttagaaaagcacaaagactttgccatttttattggcaga acaagatgaaggtctggaagctttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactgtttggctccaagggcaaggttaacttaaatttcccgtgga gtgctattggatataatcctataacctaagacagtgtagatcgaaaagctggctctttgcagtaactgttagagccatgc tcatgtcttctcgttatttgtttttaggcatctgtgcaatcccgaatttgacaatctttgcccccacttgtacaaccgca gtaacacgtgtagttttgttttcttagtttacaaagaagttgataaagctctttctttattttattattattttgtcttt acaggcatgctggtggttattattctgttaattatcgccattattgttgtggccgttattccggttcattagaattatgc taccattttgccatagtatcttcttttgcacagaagtaatgatccgaaagcctattttaatgtttccctgtcataaagcg ctgctaaaaattgaaaaaattgtggtgctgcagaataatctttcccttcatcggaattcataaactcgtcaaattatcca cgaaaattcggttttatcaaacgagttgtttaaggtcgaattaccaacgtgaaagattttgaaagctgacatctcgagcg ttagcccttgttcattcattctagtgaagggctaatgttcgaaaggaccgctttcaaaatctttttggtggcaattcgac ctttctcaagtcgctcgataaaaccaaatttttgtaacactctccctgtgacgcagttcaacagtttctttagaaatcag aaatttataaattatccatgatttgtgtggttagacgtgatcccgctaggtaatgcactgtctttagcgtgtcttacaag agtgattgtttcagggaaggt |
Protein
Protein ID | aug_v2a.01959.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01959.t1 MAPFGEDSWLSEFKTVEKYGQDIMEKINERNKLRRNGGNYNKVQSDVRIMLKNFSKDVNNLKQSLLKASSGYEIAEREID RRQNMLDQLITRHAGGYYSVNYRHYCCGRYSGSLELCYHFAIVSSFAQK* |