Gene
Gene Model ID | aug_v2a.01993 |
---|---|
Locus | scaf676 : 39216 ... 45991 : + |
To GenomeBrowser | scaf676:39216..45991 |
Genes list of scaffold | scaf676 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
splicing factor u2af 35 kda subunit isoform x2 | GO:0000166 GO:0000398 GO:0006369 GO:0006406 GO:0015030 GO:0016607 GO:0031124 GO:0044822 GO:0046872 GO:0050733 GO:0071013 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.01993.t1 | gi|156376577|ref|XP_001630436.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.01993.t1 | gi|507622056|ref|XP_004696963.1| | PREDICTED: splicing factor U2AF 35 kDa subunit isoform X2 [Echinops telfairi] | 0.0 |
aug_v2a.01993.t1 | gi|543366452|ref|XP_005526584.1| | PREDICTED: splicing factor U2AF 35 kDa subunit isoform X5 [Pseudopodoces humilis] | 0.0 |
aug_v2a.01993.t1 | gi|564232300|ref|XP_006260531.1| | PREDICTED: splicing factor U2AF 35 kDa subunit isoform X1 [Alligator mississippiensis] | 0.0 |
aug_v2a.01993.t1 | gi|699686840|ref|XP_009904118.1| | PREDICTED: splicing factor U2AF 35 kDa subunit isoform X3 [Picoides pubescens] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.01993.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01993.t1 gcgcgaaaagaattgctccgaagcttgcaagggattctgggtggttagcttcgggtagaaaaaagcatggcggaatactt agcgtctatctttggaacagagaaagacaagtaagtcatcagttaccgcgtgcatcttttcgtagttttgtatgtcttac tagacgattcgtgaatcagtaattgaggataaaattggtggtgttcgtttctgtgctcgaaacatgcgatgttctgtcgc atttgtcacgagggcctgtacatcgagtgaatgtccagatctttcaatgaggtttcctcgaacgtttaaagcctagtttg gaaaatgactttatttttttcacagcaatgagagataagagtttgtctatttcacgagaacgttttaataatatcctcgt cagtgaatgacaagaagatgtaacatgaacacacatgaatcattcttatttgtctgtttttccaagttatctgataacaa aaatgggaaaaaagatgttgtacgcataaactacgtttgtaaatggcagtgtatttgttattctttcgtatgtttttagc tcatttccacaaaaaatccaggattgaattaaatacattacagaaggcaatcctgagttcaaactttgtgaaaatgagct aaaacgtcttttacagtttgcgactaaagaaattcactttcttcatgtgcttgttaattagacatactggcctcacttta gtttcaatgttcttttatcttttgcccatggcagtgaggttagaaaggctcattagcattgacacaaaagnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcccttatgaaagcgatctgtagctttatgctggtatccggtttgagcgcc cccaagttgtagcgccccacatcttggttccagtgccatatgattaaacatatgattaaacgaattcaataaattgtttt tgtaagtaaacgtttatgtgcgtttgtgtaaatcatagtttttgctcgaccttttcacggcgtccacataaatcgagtta gatctcgatcaatacccaacgaaacacattaacccctaaattagaaagaaaacgtttattgatgtctctgtgatgcgaat tgagtagcgcgaatgagaattgcatagtaatgtttgcttgatttaacggcgtcggtagccaacacaaaagcgaaagaagt tttgtagtcaagaaataaatcgagtttgatctcgatcagtacccaacgaaacacaacaaaacttacaccaaattaaactg ggggcgctagaaccaagatgtggggcgctcgaaccttggggcgctcaaaccgtaattctttatgctacttgataggtggg ataattgatattcgaattcttttgcaattcttgactatcttaatctgtttagggtcaattgctctttctactttaaaatt ggtgcatgtcgacatggcgaacgttgctcaagacttcataacaaacccacattcagccaggtgagtacatgcagatgcaa tgctctcaaacacaaaaagtctgctctctgttatatgtgtgtgtaggttttcatgtctgcatttggtcatgctacatact ctacttaagaaatctgcaacacaaactgaccatgtggcatgaaatttttgctggactttatttggtgaatttggagaatt gtctggtgattcaggaaaattaaaccttggcaaaattgtctttgacgaaaaaaatccacaaacatttacttcacttcttt aaattactgaatttcaattaaatgaatcattgcaaacattatcacagccttcttccttgcaatttaaacaaaatgaacta gcatcttttgctccaaggaaaggaactgatgactagagttggtcagtgtcatttcaagcattagcatgttgttggactga agttattgctggcataaaactgttgtgtgtgtacttttcagactattttgcttcaaaacatgtatcagaatccacaaagt gcagcacaggttgcggatggaacaagtaaggtttacattgcaattgtcaagtcatgaataactactgacattgttggtct ctgcagatatcttctttcaactttttttgctttaaaatttctttggttgtaagtaggagaattttccagacagaagcagt ttgtcaccacaatgatatcaagtttcagattgtgtaaaaataagtattcatacagtgcttgacttaacaaaggactgtat gcacaaccttgacaggatttcatttgtttttccctcttgtcctacctcagcaaaaattaaacacaaatcaaagcgccgct cttgttactcgtggatatgaaagatacggacattgtttgaaattgacaggcagaagttttctttatgcaccagtcagagt gctccatcctgattggccaatagggtagaacttcctgttacgagcgcctgacaatttgcatacagattctcaccaaaact tgtggatatccacaagtaaaaaggagatggtagtacgtgaacaaggccaaaatattagattcttcaacatcttttatctg tatttttctctaaaaggtagcgccatatctgatgtcgaagctcaggaacattacgataagttttttgaggtttgtacaca tacttgaatgatattttgattgttatgatgttcaaatattgcactcagaaagagaaaaccaaattttattgttgtttttt ttttctgtgcaggatgtatttcttgagttggaggagaaagtaagtgactttttacatgttcattttgtgttctttagacc aagaaaagattatgttgtgtacaagtatcttaatggaatccttggtgctgataagtaaagtcagaggaagtgcgatcatt tgtgactgctgtttgctcaaccaaaggtgtcatcatcttcaaagtcaaacaaatccttttcaggactttactcatctgga caatcagactttatcaattgaaggggtgagtggaataaggccttaagtgacttttgatgcaatgtgaaattctcctcgtt attcacaactgaatacgaggaaatttggaaggagaatctggtaatttatcagaagtcacttaaggcttttctccaggcac ccctgcaattatttatttcagtaactgttcagttcaaaacattctttgtgtgtacatactgtatgtgtatgtttaatgtt gtgaaaggctgtgataaatctattttcgttgtgttattgcagtatggagaaatagaggagatgaatgtttgcgataatct tggagaccatctggtcggcaatgtatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnttgatttgccccggaaatgatcacaacctgcgagtccgtttttgcattgaagcgcaaagcctaacgcg aaagtcccgttaggaaataaaattacgcgacacccatcattcaagtagaggtattctgctatcgcccggttaaacacagt tttaaaatatcgcaaatagtgtatgttggcaccattgctctgggctggtgcaaaaacatgcaacgattcattcattgttc tttcctttactgttcaaaactgttgactgtcataattcccatttgctttgaaattcttgataatatcaatatcttcttcc gggcatatctgtcagttgacagtctaagcatctgtaaacaagaagtttttataattgacgcacctccgctttgacactgt tgggagaatttaccgtctgacgtctcgacaaaaggttgatttaatttcacacatgattaagaagcgacataacacactat tgggctctattcagccgatattcattttgacgagcgacacatctcatctgttcttttaagaggaagaggcttggttttcc tgactatgtttcacagttcaagcaaactcatttcgtaaaatggagttcccgattgtgaacgctacaatcaagttttcacc agttaagaaagaaaagaaagcaacgtcaaacaatagattcgtcgtaaaagaagtgaaatgcgctaatcagaaaccatcaa cgaagcccttggtggcatccaaggttgtcgaagtgagcgttcccagagaagctctaaattcgagatctcaacaaacttat gctttgccaagtgtgccactgatagaagtcaatatcaacaaacatggatttcaggt |
Protein
Protein ID | aug_v2a.01993.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01993.t1 MAEYLASIFGTEKDKVNCSFYFKIGACRHGERCSRLHNKPTFSQTILLQNMYQNPQSAAQVADGTSSAISDVEAQEHYDK FFEDVFLELEEKYGEIEEMNVCDNLGDHLRKRLGFPDYVSQFKQTHFVKWSSRL* |