Gene
Gene Model ID | aug_v2a.02178 |
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Locus | scaf724 : 54761 ... 57977 : - |
To GenomeBrowser | scaf724:54761..57977 |
Genes list of scaffold | scaf724 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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matrix metalloproteinase-16-like | GO:0016787 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.02178.t1 | gi|391330624|ref|XP_003739756.1| | PREDICTED: matrix metalloproteinase-16-like [Metaseiulus occidentalis] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.02178.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02178.t1 ctcttcgagtatttaaaaagcgcagatttcaattcaagacattgagactgtaacacaacatcgaggactcacatctacat tgctagaaatggatgccagaattatattcttgttagggatgactgctaccttgagatcccttctcatttcagccaaaccc cttcagcaaattccagtgcagattgcaaaagaatcagagcttatggtaagcaagtcttttccacttcagtaagcttgcat tcattacatttcgttgctcattgaagtcgtaggtcgactcatctgcccgagtggtgagatagcgtagtaataatcgatat ctggattctagtgtagaatgtacgaaagtgtatgaaatcatccgtgcgtggtgcgaaaatatgacaaaaacacgctcgga ggatgttacgtacaagagaagctcaaaatactttaatactccacgatgcagtctgccttagaatttagcaattcggagat gttacaaaattccactagcttagccttaaactaatatggtgaaaacttgtcctgttattgattatttgataagtccgttc cttctttcctgctttgtcaaacaagaatttgagctgtcttcgaaattctatcacttctttcccggcagcgtcactcattg aaaggtgtccgtcatcaagccgcacgatgacaaacattttaaaaacaaaccgcaggaaaaggagaggcgggatgtagtga tgcttgcataaacacataagcatggtatgacattgttcattgttttcttttcctcaggactaccttgtcaagtacgggta tcttgcctatccagatcataaaatcgggagagcgatctccatgagggaattaaaaattgcaataaaaaaaatgcaacgat ttgctggattaccagaaactggattaatcaccgacccgaaagcacttgcgatggttaagcgaacaaggtgcggagtatca gactttggaccatcggacctcgcgcggaggaaacgaagatatgcgattcaaggaactaaatggagaaaacaggttggtta ccttacgtttcgaggaaaaagtaaaatagaggaatattctcatagaactatcacaccttgaaaagaaaacgaaaggatcg atcccctacaagtgctttaatattacatgatacaacatacaaagcagcggatataagaactcagtggttagtgcctaaga ccaatcacgtattttaatgttatattgcaggaggttacttacagaattgagaactacacacccgatattaaaaacaaaga agatgtggacagaacgtttgaaaaagcactcaaattatggtcgagcgccagcggtcttatcttcaagcgagaagacaacg taaacctcgaacccgatattagggtgaaatttgtaactggtttccatggtgattctcgaccagccgatggtcctggtgga gaattagcgcatgcgttctttcccggtgcagacaacgccggaattgacggtgatatacacttggatgatgatgaaacctt taccataaatgttcaagatggtgttgacttgttgtgggtaatggtgcatgaattgggccacagtctaggactggatcaca cttatcaccccgagtctgtcatgtttgcctattatatgggacatgtccccaacttgaaactggacaacgatgatattgag ggaatccaaaaattatacggtaagttgctattttctccttggtttacttttaatttaaagttagcatgataatcataaaa cggagaacttttatcgtttcatttttatggaatccgccgtaattctcgatgaatgctctcctcccttcaaggtggctaag caccgtttttattatcaaaggacagatgttgataagccaggtttttcaatgtttccactgtaaaatgatacttcatcgaa acctaaatgactttgcggtgcagcggaaaacattgttgttgtaattttcttcttgtttggaccctgatctggatgtgcaa tattctcgttttaccatttatttttcctttgtacaacagagctaaccttagttaaaccgattgtttctgtatacctgaca ggtttgcccgatgttgagagagtaactccatcaccagaccctacgccaaagacttgcagtgacgtaaaaccggatgctgt agtgactacaaaggacaagagaacatacgtcttcagcggaaagcacttctgggaaattaaagacttcggtggttcagatg gtccttttcttataaaagattactggcgaggcttacaagacaacgtcgatgcttcttacactcagagccctcatggacat acaatattcttgaaaggagataggtacgtcatttctccacctctctgtcacgattttcaacctcatgtaaatgaggccca aagaagactgaacccaggtcctgtcagtagaaaatcaaaatttgaatactaattatcaattgttcatgtatcttgtcctc taggttttgggtttatgtcaataaggaacccctttacggaccaggacatatttcagaaattaacctgcctgacgaactcg ctaatgtggatggtgcgcttgaatggaataggaatggcaaggtctaccttttcaaaggctcaaactactggcgatacgat aagacaaggcagaagatcgaggatggctaccctagacacataagtgcttggagaggtattccttcaaatattaacgctgt ttttcaatggaagaatggaaggtcgtatttcttcaagggaacgaagtattatgcattcgacgactatagtgttaaagtgt tggaatcaccaaatccgtatcccagagatgtggccgcttactggatgggttgtactaatcctgaaataaagcttcagccc cggttaagtgcatccacacttggctcagttccaaacttgttcctctttcctctatttttcatgatctcacagctgttata acactctacacaacacagacttatttataataaattgtagcaaggacatcatatatgttatataaaatagaaaataccct gtttagaaaattactcttggtagttaggccactcgtacgacacttatgatttgtatatagatgttattgtgcattatttt tttatttaagaagcttatttatcaaatttctatctgtaaaatattgttgagatgttgataattcatttttcgacgaaaat aaacagagtttaaaatc |
Protein
Protein ID | aug_v2a.02178.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02178.t1 MDARIIFLLGMTATLRSLLISAKPLQQIPVQIAKESELMDYLVKYGYLAYPDHKIGRAISMRELKIAIKKMQRFAGLPET GLITDPKALAMVKRTRCGVSDFGPSDLARRKRRYAIQGTKWRKQEVTYRIENYTPDIKNKEDVDRTFEKALKLWSSASGL IFKREDNVNLEPDIRVKFVTGFHGDSRPADGPGGELAHAFFPGADNAGIDGDIHLDDDETFTINVQDGVDLLWVMVHELG HSLGLDHTYHPESVMFAYYMGHVPNLKLDNDDIEGIQKLYGLPDVERVTPSPDPTPKTCSDVKPDAVVTTKDKRTYVFSG KHFWEIKDFGGSDGPFLIKDYWRGLQDNVDASYTQSPHGHTIFLKGDRFWVYVNKEPLYGPGHISEINLPDELANVDGAL EWNRNGKVYLFKGSNYWRYDKTRQKIEDGYPRHISAWRGIPSNINAVFQWKNGRSYFFKGTKYYAFDDYSVKVLESPNPY PRDVAAYWMGCTNPEIKLQPRLSASTLGSVPNLFLFPLFFMISQLL* |