Gene
Gene Model ID | aug_v2a.02840 |
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Locus | scaf962 : 50210 ... 58325 : + |
To GenomeBrowser | scaf962:50210..58325 |
Genes list of scaffold | scaf962 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-HSP40-5 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See Ciona intestinalis HSP40 (BAB85846). Axoneme related protein. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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dnaj homolog subfamily b member 1 | GO:0005515 GO:0006457 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.02840.t1 | gi|156377740|ref|XP_001630804.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.02840.t1 | gi|530608957|ref|XP_005296130.1| | PREDICTED: dnaJ homolog subfamily B member 1 [Chrysemys picta bellii] | 0.0 |
aug_v2a.02840.t1 | gi|327264613|ref|XP_003217107.1| | PREDICTED: dnaJ homolog subfamily B member 1 [Anolis carolinensis] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.02840.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02840.t1 gcattagtccactagttgggtgatactaatggggtttagtcatcccttatctctaaattgtgggggcagttatccgttag ccctggaattaccgagactgttatccccaaaactacttatcttgtcatctctaaaactatcttagttatcccttatcccc ataagtcagttattccttatccctaaaattatttttccagttatcccttatccctaaaactccctaacagagtctccatg ttcagctcagaaaaaaagggatctaaatatcttttgaaaaggacccaccgtttcttcgtttcataaggtcaggagaggac acaatctcaatgtaaatcttaaccatttgcttcaatttggacaggtctctctgcaagttgaaagtgtaagtaaagttggt cactcgcttagtgtcagctacgctgagccattttaactttaaatttgttttatgctttgatgctaagttcctcatggggt acagtactcggaagattgctcctcacttaccttctagtaatttcggttgttttaccactgagccacggcaggctcgtgaa agtctgtacattttctattgcttcgactgaactgtctaaagaattgcatcgctgatcagcacatgttccgaacacctcta ttcgtgttctgttccctgtaaatcaccgatcaaaattatggttaaagaaaatgaatttggaagaatgttccacttgggaa gagtgtactaactgtataatattggacatttggacatttgaaatgacaaaattgaagccacgccccaccgccgagggggc aagtattacaggcctgaagtgtggattgaacacttacttcgggtggtggggggaggggtaggggttcttgttttagtttt attctgtcgaaatttctagattccaacacaaagaagttgatagtagcttatcgcaatcaactccttatttattgtttatc 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Protein
Protein ID | aug_v2a.02840.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02840.t1 MGRDYYVVLGVPRNASSEDIRKAYKRQALLFHPDKNPNNKDAEEKFKKISEAYTVLTDPNKREVFDRYGEEGLRNGGGGF GFFPDPFHIFRDVFGDDPESPFQDIMNGFTSDYSTLFSTSHCTSKFSGFKHFGDDDFEFPHPDPFKKPHVIQDPPIENAI HVSLEELFSGCSKRLKISRQVLSQNGEAAREEKILTIDIKPGWKAGTKITFERHGDQKVGTIPADIIFIVGDKPHQYFQR DADNNLLYTAKVGLKDALVGCLLQIPTIEGRVLTVQLNEIIQPGTQKRIPGEGLPLPKSPGQRGDMIVTFDVEFPTNLSM EQRQGLANFVP* |