Gene
Gene Model ID | aug_v2a.02967 |
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Locus | scaf1030 : 2274 ... 5420 : + |
To GenomeBrowser | scaf1030:2274..5420 |
Genes list of scaffold | scaf1030 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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pol-like protein | GO:0006259 GO:0016787 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.02967.t1 | gi|2072964|gb|AAC51271.1| | 5.0e-34 | |
aug_v2a.02967.t1 | gi|66734174|gb|AAY53484.1| | endonuclease reverse transcriptase [Bos taurus] | 6.0e-33 |
aug_v2a.02967.t1 | gi|754351485|ref|XP_011270708.1| | hypothetical protein CAOG_09021, partial [Capsaspora owczarzaki ATCC 30864] | 6.0e-32 |
aug_v2a.02967.t1 | gi|410930061|ref|XP_003978417.1| | 7.0e-32 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.02967.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02967.t1 ttcatgcccggctgggctatccgggttacttttgaaaatgagtcatttgcggctactattgtgagggagtcatctgttac tattgataatgttgtttgctatgtccggggggctgggcctagaccggagaatgttttggtttttcgctatcccttcgagg cggactctgctccgctgcgggaggagctttctaagtattgggaggtacacgatattcgcttcagagcttggactcacttg gataatgttatggatggtgccagggttgttcgtatgacgcggtctggccccatccctcgctctctgcatgttaacgatca tctttgtaaggcctggtaccggggaatgcctatttcttgcgatatttgtgaggggtctcctaaggcccagaattgcccgt ttaaagggaagtgtatgcgaagccgtcaagagggccatatgcagcgtgattgtccgaatgccccaaatgcctggggtacg gtgggtggtggtccgggttcgggcactgttgatcccactcccgctgaggtacactcggttactgcctcctcggtctccac cccgcctttgcttccccaaactagtggtaccattgttccctcctcggaggctgtcgaattgtgcgacgagggcttttccc ccgtctccccttccccccagtcccaatccatattgaccggtctagtgccccctgccccggaatcatccattggtactttt tcttcctccgcctctgttttgtcggatcccgactccattgaatcttttaccactgaaattgaaaataatgataattgtat ggacatggatactcaggatagttgttctatattaagtaatgatggtaatgataatggccaaagtgcccacgttcataatg ataatgataatggtttgagtgatagaatgaatattaaacaaagtattgatcatgtaaagaatagtaacttggatccaagt aatgatactattgatagttgtactcaaaatgatattaataccagtaatgacgaacctagtaatagtaatagtaatagtaa tagtttggctaccagtaatgacgtaccaagtaatagtttggcttctagtaataagacttctggcagttcggtctcgggtg gccaagtctactggcgctcgggtaaaatctcaggtttctggttcctcctcccccccccctgtgcggtctagtcctcgggt tcagtcccagagggttcgtggtagacatatttctgatgctgcggctgttgctgccctttcttctgtttctcgttcagttt caagttctgagcgtagagctctccagcgtgtttttttctaaaaagtaatgtttgccccccttcttaccttaatggctctt tctttggtctcagtcaatgttaatgagctgagggatgctgacaagcgccttggttttcttcagtggctgtcgcatcactc accttcggtggtgtgtctgcaggagacgcatgctctttcttttgatgagctttcccagtggttctcgccgtttggttatt tgtgtcttggttctttcggttcgtcgcattcgtgtggtgttgcaattttgtaccggcctgttctttcctgttccgcactc tgtgatttcgatggtcgctttgttcttggggaatttacttttcgtgactctgtctttcgtgtagcctgctgttatgctcc taatcgtaatcctgaccgtgacgctttttttcatcgttgtattgattccattgacccgtctgttcctactctcttgtgtg gtgaatttaataccgttcctgatcgtttcattgaccgtcgtggctcctgcccttttgatacttcccgcgagagttccaac ttgttgtctgtcctccttcgtgactgttatgtcgttgacatttggcgtcttaagcatcctgcggtgtctggttttacatg gtccaggagggatggctccttagcctcccgtatcgatcttgtcgggtgcccttacccctggatctcctttgtttcttctg cagacatactaccatgcccttactcggatcattctgcgctccatctctcttggtctctttcgcctgtttccccccctggc ctaggcttctggaaattaaatacgtctattttgtcggaggacagttattttcagttaatttctgatttttggttttcatg gcagcaacgtcgtcagcatttttcttccttgcttaagtggtgggaggaaggaaagtctcgtattaagggtttatcaatta aatattgtaaaaatcgtaataactgtaaatcattgaaacgttctattcttaataatttagcttctcatcttaaatctctt gttgactctggtcgttcttctctccagcatatttataacaatactctttctcggcttaaagctcttgatttggagatcgc tcgtggtttacagactcgctctcgtatcaaatgggttgaggagggggaatcctcctctgctttctttctgcggttggtca aaaagaactctgttgatcggaatatcacggctctgagggccgacgacggctctgttatttcggacctggaaggtttgtcc acgcttctctgctcgttttatgctgaccttttctcttcttctccttgtgatcctgttgcgcaagccgctctgctctctaa tgtttctgctaggttgtctccagctgaaagtttagtttgtgagggtcctctcagtcagggggagtgttttgccgccctcc agggtatggctcgttgcaggacccctggctgtgatggccttcccatggaattctatcttcgcttctggtctgttcttggc gctgatttggttcttgttcttaactctgcccttacctctggactcatgtctcgctctcagcgtagtggtattatcaccct ctctttcaagaagggcgatcgtcttgacccccgtaattggaggccaatcaccctgttgaatgtcgactacaaaattgctt ctccttctttttctgctcgtcttcttaaagtccttcattctcttgttgctaaagatcagtcttgttgtgttccggtcgtt ttattggtgaaaatgttgcttttattcgtgatgttgttgactattgttctttgaccagtactcctgctgcgttgatttca ttagaccaagaaaaggcattcgacagg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.02967.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02967.t1 MPGWAIRVTFENESFAATIVRESSVTIDNVVCYVRGAGPRPENVLVFRYPFEADSAPLREELSKYWEVHDIRFRAWTHLD NVMDGARVVRMTRSGPIPRSLHVNDHLCKAWYRGMPISCDICEGSPKAQNCPFKGKCMRSRQEGHMQRDCPNAPNAWGTV GGGPGSGTVDPTPAEVHSVTASSVSTPPLLPQTSGTIVPSSEAVELCDEGFSPVSPSPQSQSILTGLVPPAPESSIGTFS SSASVLSDPDSIESFTTEIENNDNCMDMDTQDSCSILSNDVNVNELRDADKRLGFLQWLSHHSPSVVCLQETHALSFDEL SQWFSPFGYLCLGSFGSSHSCGVAILYRPVLSCSALCDFDGRFVLGEFTFRDSVFRVACCYAPNRNPDRDAFFHRCIDSI DPSVPTLLCGEFNTVPDRFIDRRGSCPFDTSRESSNLLSVLLRDCYVVDIWRLKHPAVSGFTWSRRDGSLASRIDLVGCP YPWISFVSSADILPCPYSDHSALHLSWSLSPVSPPGLGFWKLNTSILSEDSYFQLISDFWFSWQQRRQHFSSLLKWWEEG KSRIKGLSIKYCKNRNNCKSLKRSILNNLASHLKSLVDSGRSSLQHIYNNTLSRLKALDLEIARGLQTRSRIKWVEEGES SSAFFLRLVKKNSVDRNITALRADDGSVISDLEGLSTLLCSFYADLFSSSPCDPVAQAALLSNVSARLSPAESLVCEGPL SQGECFAALQGMARCRTPGCDGLPMEFYLRFWSVLGADLVLVLNSALTSGLMSRSQRSGIITLSFKKGDRLDPRNWRPIT LLNVDYKIASPSFSARLLKVLHSLVAKDQSCCVPVVLLVKMLLLFVMLLTIVL* |