Gene
Gene Model ID | aug_v2a.02999 |
---|---|
Locus | scaf1041 : 1704 ... 6340 : + |
To GenomeBrowser | scaf1041:1704..6340 |
Genes list of scaffold | scaf1041 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 20-28 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 20-1. This gene model contains Rapsyn_N, TPR_1 and TPR_2 domains. |
mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.02999.t1 | gi|156386824|ref|XP_001634111.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.02999.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.02999.t1 agaaatggataaccaacacagaagaggaagaggctatatcaaacacggtagagatttccagttatgaatgacattgaaaa agccattgagtactttaaaaaacatttgacaactgcaatacaaaatggtgatcggcaccgtgaagaaggagcctatagca gtctaggtaatgtttaccagttactgggtgactatcgagaagccatccagtatcatggaaaacatttaaaagttgcaata gaaattggtgatcggggcggagaaggagcagcctatggaaatctcggtaatgcttacaagtcactgggtgactatcaaaa agccattgagtatcatgaaaaacgttcgaaaattgcaatagaaattggtgatcggggtggagaaggagcagcctatggaa atctcggtaatgcttacaagtcactgggtgactatcaaaaagccattgagtatcatgaaaaacgtttgaaaattgcaata gaaattggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacgccattgagtatcacgaaaaacatttgaaaattgcaatagaaatcggt gataggggcggagaagggagaagttatggaaatctcggtaatgcttaccagacactgggcgactatggaaaagccattga gtatcatgaaaaacatttaaaaattgcaacagaaattggtgatcaggccggagaaggaacagcttatcacaacattggaa cggcattcttttttcttgaagaaactgaaaacgctgtgaataattttgtttccgctgtggatgtcttcaattccttgaga tctttattgaagtctcaagataactggaaaataaactttcgtgagctgcacgaagagacgtacacttttttgtggatgtc ttttctaagaattaaaaagatcgatgaagctttgtttgcagctgaacaaggacgagcgcagactttgtctgataatttgt tgcttcaatataaacttaattcatcctcatcatctgccacaattgacacgaaagagacaatattacgcctcttcacaaag ctttcttcaccaactctttttctagcaattgaaggctttacgaccaacatctggtttctgagaaggggaatgaaaactgt ttttcggcaagggaggctggagggtgatagaagagagaaacatcctttactcgccttactgcaatcatctttagaagaaa tgaaggccgaagaaccaaaaagatgtgaagatcgcacatttgatggaattgaagatgaatgctcgtttagcataggagtg cggggtgaagaagttgaaaaaccagcatcgtcgtctttagataatccctttcagccattttatgatgctgttattgatcc aattcttgacatgcttgaaactcaagacgacgagttggtcatagttcctgatggtgcgctgtgctttactccatggtccg cagtttttgaatcgattaggattcgcattgttccatcactgaccacttatcaagtgatcttaagtgtacccgaaggacat cacaagaagcatggggcgcttttggttggaaatccctgcttaagagagttgaagaaacccttgcatgacttaccatgtgc tcaaaaggaagtagaaatgattgcatcaattttcaagaccacacctctgacaggaatacatgcaacaaaagctgaagtga tgaaacggatgtcgtcagttagcttaattcatattgctgcccacggaaacgagcacactggggaaattgctttgtctcca aaccctggatggtcttcaaagttccctcaaagaaaggattacattttaaaaatgtccgatgtgcaggctgccaatcttcg agctcgtcttgtggtgctaagttgctgtcacagtggacgaggcagagtcttgaagggtgagggtgtggtcggtatcgcac gtgcctttttggctgctggtgctccttctgtgttggtgaccctgtgggcagtagatgacgaagctaccatggtgttcatg aaaagtttctaccagcacctgaaggaaggaaaaaccgccagtgctgctgtccagcaatctatgaagttccttcgtgaatc tgagcagttttctgagatgaagtactgggctccattccaacttatcggagatgacgtcaagattgaattcgaggaggatg atgacgtcaaaaaatgagaagaataagttttgttcagtttatttgtcagtatactaaccggtgtaataggtttctctggc tgtcttactattcggtaaagccatgtaacagaacagttgcgataatgcgcaatggttttgtcagccaaatatagactctt gctacagcaaggcagatgtggtaaagacacactcaatcggactgagttgaggtaatgttagtcataaggaccaacta |
Protein
Protein ID | aug_v2a.02999.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.02999.t1 MNDIEKAIEYFKKHLTTAIQNGDRHREEGAYSSLGNVYQLLGDYREAIQYHGKHLKVAIEIGDRGGEGAAYGNLGNAYKS LGDYQKAIEYHEKRSKIAIEIGDRGGEGAAYGNLGNAYKSLEIGDRGGEGRSYGNLGNAYQTLGDYGKAIEYHEKHLKIA TEIGDQAGEGTAYHNIGTAFFFLEETENAVNNFVSAVDVFNSLRSLLKSQDNWKINFRELHEETYTFLWMSFLRIKKIDE ALFAAEQGRAQTLSDNLLLQYKLNSSSSSATIDTKETILRLFTKLSSPTLFLAIEGFTTNIWFLRRGMKTVFRQGRLEGD RREKHPLLALLQSSLEEMKAEEPKRCEDRTFDGIEDECSFSIGVRGEEVEKPASSSLDNPFQPFYDAVIDPILDMLETQD DELVIVPDGALCFTPWSAVFESIRIRIVPSLTTYQVILSVPEGHHKKHGALLVGNPCLRELKKPLHDLPCAQKEVEMIAS IFKTTPLTGIHATKAEVMKRMSSVSLIHIAAHGNEHTGEIALSPNPGWSSKFPQRKDYILKMSDVQAANLRARLVVLSCC HSGRGRVLKGEGVVGIARAFLAAGAPSVLVTLWAVDDEATMVFMKSFYQHLKEGKTASAAVQQSMKFLRESEQFSEMKYW APFQLIGDDVKIEFEEDDDVKK* |