Gene
Gene Model ID | aug_v2a.04023 |
---|---|
Locus | scaf1479 : 66506 ... 76088 : + |
To GenomeBrowser | scaf1479:66506..76088 |
Genes list of scaffold | scaf1479 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
hiv tat-specific factor 1 homolog isoform x2 | GO:0097159 GO:1901363 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.04023.t1 | gi|156362084|ref|XP_001625611.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.04023.t1 | gi|221119146|ref|XP_002158619.1| | PREDICTED: HIV Tat-specific factor 1 homolog [Hydra vulgaris] | 1.0e-36 |
aug_v2a.04023.t1 | gi|198414021|ref|XP_002128481.1| | PREDICTED: HIV Tat-specific factor 1 homolog [Ciona intestinalis] | 3.0e-36 |
aug_v2a.04023.t1 | gi|70569833|dbj|BAE06485.1| | Ci-HTATSF1 [Ciona intestinalis] | 5.0e-36 |
aug_v2a.04023.t1 | gi|583979275|ref|XP_006784971.1| | PREDICTED: HIV Tat-specific factor 1 homolog isoform X2 [Neolamprologus brichardi] | 4.0e-33 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.04023.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.04023.t1 caataaccgtagagttaaaatgggttgctcataagtttttattcacactgagagaatgagcggttcaaatgtcaaggatt ttttagaagagctcaaagaacaagccaagagtgcgggatcgcgcgatgatgataatgaaggagcgacctatcttgatccg tccgatggaactgtgtatcagtgggacgctgaaaagagagggtggtttcctaaggtttgaatcattgtctgatcaaaagt cctgttctttaatgtttttaaaagctacatgtagcccacgacgtcaaaaaggtttgatgttttcagcggttcccagttca tctttgcctaacgggagcaatttcataataagctgtcatattcattttgatgatatggtggcacaagatttcatgttgaa aacatgaaactcagccggctactggtgccaaaacgttgagggcagactgaaaaacagtgtgtggtttccttgcagtcact tgttttgccaaaatagcttctttacaaggaggcaaaaattaattaggaatgcagtaactgtccactgtcacactcagacg gaatcaaaagtccccttacggtaaacaagttgccaaggacaacagtattttgggcagatgttaaactgaaaaggaacagc tagaggcaggcacattgttaaccactggcacatttgtttggcagggaaaagttttaaaaggttgggtgagccctagggag tcaggctggcatagtggtcatcaatcacacctcccctgtctacagtcatgtatgtgtgttgagtttcagttgatttcaac ctgacttgtgggttttctctgggtactcctcatcaaaattgactcatgccgacacgagtctctttctccacaactttctt tacagtaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatatccattattattataattta gtgaagtgaatctgtaataaataacgctataaataaatgtggcacaacttaaagggcaacaagtttattagtccttgacc attactgttcaacctcattatctggatttgttgattatccggacttgcttctctcttctcaaatattaatctaatcatat tctgtgtccgcagcagaactttttttctttcaaattaattaacgaaactctgttgcaaactgaatttgtttcacaacaaa gcacaaatctgtatgcgtttcacaccctaactaatacaatgcatttcactgggctctcattggctccgatttgctcagtt gctgacagacatttcacttaagccataaaccgttattggtttccatatcgttgtatctgttgtgtctgnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatagtcaggtatgatcagtaacaagactcgctgtttttttt ttcctctgtattaaagcttaacatgaccttgtacaccttattccaaaatggcagtcaataaattattctcttgtttgcat gttaattagccctatttgcctcatcagcatgtataacgaagaaaagaattttgaagtgaaaaagaggaaaagagggctaa taaatttgcaaacaaaaggattattggccaccattttggaataaggtgtattatgatctgacttaatttgtgaaactaag gcataaaaaatatatttctcaagtctacaacggtctaggaatttgaaaggaggtatttttcagcaataaaatattccatg gccaaaacttaaaagagaactaattaaaatattaatacaaaatgaatatgttattgctcattttgacatatgtattgtgc ttttctaaattaatacacaaaaccactctacttttattgtttagatccaagcccaaggtgaacaagcaacagaactcaag aaaaagaagcggaaagtggaagaaggtataatcttagctttaatttaagtgtattgtagagacttacaagtgttctctgt ttgtattacaaagtttcttgtgtttgattgctattgcttctatgtgtaatatcttgtctatcccaatttttttattcagg ttggtttgaagttgatggtaacaaaaatccaaatgtttatgtttcaggtgagagtgtgtgttagtctcttatgctctata gtgcagttatcaaatcagagggtttccctcttcaaatgaaacaggaggtgaatttcggtacccatttgatcaccagtttg attatgtgacttcgttgcataaggaggtcgggtgccttcgtcgcatatggaagttgcatgccaaggaacgtgggggctgg aactgctgaccccaaatccaagtagctagaacacctaagagcctgccctacttgcaactcagccatgagcctcacctgcc aggaaaaacctgccccagccccagccccagtacatgtgactatgaacttgaagaacagtagtaagactttaagactatga aaaaaagggaacaaaagggtggggagcctagcaaaggcaagctacatgaaaacaccctgtacgctgagcacagtaaggct acaagctcgtgcaatggcactcgcatcaccccccgggggggggggggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggtgccaaggaacatggggactggaactgctga ccctgatcccaagtagctagaacacctaagagcctgccctacttgcaactcagccatgagccccacctgccaggaaaaac ctgccccagccccagtacatgtgactatgaactggaagaacagtagtaagactttaagactgtgaaaaaaagggaacaaa agggtggggaggctagcaaaggcaagcacagtaaggctacaagctcatgcaatggcacttgcatcaccccttcaagacta ccactgacccactcccagtgattgtcaaaaagccctggagccacacccaacacagtaatgcaatgctgggaaatgccaca acactataggcctactagcagaccacactgaatgcacacaaacaccaagagtatgccgagcacagagaagactagcccct gatcgctaactaagataaattgcatttaactccatttagttaccagtaactgcgctctttacagggagcaaaagttttcc tgctgaaaaggaagaccctgaaatcctcatttctactttttctcaagcctcaattttttcttatcaaatacaattctcaa agaagagtgcttgagataattcattatttgttattgtcatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnactgtatttattataataatataggattaccattggatatgacagatgaagagtttattgaaat gatgagcaagtatggtattattatgcaagatcctgatacaggtttgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnactgtatattaaatttgctgtttcatgtcatgtaaatgatgccttttgcagtgaaattcaggttcaagttaagtcatg atcaaccactgccagtttgaattccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggagatcaatttgctcgagatttttttc aaagttgcatttacatattttggaactgaatttgcatcaaacgatgtcctggttatctgttcttttttcctcagcagcaa agcccagatttgtgcctctccttgcctgctaggagaggcctctaaccttgaatttgccgtgttaataatcagcacaaaaa tagattctgtaactgattatttggtcctgcagtgtggtcactcagttttctcattgataaacacagagactgtgacaaaa gaaagcacgcttcaattcatgtttaaccagaaaagtaggaagcaatgcgtttggaaggctcttaaccaaaactttgaata gcggttgaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaccaagaacagatgcttgcatataa atattttatgaacaagtctttgttttactaatatttaagtggatccaaagcgataaaaattacacacaaaacctagatga aacgacgatatcatagtcagtcatttttttcactatcgcagggcgcaatccttatgttaataaggnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaccagactgcnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnngcagatcaattttctagagactttttgaaagttgtattcgcatattttggagctgaatttgcatcaaacc atgtcctggttatgtgttttttttccctcagcagcaaagcccaaatctgtgcctctccttccctgctaggagaggcctct aaccttgaatttgccgtgtcaataatcagcacaaaaatagattctgtaactgattatttggtcctgcagtgtggtcactc agttttctcattgataaacacagggacagtgacaaaagaaagcgcgcttcaattcatgtttaaccagaaaagtaggaaac aatgcgtttgcaaggctcttaaccgaaactttgggtagcggttgaatcaattcaatttcaattcaattttcagttcaatt aaaatttaatcaaccaagaacagatgcttgcatatatgtattttatgaacaagtctttgttttactaatatttaagtgga cccaaagagatacaaattacacacaaaacctagatggaacgaagatatcatagtcagtcattttttttttactatcgcag ggcgcaaatccttatgttaataaggcgttgctgtctgacagaaaaatgtcatggaacctgttttttgtttttgttgtttt tcgtttttttagattactagattgggttgacagagacacaaggaaaaaacaagatagaattgttgtatttaaaaacgtgt tcgatgcagaggcatttgaggcaagtgtacttgccaaacattaaattaataaattaattcaaatttgtgaaaggattctt tcacctgacactcacctggattgtttgttgatttccttcaagaacttttcaaatttaatcttgcgtgaaattattttgaa ttctaataatttcatttaatttttttccctcttagaaaaaccctgtgttagtcacagatatacgggatgacattaaaaga gaatgtgaaaagtatggcgaagtcaggaaggtgattgtatttgatgtaagtattgccctactcaaaaattcaacttgagt taaatcttgtcaattgcttttgccattgtcagttgttattgctattgctaatactgtttggtatgaaaacttccttgcga aaaactttttaatggaagtatatacatatagctcaatgtgtgagtttggttctttattgcatgaaatgccgcgaaaattc tttgtgttcaagtcattgtagagctcgagatcaaaaggatgtttttatttgataattccagcgtaacgaagaaggagttt gttcggtcgcgttttccgcgtttgaagcagcagatgcttgtttatcggtgagtttgcatcctttttttttttcgtgaaaa cgattgagcgctccaaaataccttaattgttgcgtagccaatcactgcttagtctcaagaaaattggtttcctaataggc cttttgcaactaacgatcacgtggtacaaaatccgccatgttggagggcaagctcattattattcccgcactgggacatc aaagcaaaggcaaatcaaacttcactggttcaggtctctttgttttaatgtcccagtgcgagaataataatgagcttgcc ctccagcatggcggattttgtaccacgtgatcgctagttgcaaaaggcctattgaagccgagaaataaggagaaagtaat tgaatttatttcgaaacattggactcccattttatgcaggtaatgaatggccgatggttcggaggacgaagaattacagc tgaaaaatgggatggtgttacaagttacaaagtggaggaaacagaacaacagaaagaggaacgactaaatgagtgggaaa gatatctggcgggagaattagattaaccctatagctccaaaaatcaggtatatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnncgactgactctttgaaccacacataggtattcaaagaaaaatgtccaggaaatacggaatgtttttatttccacttc aattattgaattcggaaaccaatgagattgaattttgaagttcttgttgaagataagaaacggggttccattccgttcgt ttagttgaaaaaaaaaaaacagctgtcggggctttccttatgttctgtatttgactttctgtttatgtgtcagggtcgtc gagggttgtcatagatgatggttagcaattcgccaaacttgtgattggacagagtggtcttagccagactgtcaatttca cttttatcaaggacagcgttacgtcataaacacttgccttcttctgctacagacattacaacgtaaaccaagtggagcat ttcttgatttgcgaacataaaaacatttggcagcactttttaaaatgaaaccgtgggatctat |
Protein
Protein ID | aug_v2a.04023.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.04023.t1 MSGSNVKDFLEELKEQAKSAGSRDDDNEGATYLDPSDGTVYQWDAEKRGWFPKIQAQGEQATELKKKKRKVEEGWFEVDG NKNPNVYVSGLPLDMTDEEFIEMMSKYGIIMQDPDTDWVDRDTRKKQDRIVVFKNVFDAEAFEKNPVLVTDIRDDIKREC EKYGEVRKVIVFDRNEEGVCSVAFSAFEAADACLSVMNGRWFGGRRITAEKWDGVTSYKVEETEQQKEERLNEWERYLAG ELD* |