Gene
Gene Model ID | aug_v2a.04026 |
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Locus | scaf1479 : 107826 ... 119412 : + |
To GenomeBrowser | scaf1479:107826..119412 |
Genes list of scaffold | scaf1479 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-DHC-f30 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See chlamydomonas DHC-alpha (AAA57316) and DHC-gamma (AAA50455). This is probably a fragmented gene model.This gene model has DHC_N2 and AAA6 domains. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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dynein heavy chain axonemal- partial | GO:0000166 GO:0006928 GO:0017111 GO:0030286 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.04026.t1 | gi|564242989|ref|XP_006278283.1| | PREDICTED: dynein heavy chain 14, axonemal-like, partial [Alligator mississippiensis] | 0.0 |
aug_v2a.04026.t1 | gi|156387528|ref|XP_001634255.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.04026.t1 | gi|676491978|ref|XP_009065770.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_133189, partial [Lottia gigantea] | 0.0 |
aug_v2a.04026.t1 | gi|390366276|ref|XP_796434.3| | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.04026.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.04026.t1 gatagaaatgagctggtcccggtcctgtagatgctcaaactcttgtcaaagatgagggtagtaagaccctgcactatgga agatgttctgcaaaagcatgttaaggagccaactatcgcatggaatttgattcagtcagggcagactgtgaagaaacttg aaactgctgattacaacattccgcctgccgcaggatacaccagatttgtttgtatttctgatacgcataacagaacagat aggctcgaccatcccatacccgatggggatgtcttaattcatgcaggagactttacaaactatggaacacgggatcaagt ggctcatttcaataaatttttgagcactttaagtcatccgtacaaagttgttattgctggcaaccacgacatttcgtttg actttgacagctacgactctctgtggtcttacttttcaaataagagagaagacccaaaagaaattaaggaagaactaacc aattgtatctatttagaagacgaggaagtagaaatactgggatttcgaattttcggctctccttggtatgaaatttatca cgagagagcgcccgtaacttatatttggatttttggttctaaatttgtcaaaagtgacccacattgcagttggctcttct ataggaacaacaattattgaaatcatgggtataaccggcacattcgatccttgacctgagacaacatggccagaactcta gttctagaactgtaacaatattattatataataccataattattgtaataatcataactatatcaaaattattgaatctg atagtagccctgatttgagcattaattggacagttgcacacgtcatgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 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taagagtatcctagcagacctgttccctggtatggacccgcctggtgcagacaacaagttacttaag |
Protein
Protein ID | aug_v2a.04026.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.04026.t1 MEDVLQKHVKEPTIAWNLIQSGQTVKKLETADYNIPPAAGYTRFVCISDTHNRTDRLDHPIPDGDVLIHAGDFTNYGTRD QVAHFNKFLSTLSHPYKVVIAGNHDISFDFDSYDSLWSYFSNKREDPKEIKEELTNCIYLEDEEVEILGFRIFGSPWYEI YHERAPPHLRKCFGNIHQLEIIRQPHAPAQVKNMTSEEGETVQLPKTLRARGTVESWLYNVELAMYETVKMHLKKCLSDY GTTYYKDWVLAHPGQAVLTVAMGKQCLVFNCSEGLDYKMMGKFFSGLAQSGSWFCFDELNRIDVEVLSVIAQQLHSIKTA KDNRVTRFLFEGRDIKINPNCGVFITMNPSYAGRVELPDNLKSLFRPVAMMVPDYGYIAEIILISEGFTAAALLSRKVVN FLDMESDNIEEEESRLVINAVKDANIPKFIAEDIPLFKSILADLFPGMDPPGADNKLLK |