Gene
Gene Model ID | aug_v2a.04439 |
---|---|
Locus | scaf1636 : 23610 ... 26955 : - |
To GenomeBrowser | scaf1636:23610..26955 |
Genes list of scaffold | scaf1636 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
probable sucrose-phosphate synthase 4 | GO:0016740 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.04439.t1 | gi|672126043|ref|XP_008786458.1| | PREDICTED: probable sucrose-phosphate synthase 4 [Phoenix dactylifera] | 5.0e-08 |
aug_v2a.04439.t1 | gi|357403982|ref|YP_004915906.1| | 3.0e-07 | |
aug_v2a.04439.t1 | gi|659081182|ref|XP_008441196.1| | PREDICTED: probable sucrose-phosphate synthase 4 [Cucumis melo] | 3.0e-07 |
aug_v2a.04439.t1 | gi|470107866|ref|XP_004290259.1| | PREDICTED: probable sucrose-phosphate synthase 4 [Fragaria vesca subsp. vesca] | 3.0e-07 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.04439.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.04439.t1 cgagaagctctgaagcagttattttgtgaggtggatcttgtgctgatgccgtcaagaaccgaggggtttggcttgacagg gctggaggctctgtcagctgggcttcctgttattgtcagcaaaaactcaggttttggagaagcactggggagcttaccat caggctcttttttcgtcattgactctgaagatcacagtgcatggatagaggccatgaaagatgtgtggaacaaagacaga aagtcacgacttgatgaggttaaggctttacgaggttcctatagtgaaagatacagttggtctgaacagtgtaaacatct tattgaaaagatgttcaaacttgttgacggtatgaactatgtttagattctacgagcttgttgataaacttggtaatttt caagacatttaaaaccaaaaacaaaatgcattattctgaagcactgttttgaaaaaaaaaaacaatttctgtcaaagttg gatcaatgttgtgcagtggttgtgcagccacatatagtttattgcgctgtttgcaaggctgtgtacgggagacatatttt gtaagaaatttgataaggagtgatgtaactcaccagaatcttaatagcattatgatggactgtcattactgagctcatag atttgatttgtgagtggaactctgaaacattttttagctgttccttcacccgtggtcacgaaaccattttatcctaacca tttcaaattccttgcttgtatagctgagcctgagatcacagcactggcagttggagcaagggagctgaaactgactgaga acttcacaggtatactagggaatggtttaaaggttgcagcttgttgttgtagtagtatgctatacttgatcatccnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctccgggaactccggtttg ccctctcctcaaaaaccaaaatttaacttgattgtgttaattgttaatttcagtttcagtgtccccaattagtgcttcag cgctagaacgactagttccttaaattaagtcccttaagttccttattgtcgttagactattctccacttgttccacccaa aacgaaaaaggaaataattgaaaagaatgagattgagcagcgggcatatacagtacgtaagatacagcgattaaattagt accttgattggaaaagatatctgtgtgatttgagccctgataaggactgtttttggccaatgacgtttcgacaacctgtg cggaaaaccatctacagagtcaagtgaccctggtgagcgatttgattggtcaatagatagagtagccgttggtaaacacg tgatgtgattgcctgtgaagacgtgttcggcgattggttttgtaaatagatgggttgcaagatgagtaataaacaatgtt actgtttgctgttgagtaatcgtttgtaaggtgcgggaagaagttgacaaccacttagggcagtttgttctgagttagta aaccagctttcgagtgtaattcgttgatagtagtcggtactgtaggtgacgcacgtggcagagtcccagtcgatagtgtg gcttgtttttaaggggtgaacatcggtttatgtgcaactcgcatgttgtaaggtcgtattatgcgtgctatggtttcgga ggtccctcgtatgtaaggtatagtggctgttgcggtgtatttaacaattattccttgagcccgaatatgtgctctgaatc tatagcccatgaggccgaaggccgaatgggctattgactcagaggccatgagagcgagaggaataattattttagaaaaa aaaatatcgagacaaaacgtctttcgcaagtgaaaactagactttaatccttttttgccgacaaaacatttcaaatatgg cgggcgcttttcgctactagtaagcaatcaatcaaccaatccggcaacaactttgagtatctaatcttctatcttgccct caggcccacttatcggggacactacttaatttacttattaatgataaatatatatacataatacta |
Protein
Protein ID | aug_v2a.04439.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.04439.t1 MPSRTEGFGLTGLEALSAGLPVIVSKNSGFGEALGSLPSGSFFVIDSEDHSAWIEAMKDVWNKDRKSRLDEVKALRGSYS ERYSWSEQCKHLIEKMFKLVDAEPEITALAVGARELKLTENFTDYSPLVPPKTKKEIIEKNEIEQRAYTVRPLIGDTT* |