Gene
Gene Model ID | aug_v2a.04531 |
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Locus | scaf1668 : 53831 ... 57827 : + |
To GenomeBrowser | scaf1668:53831..57827 |
Genes list of scaffold | scaf1668 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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60s ribosomal protein l13 | GO:0003735 GO:0005634 GO:0005840 GO:0006412 GO:0044446 GO:0051726 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.04531.t1 | gi|156385450|ref|XP_001633643.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.04531.t1 | gi|221090584|ref|XP_002154424.1| | 0.0 | |
aug_v2a.04531.t1 | gi|195996703|ref|XP_002108220.1| | expressed hypothetical protein [Trichoplax adhaerens] | 0.0 |
aug_v2a.04531.t1 | gi|224064566|ref|XP_002195773.1| | PREDICTED: 60S ribosomal protein L13 [Taeniopygia guttata] | 0.0 |
aug_v2a.04531.t1 | gi|318087604|ref|NP_001187042.1| | 60S ribosomal protein L13 [Ictalurus punctatus] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.04531.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.04531.t1 aactatcgatctctttccttgcgttgtggtgaggtgttgttgtgtggaggttagtggtggaagagaatctccaaaaattc tcgtgcatcgtatcatccctgtcgttactgttgtagtcttttgagtttttgaagatttgttggtcgtaagattgccctat ttaagtgacgaatgaagtcgacacgtattacctgaccaattttcaaagacacctagaattttatctattttttgtggtaa agaaattctctcaatatgtccagtaacatcgattgcaaacaattttctcagtagcagcgaacgtgagtttgtgtatactc tcgtcgattatccttttcaaagtctttcttcatgacgaccgtgcagtatttcgttttcaacctgatcttatttgagattt atttgcgggaagaaagtctcggaagttgatttattgcatgatttgaccaatttgtaaaaaacagtattggtgaaattgtg tcagtaatattttattgcacatgtagcttaattccagtgattgtcacaatgggaatttttttttccctaatgatataggt tttgtaaaacctcagccttttccacaatggctcccaaacacaacaatatagtgcaaaacaaccatttccacaagaagtgg cagaattatgtacgtacttggtttaatcagccggggcgtaagaagcgtagacgtctaaatcgtaagaagaaagccctgga aattgctcccagaccagttgctggccctctgcgaccaattgttcattgtccaacttttaaatacaacagcaaggtcagag ctggacgtgggtttactctagaggaactcaaggtaagttaaatgttcacgtactccttacaccagggccctgttatccaa agctgaataagctaatcttgggttagcgtacattttaattgctatttattactgctaaaggagggtttgccacaaaatgc attaaggcccattaagattataaatttcaaatttcttttcgttaaaacgttaatattttgaaaaatcctcccttaatggt aaataaataacaaatttttttggtaatccaggattagcttaatcaggccttgaacgactgggctcgctcagcatgttaca aatcgatcaaaatcgatgatcggaaagctagttgataagtaaatatttgttgatagttgtcaattgattagtttaatttg tctataaaaatcaatagtcaccaaatttttaggaaacatcgtcaattttgacattattttgtgggcttaacttcagcgac aaagacaattttgagatgttgtattaaaacaatggaagtgtagcaagtgtcaagtgctaataaatttgaattaatgtgga attatcagattgtgcattatttattcactctggaatcaaatggttacctgatttaccttggtaagtcacccctgctttaa aatattgtttgattaaaggattgtgtgtttcatctttcaatacttttcaattgaaatcattattgaaatcgatagaaccc gaactctaacaacaaaaattgattaaaatcaataatcacaacaaatcttatgttccattttgattgatttccaatatttg tcaattgattggtatcaacttttatcaacatggatcgatttttattgactatcacgcttatcgatttgtaacatcctgct tacacctgaggagactatttatcaagggtacacagttgagtactataacccagctacagattaaagaaattattgaggta cttttaggttgtgttttgtctgagcttgaccacaagatgacagaaatttcagtgaactgcattactatatacatatggcc tacttaatttttgttttcatttcagactgctggcatccctcgtaaatttgctcgcactattggcattgcagttgacccca ggaggaaaaacaggtcagcagagtcacttcaggccaatgtgcaaaggctcaaggaatacaggagcaaattgatccttttc ccaaggaagcccggcaaaccccaaaagggagacagtgcagtgagtttctttctcatccatttattgacaatgacaaggat gataaattatgatgatgaggaagtcaatggttacgataagtttgagattgcatcttcaattatatttgttttgagcttag aataaaatttgcatttcaaaataatatactataaatactttaagccaaggtaataatgaaaacaagtttaaaacagctga acaaacaagtataaaataatattgtatcttgactgtgtcctcataacacttgcttagtcttggtctataaacccaaacta aacttcaagcttagtttaaacttaagataaactgaaaaaaaagttaactaaactttatctatactgatttctcacgtaag tttaattacttttttttatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaatgctacaacacaaaagga aaaaatggaaatgctacactatttactacttagtactaatgcactaactgcaaaaccaaaggtaaatactttaaatcaag gaacactgttagaccataacactacaggtgtactatgatattgctattttctattagtatttaccaaatcagtggatagc aattttcactcattttgataggctcccgtaacttggaatatccatggatattcactgttttgtgaacggagagaaaagtg gcgtgtcgtttcgcgaaagtttcagaagaagaaatcgaagaagcatttttttatccatctgatttggtaaatactaaaac aactacccccctcagggtaggtgaagagtggtggatatatacctcgacgcttcgtgtcttggtatatctccaccactatt cacctcccctttgcgggtagttgtatattatgctattaaaaaaatttcctcaatgccagaagatgaagcaatgagatact tgtgctggcaatataattgcaccattttaggttaaggcttgatctaatactggtaaacttggtggttttaaattctattg ttaaaaaaaaaaggcaatgtggtaactaataattatattgtttgaagtgaggaatctcatcttaggacaaattcctttcc acatgcaccttgctagctgatgtcttcaaagaacagttaaaagggaatgcagctagttatgttgtgtgactgtaacatcg tttttcatttatggtcatgaggcctgaaatggttttgtttcaatatcattcattgtagcctgctgaacttgagaaggccg tgcaacttcaaggtccaatcatgccaatccaacgttctcatctgccaatcaaggctcgcaagatcacagatgaagagagg aaatttagtgtgtttaaacacatgcgtaaggaacgtagaaatgcaaggatggtcggcgtcagagcaaagaaggcccgcga aaaggctgaagaagaggccttctcaaagaaataatatgtgaataaatgttaaacttcatttgttgcaaatgagttggatt attcaaggggtttctttgctatgttttggatttgttcttacactttacccatttgtgggcctgcaacctcagctctcagt taggtccttaggtgtttttcctgcctgcaaaaatagcctgtgagcaggctgccacaacagctacctcttccaactcctgg gtgcctttagtgaatgttaaaaccgtaacaccgcctgtgttttggccatcatggtggccacattggtatcctaatgtaat ctgcaggcagtcgtttccaaaaagtaatgttttgttcattttaacaaaaagcaacattccttttccaatgatataaaaca catgttgtggaaagtgtggaatctttaacatcagtcacagccctcagattaaaggaaatcttattccaaatgttattcac ctcaaagacactggtttggcgtactggctttcaaaagtccacaatatctgttctggtagtcaactgctagaggagca |
Protein
Protein ID | aug_v2a.04531.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.04531.t1 MAPKHNNIVQNNHFHKKWQNYVRTWFNQPGRKKRRRLNRKKKALEIAPRPVAGPLRPIVHCPTFKYNSKVRAGRGFTLEE LKTAGIPRKFARTIGIAVDPRRKNRSAESLQANVQRLKEYRSKLILFPRKPGKPQKGDSAPAELEKAVQLQGPIMPIQRS HLPIKARKITDEERKFSVFKHMRKERRNARMVGVRAKKAREKAEEEAFSKK* |