Gene
Gene Model ID | aug_v2a.04837 |
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Locus | scaf1785 : 3856 ... 15216 : + |
To GenomeBrowser | scaf1785:3856..15216 |
Genes list of scaffold | scaf1785 |
Manual annotation
Study field | Autophagy |
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Gene name | ATG6-2 |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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beclin-1 isoform x2 | GO:0000045 GO:0000407 GO:0000910 GO:0001525 GO:0005634 GO:0005739 GO:0005768 GO:0005783 GO:0005802 GO:0005856 GO:0006995 GO:0007040 GO:0008285 GO:0016239 GO:0019898 GO:0030425 GO:0032258 GO:0034271 GO:0034272 GO:0043066 GO:0043548 GO:0044804 GO:0045324 GO:0045335 GO:0048666 GO:0050435 GO:0050790 GO:0051607 GO:1903599 GO:2000378 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.04837.t1 | gi|156388127|ref|XP_001634553.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 4.0e-32 |
aug_v2a.04837.t1 | gi|260819566|ref|XP_002605107.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_84223 [Branchiostoma floridae] | 5.0e-32 |
aug_v2a.04837.t1 | gi|676449970|ref|XP_009052226.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_226844 [Lottia gigantea] | 8.0e-31 |
aug_v2a.04837.t1 | gi|585685130|ref|XP_006820081.1| | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: beclin-1-like [Saccoglossus kowalevskii] | 8.0e-30 |
aug_v2a.04837.t1 | gi|115623737|ref|XP_786368.2| | 1.0e-29 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.04837.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.04837.t1 cagctggacaaactcaaaaagacaaatgtgtttaatagcacctttcacatatggtgagttagttgtttaggctaacctgc tgagtgtaaattacttcccagatttttgatgaaaccaaatgttgcagttttatatattgggttattgggttgcattctta actgggttcaaatttcctcaaccaggccacagttttcacaagattgcctagcactattttatgcacgaatgatttttcca ttggataattgagaactgcttaaaaatattttgatatccagctacctaatttgaagtattttcaattgcgactaagttta aatttctttaaccaggttaatatttttttcacaagatactcattttatattctaatcaactaagccccaagccacagttg attccaatcaaatgttcttttgtgtcaactcaaacgtttttctactttgcagctcaaatatttaccctctaatcaccaaa gtgtgagctcccgagttttcttaattttgagccctgcctaaactgtatctgtgtcaaaaataacataacatgttcattgc agttttcaagtgattgtatttatttactctttcctcaggcataagggccattttggaacaatcaacaactttaggctagg tcgtcttcccagtgtgccggtgagttgtagtttggttattaaatagtaagcagtatttcttctgcacccatttgcacacc tacgtggaaagagacaatgtggagtgaaagtttttgccttaggaatgtgataatgacagggcttcatatctgaaacacta aaagtttgtatcaaacaagctgatatgaaggatcaaattttccctgaagactcaacggagcttatgttttgagcattaag cctgtgtcagagtgaatcgtatctgaaaaccgccgacctaaccactgcgctattgtgcatccatgtaagtgtacatgcag 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Protein
Protein ID | aug_v2a.04837.t1 |
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Definition | - |
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