Gene
Gene Model ID | aug_v2a.06219 |
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Locus | scaf2292 : 11867 ... 16775 : - |
To GenomeBrowser | scaf2292:11867..16775 |
Genes list of scaffold | scaf2292 |
Manual annotation
Study field | Transcription Factor |
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Gene name | Adi-E12/E47 |
Description | Named thus based on BLASTP searches against NCBI nr and molecular phylogenetic analysis (NJ and ML). bHLH domain of this gene model seems to be partial. Predicted amino acid sequence from adi_EST_assem_4656 was therefore used for the analyses. |
mRNA evidence | adi_EST_assem_4656 |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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transcription factor 4 | GO:0000981 GO:0006357 GO:0007399 GO:0008134 GO:0030098 GO:0031981 GO:0043234 GO:0043565 GO:0044212 GO:0045595 GO:0045893 GO:0046983 GO:0048468 GO:0048523 GO:0048863 GO:0050896 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.06219.t2 |
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Definition | - |
>aug_v2a.06219.t2 cgattattagtgaggatggtgagtagtgactgctgcatttctctctggtttgttagtgatgttcacagtaggttgtaagc cgagagagaacaaatgtgtagttaaggttttctgttgagtaaacgttcttcttgaagtgtaggtataggttgcacggaaa cttttctgtgcagtttgttctaagtttgtgtaccagctttcaaagtctaaggcactggtaatagtcagtactaccaatca cagtacagaccagagcagtgctacattcatttatatatccaactagcacttgacactgaagatgaattctgctcaggatt ttgagacatcagtcaccaccaacattccttctcaggactcttttcctttctcacctggtaactcccgggctcaaaccaat ttccaataatagtattaatccctttatttaggtctcagtggatttagccgaacccagttgctctaccaataaaattgagg ggagtataaatcaaacttaatcacagagaatcaagtcaatttttggtttttggtgagaggggaaaacctgggaaaattag cctgaaagaatgggtgcaaccactttgtgtaactgtatgtataatgtttgggctgaagatagaggacaacagagaggtta ctttcattcagttggacaaaagaattgtttctttttttcttggtagctactcatagttctagggcacctgcatctggctc tcagactggagacacattaggaaaagctttagcatcggtaaggtccagattgagttctagttgataacatcaaggcaata atattgtcagctttaactgtggggtttaatactgcttatgatacctagataaccacccaacttagtacaagtgtcaccac aaattactgtagccttattcaaaaggccacacttactgatatatgcatgtaagctgagaagtgataagagtagggacaac ctatgattacacatgtcttgatttcaagtcttgtgcccttccccttggccatactgtcttacatttgtgcagaaatcaaa aataatagaacatattgggcttttgtagatttacccaactgacaatagtggatcatactcgtccaatccttcaacaccag ttgcatctcctcctccattggcaagtgttagcgaaaggccattatcaggtaagaaagaagctctgagtgataaaaagatt aaccttcatattgctgacattaggaaacagcggcctcttatgtactttgcatcaaaccaagaaatccttttattatgtac atgtatctgtcatcttagcaccatctgtgataaacattgagctgaaactctaaaggtctccttgaatgttttgcttgttt gccagtaaatcttgatggacttgcaatcattcccacttttctgtgttttgtcacttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattatacttaagttgctttctgctataagacgtctgtactgcaggct aagggtttaccggcttcaaggccattaagcttattattcctttgcggtataaactagaacttgaccgaggcctgaaagaa gcataaaatgaaacctaaacagcccataaggtcctatttgattcactctactcagttattatgcattcattgagctcgtg taataaaacgtttggttcactgggaacttgaggacaaggagacgaataggggcgaatagattcgggagccagacaaagtg cagaatattaaatttgccttttggctctgcagttggctccaaaatggacagtgctggggaaggctcaaaaagcagcaaag aagcctcgtccaagcaagacatgaaaaacaacgcggatatggatgataacagggacaccagggatttaatagtagatgac gatattgacgatgacaaattgatggatgacgaagtagaagagggaggtggtgggcgactcagagttgtacgcgagcagga aaggagatacgctaataatgccagagaaaggtacaaaaattacttttgaatataatagatcgatacaacatggtcattga agatagatctctgaaattgtgcatttgtcagtggccatatgccttggggcattactggcgatacttcaatattcttttgt tcttctgttactgcatcaacttccctttatgttatcattccaagttttaatgaggcaaacgtgccttttttgaaccgata gatagggttgtggtcgtaaaggcgttgtggtatgtttgcagacttttacaacaaggaatgagactgactgtcaaaagtct ttgggcagctattgtgtgacaataaatcaaagtaatagtaattttttttagcggaaagctaagaccttactcatagatga taattacgttcttagacaattatgttcagatcaaaacgatgttggaaaaaaaaacttctttgagggcaattgtttattaa tttaccagttgaatgggagcagtttacggtagtaatatgtacacggcaaaacaatcatgttttcctagttctgtacatat gagtgctgtgcaccttgccttaacaggttgagagttcgagacataaatggagccttcaaagaattgggacgaatgtgtat gatgcatttacagggtgacaaatccaactctaattctaaacagactaaggtgagacaaacggcggcttctaaccaactca aataaaatcataactctttattacaggatgagggttcgcgacatcaacggtgctttcaaagaattgggaagaatgtgtca attgcatttagagagtgacaaaccccagaccaaggtaaaatgtgatccaacaggtcattgtatcagtcagagttgtttga tggtggtcagagctggatatactgccatctcttcggctggaactgttgcttctttaaataccacctcttcatttgcatga tactcttttcatcgactccaaaggggcaa |
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Transcript ID | aug_v2a.06219.t1 |
Definition | - |
>aug_v2a.06219.t1 cgattattagtgaggatggtgagtagtgactgctgcatttctctctggtttgttagtgatgttcacagtaggttgtaagc cgagagagaacaaatgtgtagttaaggttttctgttgagtaaacgttcttcttgaagtgtaggtataggttgcacggaaa cttttctgtgcagtttgttctaagtttgtgtaccagctttcaaagtctaaggcactggtaatagtcagtactaccaatca cagtacagaccagagcagtgctacattcatttatatatccaactagcacttgacactgaagatgaattctgctcaggatt ttgagacatcagtcaccaccaacattccttctcaggactcttttcctttctcacctggtaactcccgggctcaaaccaat ttccaataatagtattaatccctttatttaggtctcagtggatttagccgaacccagttgctctaccaataaaattgagg ggagtataaatcaaacttaatcacagagaatcaagtcaatttttggtttttggtgagaggggaaaacctgggaaaattag cctgaaagaatgggtgcaaccactttgtgtaactgtatgtataatgtttgggctgaagatagaggacaacagagaggtta ctttcattcagttggacaaaagaattgtttctttttttcttggtagctactcatagttctagggcacctgcatctggctc tcagactggagacacattaggaaaagctttagcatcggtaaggtccagattgagttctagttgataacatcaaggcaata atattgtcagctttaactgtggggtttaatactgcttatgatacctagataaccacccaacttagtacaagtgtcaccac aaattactgtagccttattcaaaaggccacacttactgatatatgcatgtaagctgagaagtgataagagtagggacaac ctatgattacacatgtcttgatttcaagtcttgtgcccttccccttggccatactgtcttacatttgtgcagaaatcaaa aataatagaacatattgggcttttgtagatttacccaactgacaatagtggatcatactcgtccaatccttcaacaccag ttgcatctcctcctccattggcaagtgttagcgaaaggccattatcaggtaagaaagaagctctgagtgataaaaagatt aaccttcatattgctgacattaggaaacagcggcctcttatgtactttgcatcaaaccaagaaatccttttattatgtac atgtatctgtcatcttagcaccatctgtgataaacattgagctgaaactctaaaggtctccttgaatgttttgcttgttt gccagtaaatcttgatggacttgcaatcattcccacttttctgtgttttgtcacttggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattatacttaagttgctttctgctataagacgtctgtactgcaggct aagggtttaccggcttcaaggccattaagcttattattcctttgcggtataaactagaacttgaccgaggcctgaaagaa gcataaaatgaaacctaaacagcccataaggtcctatttgattcactctactcagttattatgcattcattgagctcgtg taataaaacgtttggttcactgggaacttgaggacaaggagacgaataggggcgaatagattcgggagccagacaaagtg cagaatattaaatttgccttttggctctgcagttggctccaaaatggacagtgctggggaaggctcaaaaagcagcaaag aagcctcgtccaagcaagacatgaaaaacaacgcggatatggatgataacagggacaccagggatttaatagtagatgac gatattgacgatgacaaattgatggatgacgaagtagaagagggaggtggtgggcgactcagagttgtacgcgagcagga aaggagatacgctaataatgccagagaaaggtacaaaaattacttttgaatataatagatcgatacaacatggtcattga agatagatctctgaaattgtgcatttgtcagtggccatatgccttggggcattactggcgatacttcaatattcttttgt tcttctgttactgcatcaacttccctttatgttatcattccaagttttaatgaggcaaacgtgccttttttgaaccgata gatagggttgtggtcgtaaaggcgttgtggtatgtttgcagacttttacaacaaggaatgagactgactgtcaaaagtct ttgggcagctattgtgtgacaataaatcaaagtaatagtaattttttttagcggaaagctaagaccttactcatagatga taattacgttcttagacaattatgttcagatcaaaacgatgttggaaaaaaaaacttctttgagggcaattgtttattaa tttaccagttgaatgggagcagtttacggtagtaatatgtacacggcaaaacaatcatgttttcctagttctgtacatat gagtgctgtgcaccttgccttaacaggttgagagttcgagacataaatggagccttcaaagaattgggacgaatgtgtat gatgcatttacagggtgacaaatccaactctaattctaaacagactaaggtgagacaaacggcggcttctaaccaactca aataaaatcataactctttattacaggatgagggttcgcgacatcaacggtgctttcaaagaattgggaagaatgtgtca attgcatttagagagtgacaaaccccagaccaaggtaaaatgtgatcca |
Protein
Protein ID | aug_v2a.06219.t2 |
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Definition | - |
>aug_v2a.06219.t2 MFTVGSTHSSRAPASGSQTGDTLGKALASIYPTDNSGSYSSNPSTPVASPPPLASVSERPLSVGSKMDSAGEGSKSSKEA SSKQDMKNNADMDDNRDTRDLIVDDDIDDDKLMDDEVEEGGGGRLRVVREQERRYANNARERMRVRDINGAFKELGRMCQ LHLESDKPQTKVKCDPTGHCISQSCLMVVRAGYTAISSAGTVASLNTTSSFA* |
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Protein ID | aug_v2a.06219.t1 |
Definition | - |
>aug_v2a.06219.t1 MFTVGSTHSSRAPASGSQTGDTLGKALASIYPTDNSGSYSSNPSTPVASPPPLASVSERPLSVGSKMDSAGEGSKSSKEA SSKQDMKNNADMDDNRDTRDLIVDDDIDDDKLMDDEVEEGGGGRLRVVREQERRYANNARERLRVRDINGAFKELGRMCM MHLQGDKSNSNSKQTKVRQTAASNQLK* |