Gene
Gene Model ID | aug_v2a.06360 |
---|---|
Locus | scaf2346 : 34496 ... 38034 : + |
To GenomeBrowser | scaf2346:34496..38034 |
Genes list of scaffold | scaf2346 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
u1 small nuclear ribonucleoprotein a | GO:0000166 GO:0000398 GO:0005681 GO:0005685 GO:0005730 GO:0005737 GO:0017069 GO:0019013 GO:0044822 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.06360.t1 | gi|339255862|ref|XP_003370674.1| | putative RNA recognition motif protein [Trichinella spiralis] | 0.0 |
aug_v2a.06360.t1 | gi|380024353|ref|XP_003695965.1| | 0.0 | |
aug_v2a.06360.t1 | gi|383847977|ref|XP_003699629.1| | 0.0 | |
aug_v2a.06360.t1 | gi|340726396|ref|XP_003401545.1| | PREDICTED: U1 small nuclear ribonucleoprotein A [Bombus terrestris] | 0.0 |
aug_v2a.06360.t1 | gi|759081436|ref|XP_011350572.1| | PREDICTED: U1 small nuclear ribonucleoprotein A [Cerapachys biroi] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.06360.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.06360.t1 tccttcttcgtggcgtggaggaagagtggtgcacaatctgccgaaaaactctctcaatttagaccatcagggcttcaaac tgcctcatttcacgactttcttttctccgtttttttctcggctgccattttcaccgttctgtgtcgagtttaggagtaca agatatttttgttgactcaggagaaagaacagagtactcacatttcttgacagccagcaactcctaaggataacctcacg atggaaaatccgccgaaccaaactatatacatcaacaacctcaacgaaaaagtgaaaaaggatggtgagccataattatt aaagatactgatgtgatagaaaaccgttaacttagcagaccttctgccttgatagacagctgtgcggaacatctgatcaa aatgaggaactatcttggttgttgcaataatagatgtatctccggttgtgtttcagaattgaagaagtcattgtatgcca ttttttcgcagtttggacctattttggacattgtggcgttgaagaccctcaaaatgagaggtcaggcttttgtagtgttt agagacttaaccagtgccacaaatgcactacgttcgatgcagggcttcccattttatgacaagccaatggtaagtgaaaa cctattttcccaaataacaacatcaggtcatgtggtatgtatagtttgttgttcggtggccagtgaaactgaatgcatga cataaacattgatccttctttttgtttgctttcaaatttaatcattttgttccataaacatcagagaattcaatatgcta aaagcaagtctgatgcagtatctaagttggaaggaacttacattcagcgtgagaagaagcccagagagaagagaaaaacc ccagaacaaggtaagtgttctcgtcaacttgagcattgggagttctctttacatatagatttgtgtgatgaaggtcattg gataaatacagaaaagatgttgctgaacgtccacttacaatataaacctagtatgactaatgaagatattgattcttttn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtaaaaactgtgaaacttcaactgcagcattgcacttagttgttattaagaaaaaa aggatagttattgagctgattcgctgttagcattgcactctggctgaataaagtgaaagaacacgattgaaagccctagc attgcactctgctagacttcatcaatgatactacacagctcttatctttaagagtatagaaagggccttgcagaagcgat taataaagccataaatttcaaagaagattgtttgtttcgaatacttttattacttactctcccctactgcaacactttag atacctgagtgaaactgaaaagccatataggacattcagtagggttaaataatttacattgtgtatgttctgagtggctt ggttacatgtgccattgcaggcagtttgcttatcctttttaagccactggcagcagaatttccctattaacaactgtgtc tccacatttactgacaattgacaaaggcacatttaattgtgggaatatcacttcattgaagtctctcaaatattctagaa atgcatttgcaaggagtaatttaattggtattatcatgtgaagagaaagtgtccattttgtacaatccattttactttgc catgttgcattggcattctgctttaaagaagcaaagcacttttgccatttacacaggcttatgtaaacctgggtgataga atgaaaattctcgagctgc |
Protein
Protein ID | aug_v2a.06360.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.06360.t1 MENPPNQTIYINNLNEKVKKDELKKSLYAIFSQFGPILDIVALKTLKMRGQAFVVFRDLTSATNALRSMQGFPFYDKPMR IQYAKSKSDAVSKLEGTYIQREKKPREKRKTPEQALHLVVIKKKRIVIELIRC* |