Gene
Gene Model ID | aug_v2a.06362 |
---|---|
Locus | scaf2346 : 42226 ... 44420 : + |
To GenomeBrowser | scaf2346:42226..44420 |
Genes list of scaffold | scaf2346 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
epsilon-sarcoglycan isoform x2 | GO:0005886 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.06362.t1 | gi|156408560|ref|XP_001641924.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 4.0e-38 |
aug_v2a.06362.t1 | gi|742188202|ref|XP_010889798.1| | PREDICTED: epsilon-sarcoglycan isoform X3 [Esox lucius] | 4.0e-21 |
aug_v2a.06362.t1 | gi|742188206|ref|XP_010889799.1| | PREDICTED: epsilon-sarcoglycan isoform X4 [Esox lucius] | 4.0e-21 |
aug_v2a.06362.t1 | gi|742188212|ref|XP_010889800.1| | PREDICTED: epsilon-sarcoglycan isoform X5 [Esox lucius] | 5.0e-21 |
aug_v2a.06362.t1 | gi|742188192|ref|XP_010889796.1| | PREDICTED: epsilon-sarcoglycan isoform X1 [Esox lucius] | 5.0e-21 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.06362.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.06362.t1 acttacttttgacggaacgtgtttcatcaatatctggcgctgaacgtagcacacacgacaatcgagacgttttggactac agagaagacaaggtaggctagtccaaatagttacacggcctctgttataaggtgccagggcgctatactattacgtttat gtatgaaagttccaaccgcagcagtattattcatggtctgttgagtatgtaatggcttaattaagctacgaaaaaggcgt tcttttctgtttttagattctagaagaagctgtctaaattaaagcacaatgagtttgtggccttttagctgcttcggtaa gatttatcatgaaaaggtttatatcatcttatcttaactttgcaattgaagcctttgatttggacatcagtctgaatttc accgcttttcggttgtttagtgttgcgttccattttccttgctccaaaaatagttggatctttctagtttgagatcagtt gccaccttttactgcaacaaagcgttgcctctctgcatgtagtggataatttaatttgctgttaatgagtttactggtat attgctatcttgttctaagagaggactaagaaaatatatttataaaaccatcctacaacgttcactcatttttctgcagt gacaatacgtacaatattgggaaagtattgtaaagaggacagatccgttcacaaattacacaaaagctacacttatgatt caattggaatcaagtgaacattttgaatcagtgagcaggaacatcatggtcaatataaataagatcaatataggtttttc ttcatcctgcatgtttttgtaaatgtaatattatttcaatgatgaatattgcagggaaggtataattgtcattatcttct ttgcaggcttcttcttttgttgcacccaattaatcagtgcggctaatatcactgcaaatgccacaactggaatatttctt caaaaagagatttctgtttctgagttctttccaagggcttgtaagtttttaccatttatctcacagttgcacttttgtag caaagaattttcctgtgttaggttattctttaacctctttatgtcgtagcctcttttccagtttgattacaactgcttga tttgaagtgcattctaattttaaaagggacgatgtggaataaagaaaaaaatggtgtggattacagtacagctgttgatt tccaatttattttcctttatagctaaccagtcaggagttaagtttatagcttcaaagttaggctctccagatctgcctcc atggttaagacttgagcagcgagaggtaacagatagagcctttatatatggcactccaggaagagatgtctcaagtcaag tggttttggaggttggtatagtacttagtacagcatatagtggaacattgtttttaacacaaaaaacttatatacctagt ggcatttttcaatgctgtctcagggaaactaaacgaagatacccactgcttgtaacaataaaacgaacctccagcctttc tattagttgttgggacacttaaccaccgagccacaagagactggtaggaacaaagccgttaaaactacttaggtttgaat aattagtaacaaataggactggaatatgtgcatttgtgaatgttaattgtcacaggtagtggtggatttttatactggta aaacacaatatagggattcttgatttgtcattgatttactctaatttaatcaaatttcagatcacagcatggaataaagg agactactcaactgaaagacgaggcatggttatcagtgttgatacagggaaaggttagttgactcaaaaattcaggaact tgataggtgttttgatgtttcctaacatagagaggtgataattgtcatttgtttaactttctagaaattcctcgatatca agcagaattccttataaagaacagtagtattgatgattttcttgagggtcaaaagagtgttggctttgttgaaaaagtga gaaaagtttggcagcccactggaggagttaaggtgacagcagtggaatcaaagctgaacagggatgggagggtgcccatc cccccacagaaggaggggtgagtctagatacaagtctatctcatttaggatgggaagactgctggactgtacaaaaacaa aaaagtgcatatatcattaaaaatcaatgagtaat |
Protein
Protein ID | aug_v2a.06362.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.06362.t1 MSLWPFSCFGFFFCCTQLISAANITANATTGIFLQKEISVSEFFPRASNQSGVKFIASKLGSPDLPPWLRLEQREVTDRA FIYGTPGRDVSSQVVLEITAWNKGDYSTERRGMVISVDTGKEIPRYQAEFLIKNSSIDDFLEGQKSVGFVEKVRKVWQPT GGVKVTAVESKLNRDGRVPIPPQKEG* |