Gene
Gene Model ID | aug_v2a.06787 |
---|---|
Locus | scaf2525 : 9976 ... 19600 : + |
To GenomeBrowser | scaf2525:9976..19600 |
Genes list of scaffold | scaf2525 |
Manual annotation
Study field | Apoptosis |
---|---|
Gene name | Adaptor TRAF family2 |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
tnf receptor-associated factor 3 isoform x3 | GO:0005515 GO:0006464 GO:0007165 GO:0031323 GO:0044093 GO:0044464 GO:0048518 GO:0048583 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.06787.t1 | gi|674066393|ref|XP_008840137.1| | PREDICTED: TNF receptor-associated factor 2 isoform X2 [Nannospalax galili] | 0.0 |
aug_v2a.06787.t1 | gi|507697797|ref|XP_004714548.1| | PREDICTED: TNF receptor-associated factor 2 [Echinops telfairi] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.06787.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.06787.t1 atggttccatgatcactaataaacacctttggctacttggtatagtcgctaatcaacaccttagtttgcttggttgatag tttagcctattggttatgcataatgctcattgcatatattaactcatattagtagttttactttctcttgaacatgactg caaagtctgaaatatttgctaaggatttagtgaaaaaattagccttcatgttgtctcctttggaatagacaaaatcattt tgtcttcagaatacttgggtgaacttaagaaaagttcctaattccctgggccaacatcacttgggggtagttcgatactg gggtgtgaaaaatctccagatttcagatctccagaggtgcacatctctgcgaaatgtggttatgcactctacccaggaac aagacctcagtaattggtctgttcaaaatattggtaacaaattgctgagtggagcctgttacgcactgcagtatcctttg gatatggaaagtggaagtggtctaataggttttattatctttaagtgttttgggattctgtcttctttttggttttgttt gccaaaatttatgaagatattaacataaaattatttcccttttttaaggaattagtgacatcgtcaacttcaaagtgcta cctaacgaattggttttcacgcaatgccaggatacaacctgtgtagttcagaccaggaaaaagttgaagagaaatacaca tgtagcttttgtcatctgctcttgaaggatccttttcaaacttcttgtggccatttatactgtaaagaatgcctaggaca cctttattcgtgagtggttcatgtttcattggtatttgattttttaaggtcatgccagtaattttgcccctacaaattgt ttttgtttcatttttatattgctatctacaatgcagcttcatagctagtaagaatttgtttaaataggcagttagaactt gctgttgtgcttacttaattagtaacaaccacatttaacaaaatatttcactttccttactaattttgaggtgctctttt ctactctttctctccctaccctcctacttctctctctgtttaaaatttatgaagcacgcaaaactatcaaattagggatc ttaatttattagataatgtcatgcagacaaagaatgtcagactatgtcattgccttattttctctttatttgcttcagca ataatcaaactaaaatgacatgtgtggtatgccaggaaaaatttctggaaaatgaggtgagtcttaaatgattagaactc aataatgtaatttattattttctcatttgtttgatatagttatttgtgtaatattttttccttcaaagggaataaacata tgtcaaattgagttctgtacctacaggctaacaggctaacaggttagcctgcaatgcactatgtcatcaggcttgtctgt ctgagtcagtgagtgagttagtgtaagatcgtatctgtggctcagtggctcagcacagggttctagcatggaaggctggg tttcgatatcatggatgggccaccccttgaggtcttaaaaataactgaggagaaagtgctgcctttgtcactacatgtga gaatggttagactgattcttttttatggtttttatagttttttaaggactataaacctgaggtcccgtctcacaattctt tcgaatcgctactctgttggacgttaaagaacccacacactattcgtaaagagtagggcatggagttcctggtgtactgg tctgcccttcacccaagtaaaaaacatcaaggtgtgcaaagagttatgatggaatccggcagtaggtgatctgtttgaaa atcgacgtcactccagagatcttggatttgttttttatcttttcattcaagaagagcactggtaattctcaaggtttaat acgtttgtcaaataatttgtttcgctggcgatgtacaaagacaaaacaaattatgagcaggtcacttgatagcatcaggt gccttcatttgcatgagcaatgttaacgatatcttacctcccgatttttccgtgacattttttggcttgtatgaaaatca ccacatttttcccggaaaattgtttaaaggtaattttgtgacctttctggtgttagttagtcttggttttagctaccaaa atttgattatcaatttcaagttagcaactttcagtgtacaaagaattttcatctaaaatgaagtttacttctacccgtca ggaatttatataatttttagatttctacaaaatttctgtattactgaaacatcttgatctcgagatgctaggcaaatata gcactacatcaaacgcaagaccagcctgtaccatgttgttcttcagagcactacccacatctatgaaatgctgtacctat ttttcttgttggcagataactacagctaatgtaacaaaaaaatttaccacctcaccctgaaccctgtcagactgagcatt ggtattctacaaaacctgctatcttgttttcatattagtaggttcaagagcataacaagcattcattgttaatgtccatg acaaaaacgtgtcaacaatcacacagacaatgttactggtgtaacattcgttatctgtaagcacatnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnng tcccctcagggacctatttttttaaactttgggttggttcatccccattggacaaagtgtttcagtgacccaaagtcaat ttttggcttttgattttttgattttgcatagtttccagttcaaaaaataaattttcgtggtgattaatgtttacatatag tgcatacaccgtattagggttagggtgtataagccgacccatcattttcaaggccaaaaaactgatttttcttcatttct ggtcataaaccttaaattcatattgatagaaatgtcaaatttgtgagacttttttgcagttacagtggatgaaaaagtgg ccaacgatgccacttctttcgtgaaatttatcagctcttgtcacaaaacatgcaatgacatgagtatttcggaaattact tgaggacctttacctttgtttatcaatgagccgtgttgagaataaaatcttcttctcagaagaaaaccaaaaattttgaa aagagacttgataaagaacccaccatcatggaaaacttggtagcaacaccatgaattttctgagcaatggtaacataata agcttatgtgttttccgaaggggtgaaaaattacaatatttgcttttgggttgaatgaagaaacattcaagtcaactttc caacatcatcaaattttattgttgctaggcattgactttgtataccctgaggtttgtatctatcaatccattttcacttt attattccaaattttcctgttgacaacaaaatgcccagataagctcatcaggcacaaacatatataccacaaagtcagct tttaagcaaactttaaataaataaaagtctttattcaaggttttaaagaaacgttaaaacttacaaaatccatcataaat aaagatccagctaatctaattgttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaaaatccgattctaggggattgcgagagaacagagggcccttgtcctttctca cagtttggttgctccaagacagaggtaaacctcgattggtcgcatcttgcctttacactgtatcggaattaaaaaaaagt gaaatctatccactatgatgataggctgttcctgttcccttttcaacatctcaagtaaaataaattagagttagagcaaa acaagaatttgattgggctgtgtgtgacacgtcatgtgtgacacactgcatgtgtgagcagcggtgtttggttctctact ctaatttaacaggtttattctctggggtatttcagttttttcatcttatttgatttgacttggtttagtttgtctgtaga ctccataattgctagaaagttgtgctcgccagagtaacttggccagagttgactcagatattgtgggcgacgacttctgt gtttgtagtaacaattgtttaattaaaaaaatataccacatcccaagtgggttttattacgccgagagatcagtagaaat ggggtttatttcttgagtaaaattgtcattttttacaggtcctcagccaaaaggaaaagaaagaacacttaacgaaggaa agcattcatcacaatattcttctgcttcagtttgctgttcgtgtgagcaaagaaatggaatccctgctgagatctgatcc aaggcttctctcctcgagacagcaaatgtttatgagttacgacaatgttatccaagatctcttcaaccagatgcaaattc actcagacacagaaagacacctgcaagaaatgttgcgacaacacagcgagaggattactgccgtggagagaaaactggtg ctagtgaatacaacgggtggttcaagtgcggcatcttctcaacgtcttcctgatgatgaaggaagctcagtcagtgctaa tgttgaaagaagggtgacagaccttggcaataaaactgcagattacgagatattgatattggaaaataattgcatcgcgg tggaatcaagtcaagaagcggccaatcttagaagacggcttgacaatgtgcagaaaagttcaaagaggtcagagcaaagg agggagtccattgagcacgcactggctctgagcgatgttacactcgctgatttagaagagtacgcacggaaacaaaagtg tttgagttacgacggtcagttgacgtggaaaattactgaatatgctcgaaaacgaagcgaagcagtcaatgggcaaaagg tttccttctacagtccgtgcttctacacaagtcgctacgggtacaaaatgtgcgcacgcatatatttgaatggagacggc atggggcgaggcacacatatctccttgttttttgttgtcatgcgtggtgagtatgacgctatactccgctggccattcag acagaaggtgaccttcatgctgttggatcaaggcaatgtggaacacgtgattgaagctttcagacctgatccaaacagct catctttccagagaccacgaggtgaagccaacatccccagtggctgccccacgttctgctccaacgaggaactgagtaaa cgcgcttatgtgtgtgacgatacaatgtttttcaagatcattgttgatatctcggacttgtagatttcacttgcagtgca tcttggctcgtaacctaccaatgcg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.06787.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.06787.t1 MPGYNLCSSDQEKVEEKYTCSFCHLLLKDPFQTSCGHLYCKECLGHLYSNNQTKMTCVVCQEKFLENEDYKPEVPSHNSF ESLLCWTLKNPHTIRDCERTEGPCPFSQFGCSKTEVLSQKEKKEHLTKESIHHNILLLQFAVRVSKEMESLLRSDPRLLS SRQQMFMSYDNVIQDLFNQMQIHSDTERHLQEMLRQHSERITAVERKLVLVNTTGGSSAASSQRLPDDEGSSVSANVERR VTDLGNKTADYEILILENNCIAVESSQEAANLRRRLDNVQKSSKRSEQRRESIEHALALSDVTLADLEEYARKQKCLSYD GQLTWKITEYARKRSEAVNGQKVSFYSPCFYTSRYGYKMCARIYLNGDGMGRGTHISLFFVVMRGEYDAILRWPFRQKVT FMLLDQGNVEHVIEAFRPDPNSSSFQRPRGEANIPSGCPTFCSNEELSKRAYVCDDTMFFKIIVDISDL* |