Gene
Gene Model ID | aug_v2a.07648 |
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Locus | scaf2879 : 21499 ... 25355 : - |
To GenomeBrowser | scaf2879:21499..25355 |
Genes list of scaffold | scaf2879 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
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Gene name | Adi-Retrovirus-related 96 |
Description | This gene model has RVT_1 and RVT_thumb domains. |
mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.07648.t1 | gi|585671830|ref|XP_006818118.1| | PREDICTED: uncharacterized protein LOC100369229 [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
aug_v2a.07648.t1 | gi|512815234|ref|XP_004911120.1| | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.07648.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.07648.t1 aaacgcttcgtctagcgttttggcgccaacgtaagcatttgcattcgttcgatcgttttcgcttctcatcatggcgggtc aggttcccaacgctcttattttaggccattcttttgttaaaagattgcagcgtgacatgctatctaactttgatgctcga gtagacgcgaactttaaacttcagggcagcgctcttgtgcatttacacggcatcgacggtcgtacggtggcaaaccttcg gtcgtttgaccttcaggtagtcacaagtatctctcctgatgttgctattttagagatcggtaccaatgatctttctctag aggcgcctgaagttgtgggttcagccatcgaagagttagtacggttacttttggatagtttttcagttcgcgtcgtcggt gtttgtcatgtcattccacaaattttgaatcatcatgttagtgttgtcttggacgatattccaaatgctttctgctggcg ccataggaatttttctcacccagctaagaatgtttacttggctgacggcgtacacctcaacccttcggggcaatatcatt tatatcgaagttatcggggcgccattttgaaaggcttgtcctttctttaggtttagtttacttgtcatgggcatattctt ttgttttgttttatcctggtgtgtttaacacagggaattgagtgtggttaagtccacttatatattattgaggattcgtc ctcttgtggatttgtccagtgttattattaaggatttatccttataatactttttgaggattcgtcctctggcttttagt ggattcgtccactgttgcttttggggttgttgtcaacctcttatttatttattattttggcatttatagggaagtttttt gcgtcgacttaatgtctgacttaatgactttccctgccacatttttattgtgttatatagtggattcgtccattattttt attttgaggattcgccctctggctatcagcagctcgtccactgttgcctttggggttttcaacctcgtttattttgtttt ggcatctccagggaagttttttgtgccgacttcatatctgacagactttccctgccaatattttaattttgcccatgact agttcgtagtaaaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaatttgtttctgccagtcctgtcttttctttgcagt gcagaatgccaccaaagcgtccgttgcgttctcgccgaccttcagcaacagctattgctgctaccgcatccggagagagt cagaggaggagagccaggtccaaaaaacaaaaaactgtcccacaagtgccaggaccacaggggccagcaccacaagtgcc tgtaccacaggtgccaccaccccaggtgccagcaccacaagggccaggcctacaagggccagcaccacaagtgcccgtac cacaggtgcctgtactaccagctagccaagacgttgccttttttccgggattgctagatacccatgttgccagggtcgcg gatgaggtaaccaaacgtttaacgcctgtatatgcatcagcgtcaaacaacgtagaagttcctcagcctttccaagttcc tgctgcgacggatggatcagtggaagaagtgccggtcatggaaaatgtgtctaatttaatcaactactcccttaccagtg tgcactcagccctttcaggtgagcctgatccggttacgcatagggctttacccggacacctgttttcgtcacccagtctg gcgatcggctctagagtgtcagataggctgaagtctaagatttggaataatgaatattttgagtttagtgctttactttc aaatcctgtttttgaaaataagtatcagcttacaatcaacaattctgacaggggattagtgccatccttgggcttagaac ctgtttctaaaatcaacaagtatcttagtattgaatcctggcttaattgttttcacatatttgtcggcgtatatactcga aaataccccaatgaggcccctgccctcatgaaatatggggaggttgtgcaggacttggcagctcgggggcataattggaa gttttacgatggaaacttccgtttcctgcggcagtcacaaccagctgcattcccatggatcaatatccattgggagttgt ggatgcgttctcaacagccaatcgtaagaaagcccacagccacagcaccccccagtcagtccaggactagggacgatagt atcccgaaaggttattgtttcaaatttagcaagggcgtgaagtgctttggctgtgctttcaagcatttgtgtcatagatg tgatggttcccatcagcctaggctgtgccaaaagtaaagcatccaatgactcccaacctgcccagtcccagcctaacaga gctccaccaaccaaagcataatttaactactccaatagaggtcgaacgattggaatgtttgttatctggttacaaccact ccactgcggaactcttagtgtctggttttaagtttggttttccgatacactatagtggtgctagcatttcctgtgatgca agaaatttattgtcgacatctcaaaatcctgatgccgtagaaattaacataagaaaagaactggaggtaggtcgtttagc tgggccctttcccattcctcctttatccccattttgcatttccccgttaggggtggttcccaaaaagaatccgggtgaat ttcgattaattcatcatttatcatatcctaagggttgttctgttaatgatggtatatcatccgagtacaccagcgtttca tatgctaccatctcagacgcgattcagcagattaagctggctggtgcagggtgttttttatccaaaacagatattaaaaa tgccttcaggatcatgcctattcggcctcaggattatcatttactgggtatgaaatggcagggtatgtactattatgata ggtgcatgcctatgggttgctccagctcctgcaaaacctttgagacatttagttccgcattggagtggattgcacagaac aagcttcacattcttcatattttacatcttctcgatgaccttttaattattgctccatcgtatcagctatgtcaggcgca gttatctctatttgtagatctttgtagttacttgggtgtccccatagcaccagagaaaacccgcgggccaagcaccactc tatgttttgctggtgttgagttagattcagttttctttgaggctcgtctgcctgtggaagaaattaccaagtgtctgtcc agtatctcgaatttccttcaacgcaaaaaggtcaccttaaaagagattcagtctttaacaggtttgcttaattttgcttg cactgtagtggtgccaggacgagcatttttgcgacggttaatcgatctcacagagggagttcggtctccttatcatgtca ttcggatgacaagggaagttaaggctgatttagctgtttggcaatcctttttaaccggttttagtgggaaatctttcttt ctggaagacacttggtatagttcagtgaaattaaacctctttacggacacctctgggtcattaggttttggtgcagtgtt tggtagtaagtggtgctatgggccacggccagctagctggatcaaccgtaatattgcattgctggagttttaccccattg tgcttagtttatccctatgggacagcgaaatgcagaatcgatgtatcttattctttgcggataacgaagcccttgtccat gttatcaataagcagtcttgcaaggacaaggagcttatgttttttttgtgcggaagttagtgttggtgtgtcttcaaaat aatattgtgtttaaggc |
Protein
Protein ID | aug_v2a.07648.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.07648.t1 MAGQVPNALILGHSFVKRLQRDMLSNFDARVDANFKLQGSALVHLHGIDGRTVANLRSFDLQVVTSISPDVAILEIGTND LSLEAPEVVGSAIEELCRMPPKRPLRSRRPSATAIAATASGESQRRRARSKKQKTVPQVPGPQGPAPQVPVPQVPPPQVP APQGPGLQGPAPQVPVPQVPVLPASQDVAFFPGLLDTHVARVADEVTKRLTPVYASASNNVEVPQPFQVPAATDGSVEEV PVMENVSNLINYSLTSVHSALSGEPDPVTHRALPGHLFSSPSLAIGSRVSDRLKSKIWNNEYFEFSALLSNPVFENKYQL TINNSDRGLVPSLGLEPVSKINKYLSIESWLNCFHIFVGVYTRKYPNEAPALMKYGEVVQDLAARGHNWKFYDGNFRFLR QSQPAAFPWINIHWELWMRSQQPIGCSVNDGISSEYTSVSYATISDAIQQIKLAGAGCFLSKTDIKNAFRIMPIRPQDYH LLGMKWQGMYYYDRCMPMGCSSSCKTFETFSSALEWIAQNKLHILHILHLLDDLLIIAPSYQLCQAQLSLFVDLCSYLGV PIAPEKTRGPSTTLCFAGVELDSVFFEARLPVEEITKCLSSISNFLQRKKVTLKEIQSLTGLLNFACTVVVPGRAFLRRL IDLTEGVRSPYHVIRMTREVKADLAVWQSFLTGFSGKSFFLEDTWYSSVKLNLFTDTSGSLGFGAVFGSKWCYGPRPASW INRNIALLEFYPIVLSLSLWDSEMQNRCILFFADNEALVHVINKQSCKDKELMFFLCGS* |