Gene
Gene Model ID | aug_v2a.08193 |
---|---|
Locus | scaf3131 : 33216 ... 38184 : + |
To GenomeBrowser | scaf3131:33216..38184 |
Genes list of scaffold | scaf3131 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 20-2 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 20-1. This gene model contains Rapsyn_N, TPR_4, TPR_1, TPR_2 and DUF2977 domains. Predicted amino acid sequence for this gene model showed similarity with cyanobacterial proteins. |
mRNA evidence |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.08193.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.08193.t1 cccctattgattattgccattctcgtaggacacgtaagatgcgcttccgctctgctcttcgcttagtagagtcaaaagtc gcttctgcctacccttcccgtcaggctgcttttttttctccttgtcccagattttgggacacgcattacaagatcagacc aaggtctattggcggattagaagagaggcactgggaacgaggttaaaactccttatctcaaaacccctaagctcaagatc tactcaatcttgacaaactactgagctgttgttaaaattagttccagatcgttaagattttttgctttaaacgatatata ttagtgccataaaaaaaattgatgacatcggttgacaacatttcctttaccaaatgttcctcctgctggtacgattgtca ttttttccttcaatttttcttttccactagttatttatttagttgcttttttctttttaaaaaagaaatggatcagttac tgggcgacacgaataacaaagccattgagtaccttgaaaatcatttgaaaattgcaatagaaattggtgatcggggcgga gaaggagcagcatatggaaatcttggtaatgcttaccactcactgggtgactatcgaaaagccatcgagtatcatgaaaa acattttcaaattgcaatagaaattggtgatcgggccggagaaggaggcgcctgttggagtctcagttgtgcttactact cactgggtgactatcgaaaagctattgagtatcaaaaggaagttttgaaaattgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnttgagtatcatgaaaaacacttgaaaattgcattggaagttggtgatcggcacgaagaaggaagagc ctatggaaatctcggtattgcttacgactcactgggtgactatcgaaaagccattcagtatcatgaaaaatgtttgaaaa ttgcaacagaaattggtgatcggggccgagaaggaaaagcctatggaaatctcggtattgcttacaattcactgggtgac tatcgaaaagccattgagtatcatgaaaaacatttgaaaattgcaacagaaattggtgatcggggcggagaaggagcagc ctatggaaatctcggtaatgcttaccactcactgggtgactatcgaaaagccattgactatcatgaaagacttttgaaaa ttgcaacagaaattggtgatcggggcagagaaggaacaacctatggcaatctcggtattgcttacgagttactgggtgac tatcgaaaagccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattcttttcct agcatttgaaggctttacggccaacatctggtttctgagaaagggaaaaaaagttttatttcggaaagggaggctggagt gtgacagaagagagaaagatcctttactcgccttactgcaatcatgtttagaaaaaatcggaactgaaagtacaaaaaga tgtggagatccctttaagccattttacgatgcagttattgatccaattcttgacatgcttgaacctcaagacgacgagtt ggtcattgttcctggtggtgtgctgtgctttatcccatgggccgcagtcattgaatccattaggattcgcactgttccat cgctgacaagttatcaattgatcttaagtgtacccgaaggacatcacatgaagaagggcgcgcttttggtcggaaacccc tgtttgaaagagttaaagaatcccgaaaatgacttaccgtgtgctcaagaggaagtagaaatgattggatctattctcaa cactagacctctaacagggaaacatgcaacaaaagccgaagtgatgaaacggatgtcgtcagttggtttaattcacattg ctgctcacggaaacgagcacactggagaaattgctttgtctccgaaccctggatggtcttcaaagttccctcaaacaaag gattacatgttaaaaatgtccgatgtacaggctgccaatctccgagttcgtcttgtggtgctaagttgctgctacagtgg aaaaggcagaatgaagaatggagagggtgtggtcggcatcgcacgtgcttttttggctgctggtgctcgttctgtgctgg tggccctgtgggatatagatgacgaagctaccaaggtgttcatgaaaagtttctaccaacatctgaaggaaggaaaaacc gccagtgctgctgttcagcaatcgatgagtttccttcgtgaatctgagcagttttctgagacgagatactgggctccatt tcaactgatcggagatgacgtcaagattgaattcgaggcagatgatgacatctaaaaatgactaataatttttttcaatt cctttgtcacagtataataaccgacggaatacgtttctctggctgttttacttgtcgataacgccacgtaatagaacagt tacgataat |
Protein
Protein ID | aug_v2a.08193.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.08193.t1 MDQLLGDTNNKAIEYLENHLKIAIEIGDRGGEGAAYGNLGNAYHSLGDYRKAIEYHEKHFQIAIEIGDRAGEGGACWSLS CAYYSLVGDRHEEGRAYGNLGIAYDSLGDYRKAIQYHEKCLKIATEIGDRGREGKAYGNLGIAYNSLGDYRKAIEYHEKH LKIATEIGDRGGEGAAYGNLGNAYHSLGDYRKAIDYHERLLKIATEIGDRGREGTTYGNLGIAYELLAFEGFTANIWFLR KGKKVLFRKGRLECDRREKDPLLALLQSCLEKIGTESTKRCGDPFKPFYDAVIDPILDMLEPQDDELVIVPGGVLCFIPW AAVIESIRIRTVPSLTSYQLILSVPEGHHMKKGALLVGNPCLKELKNPENDLPCAQEEVEMIGSILNTRPLTGKHATKAE VMKRMSSVGLIHIAAHGNEHTGEIALSPNPGWSSKFPQTKDYMLKMSDVQAANLRVRLVVLSCCYSGKGRMKNGEGVVGI ARAFLAAGARSVLVALWDIDDEATKVFMKSFYQHLKEGKTASAAVQQSMSFLRESEQFSETRYWAPFQLIGDDVKIEFEA DDDI* |