Gene
Gene Model ID | aug_v2a.08845 |
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Locus | scaf3372 : 181206 ... 184807 : + |
To GenomeBrowser | scaf3372:181206..184807 |
Genes list of scaffold | scaf3372 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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transcription elongation factor b polypeptide 2 | GO:0000079 GO:0003746 GO:0006414 GO:0019901 GO:0031462 GO:0031466 GO:0031625 GO:0070062 GO:0070449 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.08845.t1 | gi|156373216|ref|XP_001629429.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.08845.t1 | gi|260821143|ref|XP_002605893.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_87435 [Branchiostoma floridae] | 0.0 |
aug_v2a.08845.t1 | gi|432922409|ref|XP_004080338.1| | PREDICTED: transcription elongation factor B polypeptide 2 [Oryzias latipes] | 0.0 |
aug_v2a.08845.t1 | gi|219278714|ref|NP_001136426.1| | transcription elongation factor B polypeptide 2 [Danio rerio] | 0.0 |
aug_v2a.08845.t1 | gi|632987572|ref|XP_007882630.1| | PREDICTED: transcription elongation factor B polypeptide 2 [Callorhinchus milii] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.08845.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.08845.t1 acttcgtgtcgaccgccatcatggtaagtggatgtgtcctttttctttcaattttttcccctctggcaagtttttctaat gttcaacaatcatttcaagatctactcctgcgtgcgttttatttatctggctcatcaaactcgcaatctctttgttttgt aggagatttttgtgatggtgcgtcgtgaaaagacgaccattttccttgattgcaaggaagccactactgtctacgaacta aagaaaatggtcgaaggaataacaaagaaggctcctgacgatcagagattgtacaaggatgatcaaatactcgatgatgc gaaaacgctggaggattgcggctttacaacccaaactgccaaggcacaatccccggctttaattagcttgtcatttagag gggaaggtaagcgcattagtttgatacttagtttggctggtttcaatacaaaagttcttcaatgctgataatgatttgaa tgattcatggctacttattgtcatcggtagttttattgtaaacatatgcatgcaatccttagtacaatttcgtttgaact ttcttgtactcgtttcaatttaaaatatcgtgctatcagcttaacttatttatcttcctttaagccattcattttgtacc tattccggtcatggtttctggaaaattcctacagcatttaagtaagctaatctctctcctttttcttcttttcacacaca tttaattgggggaactgaccatgtgctctaaaaggaaaatgccatcaaccttgaaccagctgaatgtaattgtcaattat tatgcaagaagcttaataagtttttaacttgtaggttttctgcctttaccttttttattattttttttaccctctttatt tttacttcctttgaagtgacggaaacttctaagatcagttgtcattttgacagaaattggaaaaattgccttattggtta tcaagctttgaatgtgatttaaatacagtttttaacatacattagtggaaattttgtagttttgtttttggacaagttca ttgttgtttttcgtattatagcttggaaatctcttgccatggtttgggaaaaagaaaatagtgttagcatagtgtatgat ttgcaacctccctagatgattttctccacagaaatgactatagataggatgatttcatttatttttacacagaagagctg ttatagatagtatggaaacatttaaatcagtagtatagatacatttggagacttgttattcaaagcgtaagaataatatt tttttgcctctatgaaatttaggtaggatttatggaagttaaaaggatgttagaaaaaactattttttttgttgaatggc atatcattgttagtgctaagtaagtgatttggaagaacatttctctttggcagggtagattttttcagtgaatgataacc taccatattttctggtgtatttgtagaccttttgagtcttaattaatcactaaaaaactggaccatgatggaaacaccaa ccaaaacctcaatggtctctcagcagctggaaaagtcacacttcattgtcataatagtggaaattcattaacacacatgg gaaaaaccatcctctttctgcatttccagtttagcacaattgattttgattcacagcaggtcattggctttgtaacccct cattcagctttgtaacctagcaactaatcagggctattgaaattatgtgtgcatgcaaaatgacattatctggctctgag tgcataattcccataatttaaaaaaatacataagggcacaatttttgaaaatgtggacaaatctattaataagctggttt ttttttaattccttgagagataaatggaaattttttcccataaatatggcatattttcgtagcaaatagccactgcttca ttacaaaaagcgttcacaaatatatcaaatcaacaagacattccaggcgttatatgctgatggccattgggaactgtgct ctagttttttatgtaacgagttacagcttgtaaaagaaaaaaattgtccttctttgatcttattgtcagcaaaacaactc tctttcccatcgtttcactttgaaaattgataattttgtattaaaagtgaaaccaaataagatttacaagtttaataact tgaaactttgaaaattttttagtgcatgatttgctaggaaaaatgcataattccagaagccctaactaatttgtacaata tggtagcttgttttactggtacttcatcttttcatgtctttaagatgtttcgagatttttcctcacattgaaagccccaa acgtcaccaaaatgtcaccacatttgggaaaatactggtacctttaaatgttgaaagtataggttttacattttggtgat ctttaatgtaattctctctgaagtctgtcactcaatcaatatgactttttctacacagaacactgatacaacaattgata aggattttgaactcaacttttcactaaaaatatgtaaatctaaatttttatctgcaaataattgagttgactcatacagt ggttcagattatgtactagaaaatacaattttctgctatgcaatcagttgagaactattggcctccttttctatgtttta accagtgagctataatagtgcatgtaatgaaactcatgaaaaagagccttgagaacttaatgatcccgttccattaatga tgataataataattattgagcacatcagttttagtttatgaagtttgatagttatgtaccggtaggtattcattttttgt tattttgtttgtgttctagatggagagtttgaaccagtggtcattgcacctctgtctacccctccagaattacctgatgt catgaagccccaagatagcattcctggtggtgacggatcgtgagatcttattattattattcttgctccagcagttccat agattgtgcttgtattgatgcaccactttgtaggaaacagtgactcagtggatgaagataccatgtataattggaatgag aacaaatgaagagcatctaagtagtgatcagtattcaatttgtctttgcagttaacctttttgcaaacattgatggcgca ttaagtgactagaaagaatgtttattgatattcaaacacctttaagacatcaaaaaagaaccattacaaacagttctttg tatgcagagtcctcaaactttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattggtctttcctgatagag tgcttgtacgtggtgaatgggagtgctacaaagattatttcaaagtagtgtggttttttttcttcacaaatcacttatta gtttaatatgctatttgatgcagcatgtgtagtttaagcaattgtgtgcttgctgatttcatgtgaattaacttattatt tttaacagatgctgaagactgtaaactttctccaaattgaagtttaaaaaatgttgttgtaactctaattggaatttcag gtaatctaggaaaacatacttgtttcgttgaagcattttgtattgtcaagttttttgttgtaaataaacagatttctttt ga |
Protein
Protein ID | aug_v2a.08845.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.08845.t1 MEIFVMVRREKTTIFLDCKEATTVYELKKMVEGITKKAPDDQRLYKDDQILDDAKTLEDCGFTTQTAKAQSPALISLSFR GEDGEFEPVVIAPLSTPPELPDVMKPQDSIPGGDGS* |