Gene
Gene Model ID | aug_v2a.11678 |
---|---|
Locus | scaf4583 : 19406 ... 30244 : + |
To GenomeBrowser | scaf4583:19406..30244 |
Genes list of scaffold | scaf4583 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
cytohesin-1 isoform x2 | GO:0032012 GO:0044763 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.11678.t1 | gi|556955384|ref|XP_005989179.1| | PREDICTED: cytohesin-1 [Latimeria chalumnae] | 0.0 |
aug_v2a.11678.t1 | gi|449682225|ref|XP_002155632.2| | 0.0 | |
aug_v2a.11678.t1 | gi|543374993|ref|XP_005530709.1| | PREDICTED: cytohesin-1 isoform X2 [Pseudopodoces humilis] | 0.0 |
aug_v2a.11678.t1 | gi|527245572|ref|XP_005141125.1| | PREDICTED: cytohesin-1, partial [Melopsittacus undulatus] | 0.0 |
aug_v2a.11678.t1 | gi|663264039|ref|XP_008492781.1| | PREDICTED: cytohesin-1 isoform X2 [Calypte anna] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.11678.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11678.t1 aagatggcgggtggtggtgattatttgttacaagactcttttctcggaactgccttgaattaattgaaaattttctcata agaaaaaggtacttaagtcttaaatttacaatgtcgacagcagtggttgaagagagaaacggaagcatgaacggtaagta agtgacttctcattgccttcgtgctggaagttcaggtaatggcttgttatgaatcgaataacgatatcattttaatattg agacgcgttgcttgtttctgaaatactccgtctctgttaagtactttggtagattacatttgagagcagctgatgaagta atttagacttcagaatacatgtatgtagcgtttttatgcacgtatcagatatatattttatgcagaactttgaatgcttc aacggtacggaagcatatgcaaagcatatatatgccattttgggagcgtcgagtactcatattatagaataagaataagc actaaacacggtgacctgaatttttgaggcgaattggcgtgcctttctttttcggaagtgctgaggcacgaaactgaagt cttagtttgccgtcagatatctgatatatcttttgcttacatatgcattttttcgttagcttattccggaatactaagtt caatagaatgttgcttaactttattccgaaagttccatttttgacggtaagtctatcgttaaagtattgaacgacatcga ggttcatttaagtaggaaacaataatcctctaaaatattggatcactaacagtatttccgtatcaatttgaattacaaaa taattcagatttgcgttatttaggaaatgcagccacacactctaaaccgcagaatatactggaactgatttacatgttgt taaggagtaccatatgttttattattctaacttgttaaaaacatactgccagatacatgtagtaacaatggttagaaatg gcagttgtattctgcagttatggcatgcagaatgttgtcctcaatgagaccattgtcattgtcaagagctttttcatgga tcctcaatgctcattttttccctataaggtttgtgttgatacacttccaaaaatacatttacatttggatgtctcgtaca tacttagttacaatggtgctgtaatcaagtgtacatagcgaataaagcacacggaaagttgctcagtttgtgtaatggca ccagatagttgaatccaaccaactgtgagcagttataataggatgcaaatttgtcatctcctcatagcaaaaaaaaaaag ctagttagataccgttgacaagtgctccttattaaccaaaaatggttttggttgcatatatttaaaagtgaaattcagga agaatggtttcaatcaaactgcgtttcatttttctttggttaaacagtttaattaccataaagaatacaaataacatttt ttctgtctgttcaaatattgcctcctgaagtgtagttttaatgaatgagataaaagcttttagatgattattgtgcttaa tcattatactaataattattatcatagttattatcattgttaatataataattgcatgggacttcaggtttaacctcaaa agaacaggaacttctgatgggaatcaggaaaagaaagtcagaattgctgatggaaatccaggtaattggatatttttgca ggtgatacacagggctgtcaaaacacactatcaggcatccggaaatatggctggctactagtttagtacagcttttacat gaaaagaaaaaattgtgtgtcagggtcactttctgctttacctgatcttttttataatcctggatatgttgcaacagcat taaattttaagtttcagtaaaacaataaaattgttttgtgtagtacctcaaacaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttttcttcaattaagttgatttaaagcactgttattt tagattcaaatatcctccaatcgatttgagtcaaagtcaacaatttgagtttaaagttaacaataatggtcaaacactgc ttacctatgttgcaatcattgtcttccttgctgatcagtgtttaattttatattatctagggactggaatacttaatatc taataacttgttgaataacactccagaagatatagctgaatttctctttcgggaagaaggactgaataaaacaatgattg gaaactacctgggtgaaaagtaagtatagtttgtggagaagcataaaaagatcaaatttgtctgagcactaaaataaata tttaccttgtgcattgatccatcacatgctgggcattaggtaaagggaaaaggaagttacaagaagtaaccattgtcttc ctgtaatcttgttgtaatttttgtgggcatgttttggcattcattgataaacattggtgtgtccttatgatatgtgtttc ttgaaaattctcaacaggtttacatgttaattcatttaaaatatagatctttctaatttgtacatttcactctacagttc agaattcaaccttgaggttttccgaatctttgttgagcttcatgattttgaaggaaggttattggtagatggcttaaggt gagtttcttgttggacaatcctttcctgcttgtgtttttagcatttttcaaagatatataagcaagtaaatgacaaaaaa nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgagatagtgttgataataataatatcaat gatagtaaattacaaattaaactcatcatcaaaagatgagctgaggaactggtgccatcaaaggttggtggtgaaaacaa agcacaacggggagatttccatggcaaccctattagcattatccagccctgcaagtggcctccaactagcactctcactt tgaacaaacttaaatgggtaatacttacctaacccagtacttaccttggctcaactccaatgaggggtggaaagggctgg gcactaaatttgaaaataagcaaccattaccaatgatcaaaaacttcacagctaggattgtttgcagaaatttgcattat ccctgttcttaaagaactgaagtagatgtctgttgaatccatgctcatcttctgggattgcattctggtttttaagtgtt aaaggggactgacccctgactatcttgctaagaagttcaaaaagaggtctgaaatccacaatagacacacgaaacaagaa taagacggactttctatgacacaaaaatggtcgtaggccaaagaacctgccattactgaacactttcactatggaattcc ttacctgaaaggctcactgagctaaaaagccttgcatcattcaaagagaaacttacaaattacatttagccgtgcatcac agaaacttcaaaatgtggcagtgtgaaatatcattgccatcatttgttgtcttttttcctcatgtcttttattccaactt ccgtataccagtgtggtacaaacaactctgtgatgtgacaaaatttttgttttcattcacattgcttattgttcagggaa tttttgtggagcttccgtcttcctggtgaggctcaaaagattgacagaatgatggaaggatttgcgaaaagatactgtga gcagaatccaggcgtgtttacatctccaggttagtgtacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgtttgggtcataaaatgtgtatttctctgacatactataatggg gacctgttaattattccacatctatgaatttggttatgttgcgttgttatcagccatagcatagaattagaagtattaat agacatgtggggcatgcactggtgtgatgtgcataatttacgtgatgttgttgttctgtgcggttctccttgatcacatc ttgcccatgtttattactaactataaaatctagctgagatattcacagcgagtcttctttctcttttttgtctctcattt ttttaatgtttcatttattgtagagcttgtatgaaagcataaaaaatgaacagttcaagatcccagaagatgatggcaac gatattactagaacgtttttcaatcctgacagagaaggctggctgactaaagaaggttaataaacttcaacaacaagagt gctgtataaacatgaggcaataataatacttaggataatttttctgtgcatttgccataaaaatgatcaaatgcacacca tgggttttttttttatatgcttaaaagcattgtaaaacagctttatgatgaggtaaacttcaaaccttaatgaaagcctg catcaatgttaatattcaaaaatttcttatgaaacaagttgcaaggggtcaaatttcaacggtcaaaagaaaatgcagct gatctttgacgccttagctcatcttgattccctgcagcagttagctaatgcttgaaatgccagttccctgatccttttat ggtggaaatttgttggataccaaattttcttgtttcatctctcattagaaaataaacccttcattcaatttgttataacc ttacagtcatgcattacattctgattataggtggtttgcacaaaagctggagaaagcgttacttcatcctaaaagataac tgcctgtattattttaagaatgttggggtaagaaactgctaactctttccttcttatgtggaaaaatgggaagtaaacgt taaatgaaataatttttattttggttgcaggacagagaaccccgcggtattattcctttagagaatcttcaagtgagaga ggttcaagattccaaaagaaaggtgatgatgaaacatccagtggcatttgttatgagatttacttagctaaagaaaacga ctgttttttaaccttgaggacttaagttttcatttcaaatgaagcaaatgcggtcggtttacggaaatgattttgatgtg acctttttaaactgttaaaatgtccaatttattttgtgccctacatgtatgaactctctacattcttggaagtctttgga tagtttgttctattttggcaattatttcttcactagagcacgttgtatttaatatgggcattcagtaggattgcctggca tttgctgagtactcgttaaaatctatggctctcctagtgttgaaagagtttatgaaacttggatgattgattattcagaa catgagatcttatcagaatttgaatagaattttttttatatgaatttgattccctgagtgaatgatttttttttccagat atacaataacctattaagatcatcgattaaagatcgtctttgctctcctgtaccaatatgaatttcatttcctttctcta ttttcctcttcagtattgctttgaaatatattcagctgataattcgtcaagtcttatcaaggcttgtaagacagactcag aaggaaaagtagtggaaggtttgtgtgtttgtttcacgattttgatctgtcacgatactctgtgttcatacccctctcac caagctgtatccttcacttggtctgtgtgtaggacaccatgatgtttatcgcatttgtgcggtttctgaagaagaaagag aaacttggattgggtgtataaagtaagttgctttttggtttgttcaataataattactcagcaacatacattggagtttg tgttgaggtcgatgccaatttagttctttatccaagcctaatacatttacagttttgttagattaaaaccttttttaagg ttcaactttgaaggttttaggtgtaaatgaaatcttctgatctaaaaatgcaggtggatgcagatgtcactttaaaagta aaattcttaacattgtctaatactctaggtttccgctttagactcccataacaactgaaattaaataagtcgtggtactt gctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaataggatctcgcaaaggagtatcgtccattattctaactgcctta ttttgtaaacgaataagctgtgataacgggggatttgaaaatttctcgacaactcttcttcaacattgctgcaatttcct ccactcactcgtgacctttcacaagacacttcttcagtcattgctctgtatacgcggtgaactaaggaggaacttcctcg tttggtcctgttaccgacattttcggtcgccgtttgaaggcacgatgatcgatcccgcggtgacgctttaattcatgtct gaagtacacgaatgttaacatatatacgcagatctcggtgtatatatattttcattttatgcccggatcttggtgaatac gcacaagtcttaatgtgcatacacgaattttaatgtggctgtatatttacattgcttgattaataattaagctcacgaat cttaatgtacaatcttcatgcatttatgcaaatcttgatgtatacaactatttcaattcacgttgtcggatcaaagcctc aagcctacaagacaaggccgaaggggaatatgggattttaatgaataactatcagcaaaattaacaatgcgtcgtccata cagcgaagatttccgattgcaagccatttggatgatagaaatattggggtttgaagtggatgaggctgcacctgctttgt ggatgtcgcgtacgcttgaagcgttgaaccgacaacgaaaattgaaatagctgtacatagatatatatatggatcttgat gcatgtatgcaaatcctgatgtaaacatgtgaatcttgatgtattatatacacgaattttgatgttagatcactgtcttc actcttgttgttttgtgcctttttaacgagcataggtaataactggacgtttgtttgtctaatcatcccttcctctgttc ggaactgaaccagtggacgctttgtgtctgtctaatacgggcaactcatttgtacttataaaatacggtcatcgaacaaa aaaaaagagttagcgcgggaagaaaaacacagtcgaata |
Protein
Protein ID | aug_v2a.11678.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11678.t1 MSTAVVEERNGSMNGLTSKEQELLMGIRKRKSELLMEIQGLEYLISNNLLNNTPEDIAEFLFREEGLNKTMIGNYLGENS EFNLEVFRIFVELHDFEGRLLVDGLREFLWSFRLPGEAQKIDRMMEGFAKRYCEQNPGVFTSPEDDGNDITRTFFNPDRE GWLTKEGGLHKSWRKRYFILKDNCLYYFKNVGDREPRGIIPLENLQVREVQDSKRKYCFEIYSADNSSSLIKACKTDSEG KVVEGHHDVYRICAVSEEERETWIGCIKISQRSIVHYSNCLIL* |