Gene
Gene Model ID | aug_v2a.11683 |
---|---|
Locus | scaf4583 : 50696 ... 55396 : + |
To GenomeBrowser | scaf4583:50696..55396 |
Genes list of scaffold | scaf4583 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.11683.t1 | gi|156376878|ref|XP_001630585.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 3.0e-12 |
aug_v2a.11683.t1 | gi|148747173|ref|NP_001092054.1| | transmembrane glycoprotein NMB precursor [Sus scrofa] | 2.0e-08 |
aug_v2a.11683.t1 | gi|432921544|ref|XP_004080199.1| | PREDICTED: transmembrane protein 130 isoform X1 [Oryzias latipes] | 2.0e-06 |
aug_v2a.11683.t1 | gi|291238188|ref|XP_002739013.1| | PREDICTED: transmembrane protein 130-like [Saccoglossus kowalevskii] | 2.0e-06 |
aug_v2a.11683.t1 | gi|558115223|ref|XP_006112884.1| | PREDICTED: transmembrane protein 130 [Pelodiscus sinensis] | 3.0e-06 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.11683.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11683.t1 gtgaagcggaaaagtatggttgaagttatttgacacaatacggaagagagtacactgcctcatttgcagttttgcatagc aagtcttccaccatctgagcttgttttgaggacatgcagccttcagtgtgtttgtttttgactgctctagttttggtcgt gtttccttgtggactcctctgtagcctttctggagacttcaaagtgcttatttggaaaaatggtccggtaattgtgggag aaacaacttcgtttcatggcgtagtggtcctgaattcgaaacccgaagaaggagggacgctcgaaacggacaaaaatgtg aaatgtgaattttcatggaatgtctcgtctcactcttggatagatcgaaggacgaccgatgaatgtcacagtagctttaa ttggcgctggactgaatgtcggaatcacacggttttcgtgtctgttggaatttattatggccgcgacgtcgaacaagagg aaaacgtttcgtccagatacaagtcatatcatgtaacgaaccaaacaagcgtttcagtttcagtgaaagaaaaacaaggt gaatttgaacccttctcttacaaagttttagtcacgtttttgtgacaaccctcagtacccgtgggtggagaattttaaat tattagtataagggatgggtggtttctctgatgacagtttattgtcccctcttggagtttaaaaggggagaaacaatatt attattattaattcctaaattcaacattattctttcagcctcagttttttcctgccatttggctataaaaagttttgctg gccttaagttgccaccagataaaccaccatacaatcttcccaagaacagccctgttgaatttgaagtgcaattcaaggat ccacagaaactggtgacaaatgtgtcaactgactgggcatttcattctcaaaaatggaatgtgctacactacattgtaac agattggccaaatggaaccatgtatcatatgttcccagagatgggtgtatatatggcggaggtgacagttagagccactt tgaaggggaaccagaagtggtcattaatctttgtaaaaaaactaattgtaaaaggttggtaattctcatttgtgttgttg tttttttaaataaactgtaaggtagtcatcctgcttgaatctcttttggtgattgcagataatactgttaatgcttatgt ttagggcacatgtataatttattcagttttctctaaacattgtgcttagataaaagtgaaaagatgaataattatttgtt ctagatcatagttaggtaacgtactgctttctttccagatcctgtttcccttaaagtgcaacacaaacatttgaaacata aggacaaaacaatcagattcaacatctcttgcaatggaaggtgattattgtcaaatatatttcagtgataatgattattg tttgtcttctgtcaatttgggagaccatgataccatatgttgctggcatgcagcgccgtgcaagatttccttctttgtag tcaattggggttcacaataagcacttaatgactgaccccaagggaaacagtgagttttgtttccccgagacccccattgt tccccgaggcaaggccaaggggaacattgagtgttgaggggaaaaaaaaactcactgtttccccaggggccagtcattaa gtgttttgttatacctcccaactcaaaatagaacaatacacggatgtcagtttacgacttttttgcaaaatgttacacat ctcagtaatttgcatataaaataagtcacaaatatattactgtcaataaaatcacaaatgttaagatttcgttgaaaagt catgttctcacggcattgtcagtcgtcttgttagtagatttggagcttttatcatgtagaagctgctcaatttcttcttc agttcttgtttgaaaccgtttagctgccatgactgcgtaaaaaattatttgcttgatgtggctggcaaacaaatttgcgc tgtttcaaaagtgcacaacctgatcacgtgcgagtcgaaagttcaagttgttgttgcccgagggcgtcatgaagttttgt tcaccctagggcgtcatgaagttttgaccaatgacacgtgacaggttctcctccaatcagaaaacgtctttgatttggga ggtataacaatagaccatgtcaggttcagactgtaagaagtctctaatttcgggcaaaaatatgagagtggacaaaatac acttgtgcaaaaatcagaggatgtgtgacatgcagaaaacaccagagatattgtgtgctcccctcgtcgcatttccttca agttttgcatgtgtgtgtgtatactgggtcctttgctattcctaattgattttaatgatctctctcatggatcattgtgc caaggatggttgctggtgacacaaactttacactattggctaaaaagttattgttggctgaaagccaatgaagcttagtt taaatgttgccaaaacagagctaatgttagttgggccaaagcagagattagctgtccaaaatgaagacgttgaaataaga attgacattcaaatcatcaagaaagttagacataccaaatccttgggtgtcaccacagatgctcaactgacctggtgcaa atgctttgaagaaataaacaggaaggtatcctcagctataggtgcccccaaatgggtgtgaccttttatttcaaaagaaa ctgccattcaaataattatttataatgcttgcattgtgccacattttgattactggattcaggtttgggactgttttgct acttcagtgataagctccaaaaattaatcgcagaatcttgaatctagagtaattacaaaattgccttttgatatgaattt agaccacctcccatccacccttacctgggagaggctagcaataaataattctacaagagaaacagaaagccttgatgtat aaagcattgaatggtcttgtcctggagtatcttcatcatcttttcgctcagtgttaatctagttataacctgagaaaact gactttgccaaaacccgagaactaattatttaaagcaaagcttctcctataggggggccatggtatggaataacttgtcc agtagcctcaaaaaagggagatctgtcgttcaatttaagtgaaatctaaagaaggtatccaacttatcgaattcccacat ggcagacatttaaagcagtttacttgtaactgatgattttctgtgttaagaataaagcattacaatacaatagaatacaa ttcagtgaactttaatacttaatggatgtgagagattttttttcataccaatattgctttaaaatattttgtcctatata actcttacctaccaagtgtgatgttcatactgtaaggtacagaccaagttttttcccattaatttatggcccaagtgcag agtgcacaggccataaatcaatggaaaaaaaatgaggatccataacttacagtacagactaagcaaaacaaggtcagtaa ggtatttattatatgaggttaataagttgtgcaggaaattaaaggaaaggaaactagtttagggggccatacagtggaat actacctgcaaaattgatcagtcacagcatgcataccaactaagagatataatgaagacttttattgttttatcttcaag ctttcctgtgtcttgccattggtgtgtttccaaggagtgcaatcttcctcatggagaattatgtaactctactttacagc attataattcttgtagtttgatggtaaatcacacattccgtagtgctggcaaatactgtgtcaacattggactgatgaat gatgtgagtgcaactaacacttcttttatggtcaaaattccaggtaaggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttagta cactatatttaatcttcatgcagtcccattgagctctccctacccccacccatcctctttgtcagtctttcgttagggtt aagtggtgggatgggtccacggataattattgaaatggactactgaaccttgtttcaaaagagcctacaggacattctgg ccaatctatttaagaatagcagcccctgcagtgttaatctttcaattcaaaatcattattgtctgccatggtattttcta aaaatcattgagtgcctacaaactgtattgttggtaaggtaagtcttaaccaataacaaagcaattttatgttattttgc agatgagagtcccagtccaaaagaaaggcctcgaaaaggcccttttgagggaacaaaaacaataactattgttctggtct ttgctgcgatcattttgttgtttgcagcaaatatagcagtgcgtaagttagtgtcttcgaggcgagtgaaggctgctgaa aaagctgactttgaatttagagattatgacgctctgagtgtttcatctggtaacactgtgtgttcttcaaggtttaaatt ttggtccatccaaaggtctttggaaactgctcccttttgcaaagaatctcgattgtatacattctaacttgtggaaaaat aatgcaacacatttcatgtgtttcatgtttgacttcaatagttttgtacatacatgttgatgttccgtggcagatcaagg gaggggcccaaaggcctgggtcccccttattttggttaaaaaagaaaagaaaaaaatgcag |
Protein
Protein ID | aug_v2a.11683.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11683.t1 MQPSVCLFLTALVLVVFPCGLLCSLSGDFKVLIWKNGPVIVGETTSFHGVVVLNSKPEEGGTLETDKNVKCEFSWNVSSH SWIDRRTTDECHSSFNWRWTECRNHTVFVSVGIYYGRDVEQEENVSSRYKSYHVTNQTSVSVSVKEKQASVFSCHLAIKS FAGLKLPPDKPPYNLPKNSPVEFEVQFKDPQKLVTNVSTDWAFHSQKWNVLHYIVTDWPNGTMYHMFPEMGVYMAEVTVR ATLKGNQKWSLIFVKKLIVKDPVSLKVQHKHLKHKDKTIRFNISCNGSFPVSCHWCVSKECNLPHGELCNSTLQHYNSCS LMVNHTFRSAGKYCVNIGLMNDVSATNTSFMVKIPDESPSPKERPRKGPFEGTKTITIVLVFAAIILLFAANIAVRKLVS SRRVKAAEKADFEFRDYDALSVSSGNTVCSSRFKFWSIQRSLETAPFCKESRLYTF* |