Gene
Gene Model ID | aug_v2a.11685 |
---|---|
Locus | scaf4583 : 59276 ... 62032 : + |
To GenomeBrowser | scaf4583:59276..62032 |
Genes list of scaffold | scaf4583 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
endonuclease v isoform x2 | GO:0000287 GO:0003727 GO:0005730 GO:0005737 GO:0006281 GO:0016888 GO:0016891 GO:0043566 GO:0090502 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.11685.t2 | gi|635093375|ref|XP_008011378.1| | PREDICTED: endonuclease V isoform X4 [Chlorocebus sabaeus] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.11685.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11685.t1 acatttaactttccataaatttattttgtttcaaaatgtcggaattggaggaagaagaggttgaaacttggaaaaggtta gtttaggtttacaagctaattcaaaacatagttagtagactatgttcaaaatttctgtcaatataaagttaaatcccagc agaaagagttcttctgactatccaaaattgcaagtatgatatgggcttgaaatacgaagacgtagtataatattattaat atggctggaactgtaaccactcatttcagagaacaaattgagctcagaaagaaagttgtgaccgtggattgtgtcccatg gagtgaaccagacagagatcgtgaattcagtgctctgaagcttattggtggtgtggacatatcttttcccaagggagata caaaacatgcttgcgcctgtttagtcgtgttgagttttccagagcttaaggtaaagccaacttctcagtaaatttgattt ttactcgagaagatctgtttaaagttgtcgtcttagtcccacaaaatcagagttccaaataaatcacaaatgatccccaa atttttgctgcaatctgatggactgacgagtaacgtgtattttgttggcactcttggaggatcttagaagagtttgaatc ccattggtagcctctattttttatttccaactcgaaacttcagacactcctagctaaggtcatgtgtatgctaaaatgag attatctttcacagaaaacaactaaggtttgccgaaagagttttaggcctttacagattgttctaatcagtgcttctgga aaggatttgcaagatttttattgatctcccagttcatttttcttttgtttttgtttagattgtctatgaggacttaagga tggttcacttgacatttccctatgtgcgagaatatttggcttttagagaactcaaatttcttgttgaactaatttcaaca atgaaaaagcaaaaaccaaatatctttcctcaggttaagttactcattttgcatctaatattttatattgtttgaataat gtaattgttttaataatagacaaaaagtcatttggaaacaatatgatgtcatccccctgacatttttacaatacctgaga acttagcagccttaatcaaatgtaattgtgcgctttttgtgtatttttaggccatattggttgatggaaatggaatgctc catccaagaggtattttaggattttagattaaaaaaaaaacgtacttaattaaaccaagtgaagtttttacaaggtcact gtccagtttgtccttttaatttttaaagggctcactgattgttcgtactttgcttgcccacattttggttatgaattcag aaatgcttctaactaataggacatatatccactgaaactgaacgtttgtttggtaaagcatcataagtcaagtgtggtgg tgggttgggtgaagtgaacttgctagcattaacaagctgtacctgtgacagagagtgcagacttgcttggtcgcggaaaa aacatatgcttaaattttatacccacaaaaaaaggatcaagaacaaattctgtctttgttatcccatttgcaagttttga gaaaaaaaaattttcatcaaaaccagggataactgtctatttacaatttaatttctgttggtttgttattttttcttatt ttttgtcaattaccattttagattttggaatagcttgtcaccttggagttgtaacagatattcccacagtgggtgtagcc aaaaaactcttccatgtggatggactagaacacaattctcaacatactgaccaggttagaaattcccattaccttaattt catgtagggttactcatttgctgaaattattgaaatagaaaagctacaaggcaatttcattgttctcgttgtcaggcact actggggatgcagggatggcacagtggtgagagcactcgcctcccaccaatgtggcgtgggttcgattcccagatctggc atcatatgtgggttgagtttgttggttctcttctctgcaccgagaggtttcccctctcctaaaaaaaacaccatttgact tgatttgtgttaattgttaatttgaatttacagtgttcccaattagtgctccagctagagcgactagacacttaaataaa gttcctttcctttactaagagatgatatttccctcaaactccatccatcctggcttaaagagacattgcccaaattactg ttttctttcagaagtttttttctttttttctctcctcccctaataagtaaaacaaaaaagggatagcagccttgttggta acctcagtgagtatgaaggaaaacgtttcaatcatttacgttcagaaagaaaaatttatgtgacaaatcggtgttttgac tgttgccatgtgttttttttcttttttatgtctcaaaattttgtaacattgctttttaattgctggtgatcaacagatta gaaatgaactcaaggtcagtggagacagttttcctcttcaaggttcttctggtaaaatctggggaaaggtaatcactgaa actgttttttaataaatttgtatgccatttttttttcatggagcttccgcttttacaagtcaatcatttcccattcataa aggaaacgtttgtaaatcttgggtgatagttttctaactgatggtccatagacctaatcagctaactcaatgttgtaccc aattcaaaccctttgggaatagagcaatttgtttcag |
|
Transcript ID | aug_v2a.11685.t2 |
Definition | - |
>aug_v2a.11685.t2 acatttaactttccataaatttattttgtttcaaaatgtcggaattggaggaagaagaggttgaaacttggaaaaggtta gtttaggtttacaagctaattcaaaacatagttagtagactatgttcaaaatttctgtcaatataaagttaaatcccagc agaaagagttcttctgactatccaaaattgcaagtatgatatgggcttgaaatacgaagacgtagtataatattattaat atggctggaactgtaaccactcatttcagagaacaaattgagctcagaaagaaagttgtgaccgtggattgtgtcccatg gagtgaaccagacagagatcgtgaattcagtgctctgaagcttattggtggtgtggacatatcttttcccaagggagata caaaacatgcttgcgcctgtttagtcgtgttgagttttccagagcttaaggtaaagccaacttctcagtaaatttgattt ttactcgagaagatctgtttaaagttgtcgtcttagtcccacaaaatcagagttccaaataaatcacaaatgatccccaa atttttgctgcaatctgatggactgacgagtaacgtgtattttgttggcactcttggaggatcttagaagagtttgaatc ccattggtagcctctattttttatttccaactcgaaacttcagacactcctagctaaggtcatgtgtatgctaaaatgag attatctttcacagaaaacaactaaggtttgccgaaagagttttaggcctttacagattgttctaatcagtgcttctgga aaggatttgcaagatttttattgatctcccagttcatttttcttttgtttttgtttagattgtctatgaggacttaagga tggttcacttgacatttccctatgtgcgagaatatttggcttttagagaactcaaatttcttgttgaactaatttcaaca atgaaaaagcaaaaaccaaatatctttcctcaggttaagttactcattttgcatctaatattttatattgtttgaataat gtaattgttttaataatagacaaaaagtcatttggaaacaatatgatgtcatccccctgacatttttacaatacctgaga acttagcagccttaatcaaatgtaattgtgcgctttttgtgtatttttaggccatattggttgatggaaatggaatgctc catccaagaggtattttaggattttagattaaaaaaaaaacgtacttaattaaaccaagtgaagtttttacaaggtcact gtccagtttgtccttttaatttttaaagggctcactgattgttcgtactttgcttgcccacattttggttatgaattcag aaatgcttctaactaataggacatatatccactgaaactgaacgtttgtttggtaaagcatcataagtcaagtgtggtgg tgggttgggtgaagtgaacttgctagcattaacaagctgtacctgtgacagagagtgcagacttgcttggtcgcggaaaa aacatatgcttaaattttatacccacaaaaaaaggatcaagaacaaattctgtctttgttatcccatttgcaagttttga gaaaaaaaaattttcatcaaaaccagggataactgtctatttacaatttaatttctgttggtttgttattttttcttatt ttttgtcaattaccattttagattttggaatagcttgtcaccttggagttgtaacagatattcccacagtgggtgtagcc aaaaaactcttccatgtggatggactagaacacaattctcaacatactgaccaggttagaaattcccattaccttaattt catgtagggttactcatttgctgaaattattgaaatagaaaagctacaaggcaatttcattgttctcgttgtcaggcact actggggatgcagggatggcacagtggtgagagcactcgcctcccaccaatgtggcgtgggttcgattcccagatctggc atcatatgtgggttgagtttgttggttctcttctctgcaccgagaggtttcccctctcctaaaaaaaacaccatttgact tgatttgtgttaattgttaatttgaatttacagtgttcccaattagtgctccagctagagcgactagacacttaaataaa gttcctttcctttactaagagatgatatttccctcaaactccatccatcctggcttaaagagacattgcccaaattactg ttttctttcagaagtttttttctttttttctctcctcccctaataagtaaaacaaaaaagggatagcagccttgttggta acctcagtgagtatgaaggaaaacgtttcaatcatttacgttcagaaagaaaaatttatgtgacaa |
Protein
Protein ID | aug_v2a.11685.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.11685.t1 MSELEEEEVETWKREQIELRKKVVTVDCVPWSEPDRDREFSALKLIGGVDISFPKGDTKHACACLVVLSFPELKIVYEDL RMVHLTFPYVREYLAFRELKFLVELISTMKKQKPNIFPQAILVDGNGMLHPRDFGIACHLGVVTDIPTVGVAKKLFHVDG LEHNSQHTDQIRNELKVSGDSFPLQGSSGKIWGKVITETVF* |
|
Protein ID | aug_v2a.11685.t2 |
Definition | - |
>aug_v2a.11685.t2 MSELEEEEVETWKREQIELRKKVVTVDCVPWSEPDRDREFSALKLIGGVDISFPKGDTKHACACLVVLSFPELKIVYEDL RMVHLTFPYVREYLAFRELKFLVELISTMKKQKPNIFPQAILVDGNGMLHPRDFGIACHLGVVTDIPTVGVAKKLFHVDG LEHNSQHTDQ* |