Gene
Gene Model ID | aug_v2a.11934 |
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Locus | scaf4695 : 21086 ... 25964 : + |
To GenomeBrowser | scaf4695:21086..25964 |
Genes list of scaffold | scaf4695 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
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Gene name | Adi-Retrovirus-related 18-2 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 18-1. This gene model contains RVT_1 domain. |
mRNA evidence |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.11934.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.11934.t1 cgatagttgatttgttgaggtttgcttccactaataaatcgtaaacttcatggacaaggatactgcggaaggtaaagcta tctcggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattgtgccctgcaaaggatgtaacttgtaacagctgtcacaa aagaggacattttcaagctgtttgtctctccaagaaacaggtggcgaaacgtacatccatcaacgaagtagcagatcttg aagaagtcgaagtccctttcctcggtgaaatttgctgcagtgaagcaaacttctggactgccattgtaaaggtggacggt catgagacacactttaagttggatacaggagcagcagtttccatcgtgagcgataaggagccctggcagattttaagagg tctgggcggtaccactctatcggttgtcggcacctttcgagccaccctgacatataaagagcgtcagacttgtgaaactg tctttgtgttagaagatcagctctattcccttctcagaaagaaagcttgtgtggatctgtgtttaatcgcccgaattgga gaggtgaacactcagccaacaaatttcattggagcatttcctcagcttttcagtggtctggggaaactggaaaccaagta tcagatcaagctcaatccaaatgtaaagccagtttgcctctatactccaaggaaaatacctcacccattgttgcctaaag tgaaaaacgaaattgattctatgcttcgacaaggagtcatttctcccgttaccttccccacagagtggtgctccggcatt gtcccggtcccaaaacctaatgggcgtgtacggatctgtgtagacctgactccactgaacaaagcagtgcagcgcgaaac tcatcccatgggttctgttgacgaaagcctggccatgctgggtgaaagcagaatattcacgaaattggacgccaatagcg gtttcttgcaaattcctttggatgacgactcaaaattgttgaccacctttatcagccccttcgcccgtttttgcttcaac cgcttgccctttggaattagttccgcacctgaaatatttcagcgaaccatgtcagacatcttgggggaccttgatggagt catatgccggatggacgatatccttatccatggaagaaaccatgtacaacatgatgcacgtgttcgagcagttttgcttt gtctgcaaagggccggactaacattgaacattcagaagtgtgagttcttgcaaggaagactcaagttcttaggacacatt gtggatgcccagggcgtccatgctgacccagagaagacacgtgctatcggccactttccaacacccacaactgtaacaga attacagagatttatgggcatggtgaaccaactgggaaagtttgtccctggcctagccgacatcaatgcacccttacggc aactccttcgcaaagacagtgcttggtactgggatgaagctcagcaaagagcgtttcagaaagtcaaagagaagcttgca tcacctgaaatccttgcacattacaaccccaaccgtcaaacagttattgccgcagatgcatcatcaacagggctgggagc agttcttcttcaaaaacaagataatggacagcgtcgtccaatctgctacatctccagatcccttagtgaggctgaaagga actatgcagtcatcgagagggaagcgctcgcctcaacctgggcatgcgaacggcttgaagagtacgtccttggactcagg tttactctggaaacagatcacaagccacttgttccactcctcactacaacagacttgtccaagatgccccctcgcatagt gcggttccgcctgcgaatgatgcgatacaatccagaagtcttgcacgttactggtaaatgtcaaatttcagctgatgcac tttcacgtgctccagttagctctcgaaatatgttcatcaagttcattgaagaggttgaagcctttgctggctccacaatg gaccaacttcctgccactgctcagcgccttcaagaaatcatagaagctcagagaaatgatgaagtatgcatgcaagtcag agggtactgccaaacgggttggccggcctacatgtcccatcaacctctactcaggccatattgggaaagcagagctcact tggcagtcgttgacgatcttctcctctacgatgaacgcatcgtaatcccacaagtttttagattggacatactagactgc atccatcgcggccaccttggcattagcaaatgccgtgcgagagctcgaatgtcagtttggtggcctgggctatcggtagc catcgaagacatggtcaaagcttgtttcacatgtgcaaaggagctgccagaacccaaggagccccttatgccgtcatctt ttcccagcctcccttgggagaggattagtatggacttgttcgagtataaaggacgaagatactttatcactgttgactgc tattccagatgggtcgaaatcaaacttctcacaacacaaactgcaaagagtgtgatcacagctgccaaggaactattttc aacccatggtataccagatatagtgatttccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaagtggggactctggatggatcagagaccagggttgcctaatacaa gagcacacccagcatcctcgctcctttatcgttgaaacagagaagggcacactacgatgtaacagatccgcccttgtcaa agctgagttgccgtccccttcaaaagtggacaagcaaacccctttcaccagtactgcaagcggccatgctgttcaagata cagagaaatgactagtccatctaacctcccgtgtactaccaccgaagctccaatgaaacctgttcctagtcaatcggctc cattacaaacacgttcaggcagagttgttaagccacctgatcgattgaacgtctagactaatatatgtgactttaccag |
Protein
Protein ID | aug_v2a.11934.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.11934.t1 MDKDTAEGHFQAVCLSKKQVAKRTSINEVADLEEVEVPFLGEICCSEANFWTAIVKVDGHETHFKLDTGAAVSIVSDKEP WQILRGLGGTTLSVVGTFRATLTYKERQTCETVFVLEDQLYSLLRKKACVDLCLIARIGEVNTQPTNFIGAFPQLFSGLG KLETKYQIKLNPNVKPVCLYTPRKIPHPLLPKVKNEIDSMLRQGVISPVTFPTEWCSGIVPVPKPNGRVRICVDLTPLNK AVQRETHPMGSVDESLAMLGESRIFTKLDANSGFLQIPLDDDSKLLTTFISPFARFCFNRLPFGISSAPEIFQRTMSDIL GDLDGVICRMDDILIHGRNHVQHDARVRAVLLCLQRAGLTLNIQKCEFLQGRLKFLGHIVDAQGVHADPEKTRAIGHFPT PTTVTELQRFMGMVNQLGKFVPGLADINAPLRQLLRKDSAWYWDEAQQRAFQKVKEKLASPEILAHYNPNRQTVIAADAS STGLGAVLLQKQDNGQRRPICYISRSLSEAERNYAVIEREALASTWACERLEEYVLGLRFTLETDHKPLVPLLTTTDLSK MPPRIVRFRLRMMRYNPEVLHVTGKCQISADALSRAPVSSRNMFIKFIEEVEAFAGSTMDQLPATAQRLQEIIEAQRNDE VCMQVRGYCQTGWPAYMSHQPLLRPYWESRAHLAVVDDLLLYDERIVIPQVFRLDILDCIHRGHLGISKCRARARMSVWW PGLSVAIEDMVKACFTCAKELPEPKEPLMPSSFPSLPWERISMDLFEYKGRRYFITVDCYSRWVEIKLLTTQTAKSVITA AKELFSTHEKGTLRCNRSALVKAELPSPSKVDKQTPFTSTASGHAVQDTEK* |