Gene
Gene Model ID | aug_v2a.12826 |
---|---|
Locus | scaf5146 : 70626 ... 79274 : + |
To GenomeBrowser | scaf5146:70626..79274 |
Genes list of scaffold | scaf5146 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.12826.t1 | gi|156387844|ref|XP_001634412.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.12826.t1 | gi|584012748|ref|XP_006801264.1| | PREDICTED: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial-like [Neolamprologus brichardi] | 8.40779e-45 |
aug_v2a.12826.t1 | gi|573899917|ref|XP_006637688.1| | PREDICTED: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial-like [Lepisosteus oculatus] | 1.96182e-44 |
aug_v2a.12826.t1 | gi|724841727|ref|XP_010365061.1| | PREDICTED: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial isoform X3 [Rhinopithecus roxellana] | 7.00649e-43 |
aug_v2a.12826.t1 | gi|699593253|ref|XP_009867208.1| | PREDICTED: 28S ribosomal protein S22, mitochondrial, partial [Apaloderma vittatum] | 8.00141e-43 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.12826.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.12826.t1 gtcgagctgagtggatgagtgggatctgtctcatatggtctaggggccgacttatctctccctccctgcctgtcggtgac gataggtatctgaaccttggctcacaaaagcgacccacgggccgaaatctcgggggaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatatgaaaatttcat gttgtcatgtcacaaaacacaaattaatattaattttcctcattcatcaagcaatcaaatcattgatttgtggcattgtc attgtcaaatcttaaactccctattaaggtttccaagagtgcatgtgggcttgtcatttcttacaattgaaggggtgtgt ggaataaggccttaagggacttttgatgcaatgtcaaattctcctagtcattcacaactgaatacaaggaaatttggaag gagaatctggtaatttatcagaagtcacttttctccaggcacccctgcaattactctaaggttaaaatcagctattttaa ttttttcattgcaggcccaagaagaggttgaaaggaaagccgagcatttgcttgagatgccaccagtaatggaagagagg caagagatcgatgaagtgttggaacaaaatgatgaattggcttgttactcagagtcacgttatgtttttactgatataag cacaagcgtctgtgacagggtgagaaaaataaaacaaaaaaattatttcagacagatctgccaggtgatctggtgacgta attcggaggactggaatgaaaaattttaacgccgtatgccacaatcgcgcgcggccttattttcgaattcaacatggcag aggcgaggtctacttgaatgttcattcagtaacaggaaatgtggtagacacggaatgatctcttgagttttggcgatgga aatgctgcaggtagtttgaaaacaacacctaaggccgcgcgcggttgtgggatacggcgttagaatttttcttcccagtc ctccaaattacgtcaccagatcacctggtgtatggtgcagggaaattacttttcagttatgggtaataatgaaggtagtt tcatgaccaagatttcaaaagtcaataactcagtgatggagcatgtgaggaaatcatccataaccagaatcacaggttta ccttgtttcgagaaagacaatgttgaaaaacatcatgtctctacagactattattgataataatatttattgtttaattc aagataaaacttcacagcattttggctctggtggaagccatgcagaaatttaggtaaacccagaaggtgaccaccagcta ctgtaccctcaaaattaaaataatgatcaaagataaaaattatgatgatgatgtggtgctctcaactctttcttgcagag cagatcagtaacaataagagaaccagatggaaaattgcggaaagcaacttgggaagaacgagataggatgaatcttatct attttccaaagacaggaagaagacatgaaatgcctgagctactcaaagatgaaaacttgaaggtattattaaatcgtatt cttaaatggaagccattaaattattcttttgtttatgtgctgatcagaccaactagcctcattctaaagcagacatgccc aaagtctggccatcgacccaaatccgacccgtgtccaaattttcaccagcccgaagtgtcctgtcataaaatcaatgata tgtggccagcacaattttccatcgtaaacaatacacacataccaaaaacagaaattttatatttcaccagaactgaactt cacccatttttttatggcttttatagcccacagaactagcgatgactcatagctcattgacctgttcacgtcttcattac atattcacatccttgccacgtgttcacgcctgtccaataactatggtcttccagaaccttcttgacctttcacctgttct agtttgtttgaatcatagttaactgcatggtcagcaggcccatgcattttcacctgaccaaatctggcactcttttcaaa aaatgtggacagcactgttctaaaggaacatgtcttttgtatattgtctgtgctaatggggctagtgggtctaattagca taaagaaaaaaacaccccagcctctttgtcgctagattacaggcatgcgccacaatgcccgctgccatgtatgcatttcg tgtatttaaaaaaatggatggttgtctctcttttgttgctttttccagcagtgatgacagagcttagttaaatttattta gccgtgagttaaatgatttttcttcttgcagattatgtttcagcagaatcagcatgaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatntcttttggatttcaataggacttg ttaagatctttatttcctgcataataacacaccgaggaaaaaatatctttaattagttggcaccgtccttaattctagca aacaaaaacttaaagtaattaaaaataatgaaatttctagttcctaaagaaaccgtgaaacatgaagatttagttttatt aaacaagttgataaaggagaaattatgacagtgaaaaatttggaaagctgaaattttgagtgttaacctttttgttatat tagagaaatcatttcactccaacaaagggtgctcctttttttatcaggtacatcaaaggacttatgatgacattgtcttc agtaaaaaatttgatctgttgagatcaacaagacattttggagggcttgtgtattacctggccaaagctcaacggatcat ggaattgctggaagacatgatggctaaagaactgtaagggcaattaccatttgtgagaactggctggctggataatttag ccagtctgcaaagggaatgcgtcagtaattctcacaaactgatcattgccagtaactttgttgaccgttaagtgactgta aaagtttttttcccccactgattcttaactcccacttaaactaagctattttgaattgtcttcacagattggatgactgt ttagaggtagtgaagcttcaccatcttgtcaatccacacagctccatagcagatcagtctgctaggaataatttaaaagg attttctttgttacgggtgagtagtacagaggcactgttttagcgacgtttggagctggtcatttgtgggttctaatgag cccatgaggaatgaatgtgaaatgaccagttcccaatgtcgccagcttcatacttctgttggttagagggtcgcaacggt attgtaaggtcatgggttcaaatcctgttgaagtcctgactttttcaggcttctatatatgcaattgcataaattacgtt cataactgcaaggatcatagcttacttgatatattcttttattcctgaaattcctcttattgcagcattttgaatttaat gaatgaatgaatgtgtatttatataccgcacatatcacataattatcgtctcatggcgggttgcagttcttattgagtga catcgaacgtcagcttgtattatagtatataatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacagaaaattgtctaaattc tgattaagagtaaggtcagtatcttctagaactcataatcttgaaaattatcacacacaccaatcttggttttctaaaag aattttatgttggtacatttggaaaaacttggttcaacaaaatgtctactgcttttaacaattttagcattttgcttccg ttgagttattatattcagcattcattgcataacttgaagttttaaccttattacccattatgatgctaatgtgggggcta cctaacagcagacagtacaggttttggaatttcaaatcccactttttgaaactctgtaacagagagaaacgagactgtct gtacccacaatcaaataattctcttaggctgtgtattcagcaagatttgaaagaagctttgttttcttttttgtcaaaac attgtagaacataagacatgttccagattgtttgaaggaaaaaatacaaagtcaatgactgtacactgcaagaagaaatg cacacgtcatgcgagactcagggaacactcaacatgaggggagcacggaaaactttccgcattccggtcgtgtcctgtat cctaccagtctcacatgtccttgtgtaattttctcgcttgtctttctctcgctgaaatttgagacaacttgtagtttgca atgactgatgcattttcagctgtataattttgtgcaaacaaaggttatttgccaatgcaacttgttgaattattttgttc acccttcacaaattcttgcagctttaattgagaagcaatgacatgtgattagatgatgcagctgcttgtgggcacagtct atgtggaaaatttgagaacaagttcaaatgattaaaatactgctgcacaggctgcttcaacatattgcatagtgtatcac nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatacagatttatcaagatttcagcccacgttaattcgtagataaatacacaagaac tatttaacttttccatcacttgtcactaagcgtggaattgactgctctccataactaggatttcctcttgctattgtgaa acaaaattctgctatagcttattggccacaaatttatttgaggcagatgaaagtcgccaatgaaaacaatttccatgaca gataatttgtttatcaatttggaaatgtcctttgcaactctacaccgatgatcaaaatgaactaacttccatagaaatta gctttttggtaaggttggttcagtcgaaaaaaagacaacccaaccctttagtctctacgtagttcagaataagcaatatt gcaacttaagcaacactgtcttttctaagatggacggcaacttgagcagtaggcgcccctaaagctactggcaaattgtt gatgttagagctagcttacacaatacagacacaatgttgagcaattaaggcccataaatttaaaggtaataataaccaaa aactattcactgaggtgaaggtaaaataataagtattatatcagtagacacctcgcaagttgaaaaaatagcaccaaaaa ctacttcatctgtgacaagtgaaaaatttttagagctttgcatgccacttgacgctaagaggtgaataaaataattatat aatcacctc |
Protein
Protein ID | aug_v2a.12826.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.12826.t1 MPPVMEERQEIDEVLEQNDELACYSESRYVFTDISTSVCDRSRSVTIREPDGKLRKATWEERDRMNLIYFPKTGRRHEMP ELLKDENLKIIKKFDLLRSTRHFGGLVYYLAKAQRIMELLEDMMAKELLDDCLEVVKLHHLVNPHSSIADQSARNNLKGF SLLRSKVSIF* |