Gene
Gene Model ID | aug_v2a.13570 |
---|---|
Locus | scaf5549 : 20606 ... 30175 : + |
To GenomeBrowser | scaf5549:20606..30175 |
Genes list of scaffold | scaf5549 |
Manual annotation
Study field | Cytoskelton |
---|---|
Gene name | Actin Domain Containing Gene20 |
Description | This gene model shows homology with Homo sapiens ARP1 actin related protein 1, alpha-centractin. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
alpha-centractin isoform x1 | GO:0005524 GO:0005737 GO:0005813 GO:0005869 GO:0070062 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.13570.t1 | gi|156405461|ref|XP_001640750.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.13570.t1 | gi|260826410|ref|XP_002608158.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_125875 [Branchiostoma floridae] | 0.0 |
aug_v2a.13570.t1 | gi|632984260|ref|XP_007909052.1| | PREDICTED: alpha-centractin isoform X1 [Callorhinchus milii] | 0.0 |
aug_v2a.13570.t1 | gi|591385016|ref|XP_007066959.1| | PREDICTED: alpha-centractin [Chelonia mydas] | 0.0 |
aug_v2a.13570.t1 | gi|148226057|ref|NP_001086482.1| | ARP1 actin-related protein 1 homolog A, centractin alpha [Xenopus laevis] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.13570.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.13570.t1 atgtaaagaaggcttgtcggccattttccattttgaaaaccaatttatgtctcttgaagtgaatttagatgtaaatatcc cttgatcaggactatggatcagtttgacgtgatagcaaatcaacccatagtaatcgataatgtaatgccgagccttctgt catttttagtagacgtaaccttggtttcctgcaccaagggtttggatatcgaaatttagagacacaccaaggagatttat ttaccaacctatatattgttattattattattcacagggatcaggagttatcaaagctgggtttgccggagatcaaaccc ccaaatatcattttcctaacttgtgagtataattgcaattttgtcgtcttctttataagggttttgcaatgtagttagtt atggctaattaaatcacttgtgtggtagacagagcattataatttaattgtggcctaactcaggagtgggccatttattt ttaagaggaggactttgagaaatttcccttttcggtccccttaaagtcctacagtaaagtagttgtggaatgcacacaag tcataattgagaatgttccggaaaaaagagacccatttttagcatacatagttgcaactaagcaaaaagaaataattgct acaatgtttgaatatgtgataattatctctggaagctgcacaaaattaaaaattcttcatgtagagcagattttatctgt gcaatatatgtatagtaatgtttgatgcaatcattatgctctgcattgtttactttatcctttccttgcaagtccgattc ataagttgagcataattttgaaatgatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactggaatgtatgcagtttcctacaagtgacatgtt tgaattgtgtttaccggatctcttttagcatggtgttgtaagagattggaatgatatggaaagaatatggcaggtgagat aaccaataggtaattctgtggcaaatttacggattgttaacttgttttaattattggcctgtaatatttccttattgtct gtacacagtatatttattcaaaagatcagcttcagacgttttcagaggaggtaaaattttctgtttattttgtgtctttt gctcttaaaattaatgtaaaaaatcttatgatattttgatttttgcttccgggactttacttgttttgtttttttggctt ttttagcatcctgttttattaacagaagctccccttaatccaaggagaaacagagaaaaagcagcagaggtcagcataaa attctgtttcttgttaaattgtcaatttcctaatctaagtattaaaaatattattgccttttagaactgttttttaacct ttctatattagcaataaatctagcaaaaatgtttttttacatttttttacattctgcaatgaggggcatcatacttttag caggagtgtgttgctttaatagaccactttagggcactgagggtccgtatggaatgagctatgaagtaggtggggagcaa tcaaacattgaaaaaagtgttttccaagaattgctaagaatggagagatgggaacaaggatacagcttggtctgataaaa tcgatttgtcttcatgatgacttctcaatgggtttaggatgagagtcactcagttttgattagtttttaactcatggcaa actgtgatgtgcagtttgtaatggttggaatgaaaagattttccacaaatacagttagatattatttttatatccaagtg gtgtaaaataaggaaatcttccctaagatgagatgttcaaactaataataattcattttattattagtttgaacatctca gcataggaaatattcattttattgctgcattttttgattgcttgcattacttttctctgtattgaaaccacatcacacac tctaccaccactaagtatgtgtaaaagaatttgtacttcagtgaagcattttgagactttattcattttccttagatatt ctttgagacgttcaacgtgcctgccctattcatatctatgcaagcagtgcttagtctgtgagtaatgtttggttattatc ttaacctgtgcttaagaactgtcacaaggggaagttggttgcctgtagaatatccaagggtgtcttataattctctaccc tcgtgtaatgcctaacacctgtgataaaaacaggagaagcccaacgcttatttgtatgtccttcttcgtattgtactacc caaagaccctagggattctaaacatgtgcaaaattaatgaagatactgctgacctcaactaaaggacaagtgctccttgt tgtgcactctgttaaattacggtcaccctctgcttttgtccttgtcaataacactagtttacagtgtgcctgatgaaaga tgtgtctcaggttagaaacctgacaaaactggctgtttgacctgactcagtgaaagttagatttaagccccggggggggg tgggggggcactgccatatatgggccatataggtatgtgccactgtgaagggtatagattttatctagacttaggaagcc aggaattgctcctcaaaaatataaacaaatgaaatcggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatagtttgtacttaatttcattaaaattttccaacaatataagaaatggaa ccatataaaaagcttaattttcgcaccaaattacaactaccatatcataatcttttgctaaaaaaaattccttttcttcc ccatgccaataatcttgtttcatcatattctcattaatacctgtaatgtgaactcgcattttcatcagctcctgtatgtc cgtgtctcgttattttagagtggtgtgctgcaatgaaatgttcacaggttcaagttcagtctaagcctagatattgctca gacttctctatacacctgtcaaccttgcataattcattattttgattaactattgcttcaaagcaattttttttttttga cctctggagcatttggagcattggattttagatatgtatctccattgttttgatcatagtaaattaaattcagaataaat taaatgttccacggaatttcgctccccaaataaactgttgcgcgaaacttcgcttacccaagcgaaattttaagcgaaat tttgttgtccgtagaacaaaatgccatgcaaaatttcgcatgtttgaacgaaatttcaatgatatgggaacaataggtgc atcaaaatatcgacgaaaattcgctttcttcaaaatatcgcacaatttcggcaaatttcgtcaaaattcactctgattac ttttgcacgatactgtaaaactgcatgtgcccgcacggtgagcattgacacggtacgcattttgtaatttacatggtaag catgtcatagttggcacggtatccgtgttaatatatacccgcacgaaggctattgtttctaccgtgttgtctaacacaag ggaaatttttaatgagcaaaatcctaacgcggtcgttccgtgttaactcctgcatcttttgtcttaccgtgcgaacgtgt cgtgcgcctgtcatcaccaaagtggctaaaatcctgtggacggtcacagtatgccctgtgtgacttgtcttggagaaaag cattggattcttaaactgaaggaaagtttttttcatttttggtttgcagatatgcaactggtcgcaccacaggtgtagtg ttagattctggtgatggggtctcacactctgtgccaatctacgaaggcttcgcaatgccgcattccataatgaggacgga tattgctggcaggtcagtgtgcaccgaaaatgctgtcatgcacctggatgcatttgttgcttgtgaaaggcaaacagtgg ttttcttcctcctgatttactgtacatcaaccttgtgtgcaatgtgaagagctaatttttcatgttttttattcaacaga gatattacaacttttctaaggttgcttttaagaaaagaaggtttcaactttcattcttcttcagagatggaaatagtgag aactattaaggaggtaaggcctaacactgttgctatggcattcatccgaagggtcagggttaaagaatcaagctcaatat tattattattgaaatcatttgtgtgcaatggtcattgattagagaagacttaaatgctagatcatcaaaaaaaaaaannn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgtttttgataatctggcattgtaatgatttcatgctttcagctggtcactaattagagg aattttaattattcaaaataattgttatcattaatagccattattatgtatatacaactacttactgtaagatgctctag cagttgagttggtgcaaaatctgtgaattttcttaattccttttgcaagtggcaaaggggaattgtgttaggttcgtttt acaaaacactgttatgactcgctctggcgaagggctaatgctcgaaacatcagctttctaaatctttcacggtggtaatt caacctttatcaactcgtttgataaaaccaaaattactgttatgttactacagttttgaatttcattgcagcgtgtttgt tacctggcattgaacccacagaaagaggtgagagcttggtatttacacagttctgcttgggctgatcattatcactagtg tgaatggattgtttgtattaatttactcttgatatttttatactacattatgttttcataagtagtgtatggttaatttc aaagattgaagagaaatgtcttttaaatgtaatgttgaactctcactcaacaggaatcaatagatagtgaaagaatacag tacgtgttgccagatggaagcatgttggaggtaatgtgatgatagtcttggagatcagagcatcatccaaaaaacctttg gcaaatgcattggtaggattggatacatttctttgaccctgttatggttaactctggaaaagaatacttgttttatgttt ttaggttggtcctgcacgtttcagagcaccagaacttctctttagacctgatcttgtgggtgaagagtgtgaaggaatcc atgaggtgagaatatgatccccttacaacatagtctctctatggataattaacaattctttgatgagcgcgcattgaata tgagatgatagatagccaaggaggcgggtagcgccgagttggctataatcgtctcatatcgatccaatgagcgcaagtgg aataattattgttttattaaaactgcccccaagatatgagacaaatcttctaataggttaatgacttccctttcattcaa caccggtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccctggttggtcaagtcgttctgtc gctattcctagtgagtgaccgcctcgatttatggaacactagtgtatgcacaagcggtggtggcgaggacgtgggaaagt tctcacttgcttgcaacctagcttggaccctttcttaccaaggacattttgtggtcacacaagttcgataagcaagacat acttgctgttgtacaccgcacatcgaaaatggcggccaattaaattattcctttgtttgcatgttaattagcactctatg cctcgtcagcaccaataaaacaaaataattttgaagtgaaaatgaggcaaagagggctaataaacttgcaaacaaaagaa tgatttatttgccaccatcttggaataaggtgtatggagtcaagaaatctctagtgtggtctgattgcacagtcacgaag tggtccgcatgcccaacttatgcattaatggtaaagcagggtcattttaaggaaagcaaatgtaagtaattggaacagtg agagaagttaacagcaataaagttaccgttaatatatttgagtactcgtg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.13570.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.13570.t1 MDQFDVIANQPIVIDNGSGVIKAGFAGDQTPKYHFPNLDWNDMERIWQYIYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRRNREK AAEIFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVSHSVPIYEGFAMPHSIMRTDIAGRDITTFLRLLLRKEGF NFHSSSEMEIVRTIKERVCYLALNPQKEESIDSERIQYVLPDGSMLEVGPARFRAPELLFRPDLVGEECEGIHECMHKRW WRGRGKVLTCLQPSLDPFLPRTFCGHTSSISKTYLLLYTAHRKWRPIKLFLCLHVN* |