Gene
Gene Model ID | aug_v2a.14163 |
---|---|
Locus | scaf5884 : 6417 ... 18845 : - |
To GenomeBrowser | scaf5884:6417..18845 |
Genes list of scaffold | scaf5884 |
Manual annotation
Study field | Cell Cycle |
---|---|
Gene name | Adi-cdk20-2 |
Description | Named thus because this protein shows similarity with Homo sapiens cyclin dependent kinase 20 by the BLASTP search. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
cyclin-dependent kinase 20-like | GO:0004693 GO:0005524 GO:0005634 GO:0005737 GO:0005929 GO:0006468 GO:0007049 GO:0007275 GO:0051301 GO:0060271 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.14163.t1 | gi|597763938|ref|XP_007245900.1| | PREDICTED: cyclin-dependent kinase 20-like isoform X1 [Astyanax mexicanus] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.14163.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.14163.t1 gtaattcgctccagttcactcgtccaacatggcggcgttttcaagactgtttacgcgactgttgcgatagcacttcctgc catttttgcatcgccaagaatttaaaagtcgtgaaaaacttaagttttacccaaccatgaaaggcttttcatgcgaaggg atttttacctgaggctcgatctcgattaaatacgttttctgctgttgccatggagcactacggtcagtatacaattcttg gaaacatcggggaaggagctcacggaatcgttttcaaagcgaagcacatcgaggttagcttcattttatcgaagaggatt tttttttatcctaaaattcagaaatttttaatgggatttattcttatgataccaggaggagagctgtgtcacggttgtta gagatgaataattgtttttatattttgtcgtttatttataaatctgtttttaaatttgggtatagttttgttctagagct aaataaattatacattgtagttaatttagttgtaaatttagttgtattggttagatgactgagcgacttgtcagtattaa aaaaagttaattgatgtacagttgaaatatgtggttgaaggaagtttatccacagaatacatttggttcttagtgactgt ttttagatcttaaaaaggaagtttgaagagactaatgtccatggctcaattgacctctttagcttgaatgttttatccag acaatgtgatagtctgaagggactacatagttatgctttcattttgtgcgtgtatagaagattaaatttaatttcaaagg aactgttccaaggggtatcatctcatgttcatcactggaaaaaaaatcttaaggctgaagagtttgtagttgctttttaa tagcatgacttaggtcgagcatgaatgcattctataaaggttgtgttcctttaagccaatctaaatctagattttacgat ctaaaactctatttttttgttccattaaagaccaaacaatctaagattgcaatctgaacgatccacctccaaacatggat cattcagattggtatctccatctggtttgagatgtttgttccttttagctgaaacagcctggatcccaatcgtgaagtcc aaggttgtgtttctttaagccaatgtaaatcagattttgtgatcgaaaattcgattttttgttccattgaagaccaaacc aatctaagattggtaatcaatcttttttcagatgttcgttctggctagcaagaaaatccaattaatctggattgtcttaa tccaaaaaaagactggctaaagggattgcaaccaaaatggtcaattacccagactttgtggttgcagtggttataacgct gttgtcaaagctaatagcacagactgttaaaaccatgcattagtacttaaacaagggttatataattttatagctactgt catatctcaagaattcactcagttattatccagagaaagtactagcttatatgaagataaaagtctgtgacttagaacag ttagaaaagggcgaataattttgccagtcttcagacagagtttcaagcatcagccttaattatattcacggaaaaaccaa tagtgcagcacatggcaatttagcatgctcctttaatgatcccatcgttattcttctacctgaatgcaaatggatatatg tttttccctcttttaaaagtaaagcatcgtactaatgctacagctctagagtacagattctcaatttgttcacaagaaga ttttcaggagctggtttcaataatactattatgttaacctgacaaattgagcatttcaaattaatgcagttgttgtttac taaattaaatttcattgattttacatggagtctaatcttcagtgactagctctcatccaaattatgccagttgtgtagca tcctaaaatggagacagtatgcaactggtatgtaacatatttttgagcaatttactcaattgattgtgcattaggggaga atttctcatctgtgaagaaactggagacatgcttcttgtcaaatcttactctttttgccaatgcatccactactcaattt ttcaaacactccaggattatcgcaatgactatttttttcaaacatacttgttttgacagagtggagaaattgttgccctg aagaaagtgcccttgagaaaactggaagatgggattcctaacacagctttaaggtatctgcaatgatcaaataattttct taaaatactcagtgcaagtctgcatttgtcacacatcatggtgattttatgctatggcaatttgaagaacctatgggttt tccacgtgtagaatttgttgtctaagacctacgctcaacggcaaaatgtgtgaacaatagatgaagataatgaggaaaac acagtacaatccatcagtgccgaacctcaaaaagattttaatgagcaagtggcatttaatcgaaaatcaaccattgctga gagaaatatataaaaaaccacctttcatctcctacaaaagattaaaatctctgggagacatacttgtcagagccaaactc caaaggtcagagacctatcacatcacgaaacagcgggagtcgtgtgtggcctgtcaacccctttaatctctttagatcat tgttctttaatacttgttacaatcgttgtgaaaacgtggttcaaatcacagcatgtagttgtgaacttaaactggtatgt taaatttactgcatctacagccttattgggctgtgcatttacaaaaggattagttaattaatatttgcatcatccttaat cccatcgtttccttgaccattcaattttttttccttttatttatactagagaaataaaggcattgcaggaaatagaagat aatcaaaatgtgcgtaataaattttcttacttttatgttatgattcatacccttgcctaagtagctttatatcgtgtaaa ttactatgatcgtaagatgattatgaagcacctgttttgagtgtcagcccttagtcactttgaagttgtttaaaagtaaa ctcgtctgtgcctcattttttcaaaccacttctccgtgtttggatatctgatgaaacaatattctctcgtggggctctat atcacctgttagtaaaatccaactagtggtctatcatcaatgctgcattctgattggttgagctactagtaggctatatg ttatagcccactagtagcgaaaagtgcccgccatatttttaatgttttggcggaaaaaatgattgatgtcatagctttaa cttgcaaaagatgtttagtctcgatatttttttgaccaactagttggattttactaaaacaattattcctctcgccctca tagcctctgagtcaatagcccacgaggccgaaggccgaatgggctattgactcagagcccattcaggctcgaagaataat tgttaattgtaaactgctgcagattttataatgatgacaagagaaacaacagagggaaggccaaattcattggacagcct gcaaagtggaaggttaaaccaaaaatggctgggttgaatgacctttaattatcattcaactgaaatagtgcagtgcatgt aagtattgcataatgaggctttacattgctcacccttctaaatgtcatcttttttgtttataggttgtgaagttgattga tgtgtttccttatggaacaggatttgtgttagtgtttgagtacatgctatcagatctgtctgaagttctacgcaactcag acaagcccttgacagaggcaagtgcacagtaaaaactagaataccattttttttttgcaaatgactgtaaaaaatgaata gtcttttccatatgaaagatggaattgctttaaatcacccaggtgtggatgataaaaatgatggtacctgttgctaagtc accataatttacatgtctctttcattttcacaatgttgtgccgtttcttcaccatccacgttttgcaaattttaccttat ctttctttccagttacagtatacagtaaatgttgcaattttatttgttgacttacacgcccgtggaaatcggccgtgttt ttgaagcaaagcaaccaaagaaacattgaaaaagactattgtttgtgcggaagaaaagattcccgggtgactgttattaa ggatgcctttattagaggcacaaatttggctgccgtgatattgtgtgaaaacaagtactgcgcaaatttagcacgatttg tgttctggtattaaaagaccacaagggtatttggaaaaataagaatttgaagcgactatctccagttttccttggtaaat tgtgtaaaactcgtgttgctatttctttcagtaatactatttgaaaagtttgaaataactacattcataaatttcaaaac tgagctgaaacaacactgctcacagctaaaaagattacagaaatttctcaatggtggtagaaaattctagcaaaaatttg tggtattgtgtttgcttcaggctcagatcaaaagttacatgctgatgttgctgaaaggtgtggcattttgtcacgaaaat tccataatgcacagagtaggtattagactgcaagtgatctcgtttaggtaagagacagaggaacgggcaaaatacctgcg cgcacgccagactcgctgattttcggccctccctcgcgtgtcctcgggtgtccgtgtattttttccgctcttctgtttcc tgccgaagttactgtaaacatcttgcagcctttgtatgtattgaacgactaaagcaacacaaaagtattgcttcattttc agagacgatcattgcagtttccttggccattgcgacatttgtggcttattgccaagatcaacggaatcgtcttgtcaatg caaataacataattggtttggtgtagggatatcaaagttaatgatctcgatatgacagagttgattgtaggtaaccctca ccaacttaagggcagaaatttggcaaaaattgtgaaaggtagcggaaggtgtaagacgaaaacaatcgaaatttggggct atttcgttttaaaaaacctggcaatttggagttttcagagggctgtgggactctaaaacatgcgccgtaaccggtgcaca gcggaacacactaacagtcgacccatggtgtgaattctacctccaccactcgctataactcgctcattgcgcttcgctca ttcacgagttcaaaacgatgagcttttgctaagaatcttgcctattccaataaaaaatttcgttgcgatccgtcaggacc taaagccggccaatttgctgatcagctctactggacatttgaagatagctgactttggtctggcgagagtgttccgcaac gaagccaacaggcaatacagccatcaagttgctacaaggtaaaggctgataagatgtggtgcttcgatgatgtctcggga aactaaaaatgagacaaaagttgctgtaatgatcctcttatatccgctccaaatttaaggttttaacgacaacgtgaacc cccaacagtaaatctttcaatctctatatttaattctacggcgcctcctaccggtccttgtttagcgtaatttatcaaca aaatagaatgcgagcaaaaaccaataattgcaaaatagtcatcattgtgcaaactccctattgttggaacaccgaggtga acagtatcgcagaggtcataatttcaaatcccttttcaagcctgaatttatcccgctttcattcctttgtttcctaatta actttcataaacggaactatttagttgcgtcttattcaccggcagttaccaaaattctgagatccttagctctaattaac aattaaacccgtagcccgaaagggctacgggtcaatagcccatgaggcgaagccgaatgggctattgatccatggccctt gagagcgaagggtttaattgttttagtatcacccaactagtcgggcagaaaaaagcaataataaattcagcaaagaaaaa tatttatttgggaataaaacgaaatagtaaataggtttacaaaaccggcgaacttcgctactcgatgactattactaata gacctatagtagcatagccaatcaaaatgcaggatttgcattagtccactagttgggtgatactaattctatttattgct taaggtttgctttgttttatgtcttttgtttgtttcgttctttgtttcaaggtggtaccgagcacctgaactgttgtatg gagcgaggcagtacgatgaaggagttgacctctggtgagaagcagttctttttgttgtaaaatcattggtactccttccc tcttggtttctgttcttgcctttcactagcttgcaccgtagcgttcatttaaagtaacaggcaatttgaaaacctcagac atcgctctgacgaagggctaacgtacgaaacgtcagctttccaaatgtttcacggtgataattcggcctttatcaagtcg tttgataaagccaaatttttttggtttcactctcccatcgaagtatgccaaaattttccctagaaactagttatttaaaa acgaccacggcaaagataacgccttggtagaaagaggaaaaatcgtggggtacattgttagcgtttgaaagtgcggtaga ttctgcatgcgcgtgcggcacattgtgctcctttggcacgagcggctgttcgctgcaaatttgtaggtttgacggcaaga cgaaccgacgaaagtaaatatttcatttctccttttggaatgaaatttattcgcgcagacccagttccgaggtaaacgct tcgagcgttagcctttcgctttaacgaatggctaacaatggctggccaacttagttatctacccttttgataattcatga ctgtttctttcaccagtctaacgcccacgcagcaccagtttctttagaaaacgcttaccttgttctttagttatgggatt ggcagtgtttgacttcaagagtagttgtttctaccagtttgacccgcataaattcctatagatattggtaggatgtgact gttgtaggaatcgtgtttcatgtcgtatctattagttcctagtatgacccaaatagtggactaatgcaaatcctgcattt tgattggcaacgctactaggggtctaatagtaatagtcatcgagtagcgaaattcgcagggtttttctttggttttttcc cctaaaaaatatttcttcaacttgcattttctaactttattattgccttttctgtccaagtagttgggtgatactaaaac aattaaacccttcgccctcaaaggccacggatcaatagcccattcggcttcgcctcatgggctattgacccgtagccctt tcgggctacgggtctaattgttaattagtttggtactgtttaatctgcctgatcataaagtgaaactgagttgaatgaat ttaaaacgaccgaggtgaatttttttgtctgtcgtgccaaacaattaaaacacgctattattgttcgatccgtaatcctt aaatatattttttttggtttgttttttttgttttcccttatttttctgtagggcggttggctgtatttttggcgaacttc tcaacaattcacccttgtttccagtaagtgaccttttttctgtctgtccacttgcgtgtactctataactaggccagcag ttcagtgattagctgaaatttctttcagggtgaaagtgacattacacagctgtactgtgtgttaagggttcttggaacac caacacaaggccaggtatgtgacaaaaaacgactagccttattgagttagcagggagaaattcctaagcataccaaagtc agtcttgaaagcatggctatcattatggaggcgagcaaaagcgcaaccgtgacattttcgtgtcattcaactgaaaagaa ttgcgacccaattacacaacgtagaattcacttcttactagctctctcccatttcgttgcgaaaaaaaaccctcattgct tgtggaatgtgtagcgtcactctgttttccttgtaagaatataacggttttgtgctgtgcttatttgttgctccgttttc gctcaactcaagtgaacgcttttaccagcgcagttaagggaacaaatacgaaagatttctgtccttgcgtttttacattt tcgtcagccaggcttaaatagcggagggtaaaattggtattggctctgttgcacgctggattacataccttgagggaatc tgatcagttgagtgaatttagttctgagaagtctaccttagatggcgaacgagccagcatctgagtatcattgatgctgt ttttttgtaaacatcgttgatgctgtttcttttttgtaaacaaatttaggcatcatatcattgactttgcagtcttgagg ggttaattggcagcgagctgcctgtttccttagctcaagtgcgaggcatttgttatcacgttaaagacgttaagataaat tatgcatgaacctcactgtccacattcgggaacccaggaagacgagaggccttcaacagctatattaatgccacggtgaa ttcatactaagctacctctaggttcacacggggcttactttcctaaagagtccttcatcttaattgccacgttttttttt ctttttacggagatacatcccttcgcctatagcaaagactttgtgccatttccttatagggatgtcaatttttatgctcc cttaaacttaatgaaaccaaaggttgttttgtcccctagccatgttagctcgaggcaggcatctaccctgagatgacgtc acaaactgctgtcctggacaatttgtgaccttaactcaataactcaatgtagagcaatacatacttttaccgccgcgaaa caaactcctcttgtatgggccaaacagcaaaaattaacttgaaatgtctgttttatggcgttgaaatttgacattgatga tttaaaaccttttgagattagggaaggtcttgctctaagtattcatcgacttgtttgtcgcagatcttttcaaaaatccg tgcaatttttcttagggaatgacagagctgcctgactacaataagattgttttcccagaaatgcctcccattccactaga aacaattgttccggacgtatcaccagaggtttgtagtcgatttcattagcgagttcacgaagttgcgacggctgctgcaa cgaaaacgcctacaattcaaaatagaatttcgcggttggttaagagttttgcgattagtccaggttggtcacgttgtacg cttccttagcacgaatggttttcatgtgaaggcaaaaaatttaagatttactgctgcgggctcgcggtgttgtcagaatt tcacgtggtcgtttgtcaaataacgtcaaaatctgcatgaaaaagcgtgcggcacgaacagcacgattatttttcctcat tcaacgtcaacgtcgttgtgtagacgccctaatagggagagtgcttgcgaacaatgacctgattggttgatggagcaaaa ataattgtgccgcacgtgcaacacgcatttaaggacatttatatgacgtagtcttccaaatggcaacgtgaaatttccaa atttaaggttttaacgagaacgtgaacacagaacatgcagtaaatctttcattctctatattagggagcttaagcaaaca cgacgtcgatagaagcgagaacgtcatctgaaaatgtaacttagcgtttctgctatcatttttcaattatttaaagtcat tatgtttgaaaaatttcttctaactgtcctggaattaatttggaaccagcgcttgggacataagaagacaaaattgaaca ttcgtaatcatatgcttacgtcgtccaaacaattgcaaaacaggtcatttcacgtcgtagaaagaacgagaacgacttca aaatgtcaaaagatgaaaaatgcacgtgcaaagcgtgcaaaaatactgtttttcattgtcaaacatgcaaatttgtgggg tttttgttgccgtcgtcgtcgtggttgcttaagctccctatttacttcagcagcccttctaccagtcaccctgaagccat ccgcgtgctttgtcaacattatagaatgagagcaggaagcgataatctcaaaatatatttactctgccgtaaccgacgta gccaggctcttaaactccctagtttgacattggagaagggcccatccaattttaccaattttctttggcttaaactgctg tttagatttagttcttgttgtcttgacagagattgccagttccaaccgaacgaaccctcccattttttctttcacttgga tttccgcagccgttttcaaatgactatcgaaaaatcaatgccaaaatatttactctgaccaatcacaacaggagcaaaca gtgcgattaaccaatcaaactttcttgcggtttcctgtcacttgctcaaagcgctggaaaaagtgcgcgcgcaaaggatg tgaacggtcttggtttgcttctcaccggcttgttgaaaaactggcgcgaaatttttgagcctatcactacaagtagcaat cacaatcgcgtaatttctttgaacagtcatttgaaaactactctaacagagaacagctaggaaattcatctaaatggaat aaaaaatgatatgctgccgatacttttcacggaaaacaggtttctctgaagctagctgtggtctaatgacacttattttt tctgtttcttctaggctatcgatttagtcaaacgattcttagtttatccttcaaaggagagaatttctgcatcagaggta agttccttcaacaatttacagggaaatttattttcaaaatccctttgcgcttttgacttcgtgatcagcgtgcaacgttg caaaggtatctcaaacagggagttcaagcaacgaagatggcgaaggcaatgattacatcaccaataaattatatgattgg ttgaatgagcaaatataatcgtgctgcacgtgcagcatgcatttaagtacattaagagagcttaagcaaagatgagtaac ttcgttcttctgcaatcatttctcaattattcaaagttattacgctggcaaaattagttcttactatcttggaattaaat tggaaccagcgcttcagagataagaagacaaaatttgtcgtcgcatgctcacctggtccacacaacagcaaaacagttca tttttgtcgcggaaagatcgagaatgtctgcaaaatgttttaaaatgagaaatgcacgtgcaaagcgtgcaaaactgttg tttttcattgtcaaatatgcaaatttgtgatgtccttgtttgctgtcgtcgtggtggttgcgtaagcttcctattcgttt aacgtagtctgaaaaggaagaagtgaattttttttttcatattggatgttcttaagacaactttagcccgcataacagga aatctttcattctctaccttaacatgaaaaaatattcgtgacagtcaagtgaaaggacacttcgtttttcttacaatgtg atcaacatgaaataattacagaacccttaacctatcacaaagttctattttgaagggtgtttttgttgcagcagtcgtcg tagcttttttaacaccctaataagaaacatcgaccgaaaaaaaaaaaagattacaaatggatggtatgattggttggaag aaaaatagtagtgctgatttagaacatttccgcctcgttgcaaaaaacctggtgaaattaccccattccaagctctctgg ttatatttgtcgtagatcaatttataactcttgtttgtttgaaatagcgctagctgttccttggtgtacaaccttcgttc ttggttattatttttttcttcatctcttgtacttcaggccttacttcatccttactttttcacgaggccactcccagctc accactcggagcttcccataccggcacgcaacgcacgcaggacttcagggcgaggccagttgcgtcgtgcgtttgacatc gatgttcccatggagaaatcactggtaaaccctgcattacttgtgcacaatgttgcagggatgcctaactttcaaccgtg ataagtaagccttttcaaagttggccgcgtagaaatggaaatcgatggagtagccggttggagggtaaactctagagtca tttaaccagacatctatcgatgcatcccagtattcaaccgattctctgtgccacgaggtcaattttgcaccctttcatcg ttttatgaccatttcacgcgatttcttcagtacccactgcctgctcccgtgtggtcttactcagtcagcagactataggc ctggctaaattaggaaacattgttgcgcaaacattatcgcggatggaaatgtttcccagtttagccgcgcggggaacatg tgttgcggaaacaaattttgctgctcgga |
Protein
Protein ID | aug_v2a.14163.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.14163.t1 MEHYGQYTILGNIGEGAHGIVFKAKHIESGEIVALKKVPLRKLEDGIPNTALREIKALQEIEDNQNVVKLIDVFPYGTGF VLVFEYMLSDLSEVLRNSDKPLTEAQIKSYMLMLLKGVAFCHENSIMHRDLKPANLLISSTGHLKIADFGLARVFRNEAN RQYSHQVATRWYRAPELLYGARQYDEGVDLWAVGCIFGELLNNSPLFPGESDITQLYCVLRVLGTPTQGQGMTELPDYNK IVFPEMPPIPLETIVPDVSPEAIDLVKRFLVYPSKERISASEALLHPYFFTRPLPAHHSELPIPARNARRTSGRGQLRRA FDIDVPMEKSLVNPALLVHNVAGMPNFQP* |