Gene
Gene Model ID | aug_v2a.15253 |
---|---|
Locus | scaf6450 : 29096 ... 35820 : + |
To GenomeBrowser | scaf6450:29096..35820 |
Genes list of scaffold | scaf6450 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
sideroflexin-5 isoform x4 | GO:0006811 GO:0015075 GO:0031966 GO:0055085 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.15253.t1 | gi|156390218|ref|XP_001635168.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 9.0e-33 |
aug_v2a.15253.t1 | gi|530368293|ref|XP_005264705.1| | PREDICTED: sideroflexin-5 isoform X13 [Homo sapiens] | 4.0e-31 |
aug_v2a.15253.t1 | gi|194378280|dbj|BAG57890.1| | unnamed protein product [Homo sapiens] | 8.0e-31 |
aug_v2a.15253.t1 | gi|678010260|ref|XP_009080816.1| | PREDICTED: sideroflexin-5-like [Acanthisitta chloris] | 9.0e-31 |
aug_v2a.15253.t1 | gi|698441582|ref|XP_009699099.1| | PREDICTED: sideroflexin-5 [Cariama cristata] | 1.0e-30 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.15253.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.15253.t1 gattcctgttcctgcatatatctctagaaagccagatcaagagcctacaaactttaaggtcagctgtaattcaaaatggt gtcttctataccgtctgcagggtttcctaagttttctctcactgattcacgtttcgatgaggtaaatattctcattttgt ggtaaaaatattttttttgtcagtttttaatggtattattaaatgttccaaaaattttttgattacgtttacacatagaa aacttactggggaagattgaagagatgcctagatgtaacagatccaagaactttgtttgttggggaggtctgataatctg atagattattatgtaaataatttactgtttggtagattcgtggctcacctgaaaatgacgtttacattaattttgattct aatccgtttccattttgggtcgcttcattcataattcctcaccaccccattaaggcctggctaaactaggaaacattgtt gcggattctaatgtttccaaatttagccgcgtgggaaacaagtgttgcggaaacaaattatgctgctcagaaacaagaaa atctttttatctggagtcaaaaacatttttgcttcccggacacaaagtttgcgtccgaaacatatgtttcccagtttagc taccccgggaaacataacaagaaacattgtttccgcatcattgtttccttgtttagccaggcctttacagcgggtagaaa ttccactccctaccttaaccaaaccaaaattggacggttcatgtaatgattactttttttctactctttgagnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtttttctgcagaaaaagcttcaagattctattagtctgctaacacagttta aaaatgggacattgcctcatggaactacggatcaaaaggtgactgaattctcatctttaaacctgatgactgtctcctga ttcttggttactttaatgcttaggcagacataccctttttaagtacatgactatctttcttttgcttttattttagcttt gggaggctagaaaagtaaaggaggttagtttcaaaatagcttattgtttataatcaaatcttattgtcctgttactaaag aactgaataagtgaatataaggtaaaacatagatttataacatcaagattgctttctaaaatttagatttttttctaaac tttagaaattttcaaaaatttaatgtagagctcagagctgcaggttgagaaatggttcggtgcaaggtggattgcagtcc tgtacaagcctgaataattgttcagcctttctttgaacttcttcctgactttaatttgttatctttactgtgacgttctt tctaacctcttaggaatttcattctcttgcaggccatcatacatcccgatacagggaaaaaaatatttatgccctttaga atgtcaggtatatcatatcaaccacgctggaattcgatgcatatttttatattgtttggtaacagtgttgtttaagcaat ctgacacctttcttgagttttctttttacgttgtcctctataggttatgttccttttgggactgtgacggtaagtttggg aattttgattcatacatgaagttaaagataaatttatcatcattaggccatcagttaatttagcagcaannnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacctccactccttttcatctttcagtggatgaatcaaagtcacaatgcagcagtg aattactcaaacagaaatgcaagcaaggtcagtataaatgtacaagaataattaattttagttatcatttttccatgtgg atgtaatacttattataataagcaccctgtttaccttctgttttcttttcaccactcttcaaagtgatagtgagagaagc ggtgttgtgaatgattacaactcacacaggacttgaaattttggggatcctgatcttaataggccttgttgtaaccacca gctaaaataatattgttcttggcagcccctggttccactcctcaacttgggtttctcaagttatatattatgattctggt gcttttttcaccagcccagaaaagattggagagtggcaattaaatacatctactaaggatgataaaatgttcaacatgga aattagaatacatcatttttaaaactccaacaatcacaaaaacctcgattgaaaaggatcatttgggtacggaagccatt ttcagactcgaagaaggcttctgcacagattgtcgaaacattggtcgccaacagcagtccttctcaagacttcagtgacc catatgatccttttcaatcaagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn ncccccccaaaaaatgagtacataaatatatgcaactaaggtaataaataattgtgatataataatgatggaataaataa ttagtaaaacttaaactttagcagagatataattatttgcagcgtcattaattgttcaaggccagaaactgtatttgtac tcatcacatgatgtttgtaccggaataaacttccttggatcaaagtttgaaattaggaggcgtcaacttgactcagctct cacgtgttcacctgttttccaggtgttgtatcttgtaatgattgcgttttcaaagcgctattttttatttcctttcattc tcaggccgtgttcgaaacaaccttaactagggtatttcttccgctaccagctttggttatccctccattagtcatgcagt ttttggaaaggtgagaacagagttattaatgatttgtgaccaagaaaaactcagtaaaagcagtgaagcacatgaccttc tgatttctaaattggatgctcagttaatagactaatcggcacgaattggcgctttggctgaaaatctcacctctaccaag cagatgaaactcgaagtcattgtcacgtcatctgcatttattcccgcggtttttgcaaactccgcgcattgattggttcg tttattttagtagctggggttgtgttggtgagtgttctagagagggactgtttatttatttttgcttgaaattactactt gaataaaacatgcgtgttgcatttgtacgacgggacccagatgttcaaaggttggttagagctatccagcagataaatca ctattcactaaatgcgtgcttcgaaagcctattgatacacgaaagtcatgtatttgaagtgcagaatgaaacgaagtttg aagtgttgattatcgcagtcttaaactttagttcaactggtggagtactgcatcagcatcgtagtggtcaggttcgaatc gcgtacaggcctgaatttttcaggccttcctcgttactgagtaatatgtagcgtaaaaaaaaacttcaaacttcgttaat acctctctaatagatagtgatttaatatctgatcaatagtgctttacaccctcggaacaacttgggccagaaagttttgg tgtgaagcactcactcatatgtcgacggttttctattttcgccgaaatctttaagcgttcagtgtcttgtccagttgaat tctttcgtacagacgtcgacctcgtggccattgtcgttaagttttaaacgactggctaatgctggaatcgctcatgtcta ttcacaggacaaagttcttgatgaaacgtccaaggctccattttcctgttcaagtactggtttgtgtggcttcttttggc ttcggccttcctcttgcgatagctcttttcccacagatatccaaggttagcgttgagatgtactctcattcataataaat gtcacgaagtgtaccttgattagtttaaaacaattcctcagtactgttcttcttttacgtatcgatttttcaggtttcgc catcaactctagagccagaaattcagaaaaacaccgaagagaccacactgtactacaacaagggactttaacgggcaagg catagtaacttcttcatgtgatggagttgcaaatcttccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnn |
Protein
Protein ID | aug_v2a.15253.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.15253.t1 MSGYVPFGTVTAVFETTLTRVFLPLPALVIPPLVMQFLERTKFLMKRPRLHFPVQVLVCVASFGFGLPLAIALFPQISKV SPSTLEPEIQKNTEETTLYYNKGL* |