Gene
Gene Model ID | aug_v2a.15985 |
---|---|
Locus | scaf7234 : 2836 ... 10844 : + |
To GenomeBrowser | scaf7234:2836..10844 |
Genes list of scaffold | scaf7234 |
Manual annotation
Study field | Apoptosis |
---|---|
Gene name | Caspase8 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.15985.t1 | gi|340369969|ref|XP_003383519.1| | PREDICTED: caspase-3-like [Amphimedon queenslandica] | 4.06377e-44 |
aug_v2a.15985.t1 | gi|260819622|ref|XP_002605135.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_194931 [Branchiostoma floridae] | 7.0e-39 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.15985.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.15985.t1 tggctaatattcccgctcttttcaaatgggaataaataaggtctttgtccattgagggaagaataaggaagctctttgga gtcaggatggctgcaaattcatccttcgcggtcgtcatttcaagggcagaagcacactatcagggtcatacttcagtcgt taattgtttgaagtgtacatatcatgccgatgttcacgaatttcgaccgtacggtgttccctttcggttgaataacgaag aggatgggttcatttttcataacagtttcttaagaaagcaagaaataaatgaaggcacggttatcgagaccttcagtgga tgttatttcagcaaaaataccggctttcaattggtaagcttgtagtttgacgattcctggttgtggaataatctccattc tgattgatattggttttggtgatgatgatcatgatacaggaacatgcgtttgaaatgtggattagaatgaagaatcagga gaatgagaggtcagggttctcattcccgttcaaaattcaggcctttctcgctgctgcttaagtagcactgaaatgcgatg atcaaattcattcatattactttcttaaggaaaagtatttctattactatataacatcgttattgttgattaattaaaga agatatttgtaatttcatgttctcaatgaattgttttgatatctttgatttgtagtggcttttggcattacctaccacta caaaagcacagctttcaatttaaacaagtgttcatgatcgtgaacgtttagcaagcactttggcattgttgtatttaaag gtcgatttgattcattgcacctttagtttattattaagatgatttccgcacaacattcgagcaataatggcaaaaattaa gttaccaaaaaatcctcttagcatggtaataatttggataaaggtaagaagatcctatcgagatttaagctctcaagctg accccgcgagagaaaattgaacttgaagttatccatatttcagttaaaaaggacatttcgcgttagttgtaaacacagta acactcgcttttagcattcttacgaagttggacattaaatttctcgagaatgcttggggatttcatcgcggggtcactta gagaactgaattaaaatgagatgttttaaatagcattcaagaagttagcgtgctgtgagtagatttttagtaaataattt ttgcaagtaattgctcgaactttgaacggaatccgtcttaaactctaaacacatttatgttatggaaacgagatatgtgc agcttatctttgtgatgaacatttgttcaacattcatcaaaaccactgatcacctctaatagctgtagctactaatacta agagcagcacttaatttactttgcagacgtccttaatgcacccatcaatgttaagcccaagggtggagagggggaggggg gcagttagacctaggggaatttgacattttcatggatgcaagagtcaaatcatccaccccaaggtacctgctgaatgtca aattcccttccttggtgtaactttttctatcagagtcaggttataccaacaacagactgtttccttaattaatgttgatt tccaattccttcttaacaaattgacagaaatgtgccgtcaacgacgagaaaattttttcccgctgggtcttaacattgac tggtgcaaaagttcttaataaacttgaacttaaccttgaacttgactaaacactttctctaaaatgtgcttataaaaaat aatagaaatggaaagcattttgagaagagaaaattattgcataagatcctttattcaaatgtttgactcaagtgagcatc gcaatctcaagaaataaaacatatggctggaaagttttgtcttatgtaggttgtcttgaatttcttcattgtccttcttt ctcctttccttcctttttgtctcaatcaaacatgacaagatgaaattatgatgatgacatttcagaagaagacagctttt gtgcttacttgacactcagctaattggtaatgtaacacagcggcaaacatgctgttaatttacatgcaaatcaacccctc taactcaagattctgaagatcttatgatcagttaaaaggtcaagcatccaatgctctccccaagaattacctgatccagt gtgttttctaactttcattgcaaactaatgctttatgaaattattgtgaatgtcctgaagaatccatgcaaagcagagaa tgagagtttcttgcagttgtatatacagttgttttatttgatttgaattctgaaatcaaactaatgtattaagatcaaac aagttctatctagaataatttcacttaatagatgaagctagagaagcccccccaaaaaggcattgagattcaagagttat tgatgcaagccagcacctactttgtgaagcaaatctcactgcagacacattacctctgctatcataaagtgagagctgat ttttggttcaatcagtggttcgaatgccaggaagacactagttaacctttttgtctgtatttcgtgccaaaagtgatggt gaagttaacaataattttattagtgtcgcaagaaggcatctcaagggaacactctaattgagtgcaatactgcacaaatt tcttctttttctgttgatttcaatattacttgtatgacaagcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnttcataacaagtttactcttgtccctttcaggaagtatctgaaataattcgacacctcaagtttaatgacaa tgaaggtgtagtggtatttagagggattgctgatgcattccctaaagctaccatacaagaaaaaggaattatccagaatg atcgtccacacccctttcatcattatgcactaataagtgtgttgagagctgtcacactggacggtaggatcatagtctca accaggctcggcgaaccaattaatttaagcaacaggagcgtgacctgttacaaaaaaaatattgaaacatttgaagtccc gataaggcaaccagtatctgatgaggacgtaggagacgtaatccttatcgcattgggttcaaaacccaccaaacaaggat actatataggtgtttgtgagggagtactgttgagtgccagctcaagtgatgaagacgatccctcacctatctctggtaag ttaaaaatagttttttttctttcccttcagtactacggtagtgatgaagaattgcagaaatgttcaaattctgctagatt gtttttaagatgttgtgaccaactgcttcaaccagtttcctgggaaagcatagtactaaacaccaaggaataaaagcaat gtttctatttctccagtatttggagctgtgtctgatacagctatccatctttaactgtttgacatagtagaacacaaaca aggcagttgactttcttaaccaaccaaaagcagttcatttcaagggaacatggccccagagtcttcaagcaacctccctc accatggtttaagtcttttgtgcctaatgcacaacttcaacacccccttatacaaggcatttcctcaataactcttttcc tcattgttctagctagttcataatgaaagtgtggtccactctgccattttctggcccacccatttatttcacatgccgtg tgatttttttcattgtcattactatacagttggcagcacttaattaaatttgtttgcatggcaagagtcaatgatatctc ttgtacacataccgtagttttacagaaaggtactaaaaccttggccctaacctaactgtccctttcccttgagttaagga atgtgatattgcaaggttttgccagtgggatggtttaccaaatctcaagtggaacaccaaatttggtccaggggatcatg aaattgagtaatctgatgttcaactgcttgggggttgctaggagtggaggattttgaagttatggatccattagctcatg aaatctttattccttgaaagcaacttactggctaatttaaggacggtgcctactaattaaagatattgtttccccggcgt gtgattatgtaggaaatgtagatcttaacaagtcctattcaaatcaaaaaagaaaattgggggtaaccacgcatttttca aagataattcatgaataatatctgtaaaaaactttgaaatacaaagaaatgtatggcgttctttctcaaattgaagctta attctctctcaaaaatgcatggttacccccaattttctttttggataccaagagtacttactaagatctaccttatccgg taagttttaaacagcgcaaaaatatccctgtattagtaagcattggcgataggaaaccagagtatctggcaatgcacaga acgtgtgcgcaataacaatagtaggcaccgtccttaagttaaaaaaaacactcaaaagttagcttaacagaaacatgact gtttttctttttccagaacctgagtgttacaaaatagacagcaaacccaagggcctctgcttgataattaacaacatgac cttcaaggaaaagaacctcaatcgctatgatgccatctttgacgaggaaaggctacatgatctttttgcaggcaaacttg attttgaagttcatgcgtttaatgacctagacaattgccaaatgcaggcgatctgtacagagtttggtggaaaagaccac tgtcaatatgatgcatttgtgtgcatcattatgtcacatggaacttgtggagataagattaagggtgtaaatgggcgaac aataggtactgtatttcaacaatgtaaagtaaatggcatatttcttagtttgaataaattatgtgtcaaattgatcaatc agtataaataccacaagaaatcatgggtaaaaataaataatttcactcaggtgtaattctatggggctccattttttagt tgataccattttcttttaatgttcatttccaggtgccttcttgatttggattactctttcaatctcagttcatgtttttg ttgttaggtattgatgatttgatgtcagagttcaacatagaaaggtgtccatctcttgccaacaagccaaaacttttctt agttcaggcctgtcgaggcccggcagaggatagattcctatgccccactgacaagagccaagacattgttgacttcacag ttagtgactccacattgtcaagatctatttgcccccaggaaagtgatttcctgttggcctttagtacagtccctggctat gtttcatacagaaggcccaattttggatcattttttatgcaagtgagtagaactgtgtcatcatgttgaaaattaagaac atgatagtggtgtactcaatcgttaatactattgcctgaggaatttattccatctgatcagatgagaacagtgttattta agctaaattttgggacacctacacacgtacttgtaggtagtttaaatctctcagctactcgcagtaataaaaacaaagac agcatgacttaagggtcctgtttgacatagataacattaatgacatggtgaatttcacaattgcccaaattgtaaattgt aattggttcacaataattattttgaaatatcactcagcagtatttggccaaacaaatccaaatccaaaggtaagttagac ttatggatcacatcataaggttcctcaacctcactcataaattatacatattgcgtggatgttgaaagggttatagatca tacagtattagagaggttttcaaatgactgtcaaatgtaattacacaattgctttggttttggatttagttgattttctc attggctctaaaaaatggtgactaatcactctactactattactaaacaagcaaggtattggcattggcttaaccagcaa attcatttaactggtaaatggtttcacttttcctccttgtcagtttgtgaagttgattaaattactctgaattctattgg gtcgtggttggctgaagatggtggttgtaacctacaacctgtatttacaggaatagtgtgcaataattgactgaatgaac tccatgtaaaacaagtttaatagacagtacatgtagtagggtagatataacagtaggcaatgtagataacttttgacaat tgaacgttcgaactgaaataataaacaacataaacttctttgatgcaaataaactgaatcaaatgaatttatcctactaa agagtaagtacagcaaaacttataaccactgagatacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaattactgaaataggccaa aatgaagatattttcaaatgaacaactaagtttaacctcaaattatgaaagaaaaacaacttattacaaattactgaggt gtttccaggaaaaggcatacatgaaacagttgatcctggaaaaacacttccttgagaaaaatgagaagaaggaaacttac tttggtcaacttcttgatagagatgaacaacttttaatagcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttccaaaagaaca gacaactgtcatgtagtgcttgcaaatgatatctgaaagctttatttagtgggtgcttaaataaaaatagaggtaactca ctatgatgtaataatcttaagtaaatgtatagagaaatattgttaatggttttaaactaataattaagattactgtaatt catgttacactatgtaaatatctctcaccttcttagtagcacctatcacacagcacgcccaaccacctcattagcataaa gcactaccgctgcacatttatgtaaattaaacagttactcaattaaagatcagttcttcataatgctaactgagtaaaca ttagaaagataaacaggcatttcaaaccctataacaatggttacactaccactcgaaactattagtgtatttgcatgcga taatgcctcacctttagtgatcacgtttactgtgtaatgactgtggtgggacaaaaatcctcacagaggtaaagacgaaa gcgaccaaatgccgcagtcaattaactgcggtaatgtgctgcaaaaagacaatggttaacattgctcttgtttgcgtcat tgttttcttttacatcacctttttcccaagcagccttcatgtcaacattaatatcaaaggatcaatagcacttgtgaatg gctctgtaattgctttgttgttttggacaatcatttgaaaaccactctactaataaaacattctgttaattgggacaatg taattaataaactctgtcacctaaagaaatttgcaatcacacacacttgttaaatacaatttctaattttcttgccaaat aatggagttaatttgtcttgactgtctgacatggctaagccaccttgtgcaacaatggtgataccatagtaaagagtaaa tctcaggtctcattttcatttcactagctttgcaaatgaagttaccctaactggctggttgcacaatgatggtggtcaaa catgagattggagacatgctccacagatcatgaataaatagagatttgttcctacattcacacacactaacagacaagtg ctctacttattgagtattgagactgcaaatcaacttagatcagatgaaacaaaacaaagttacctatatttcatgccatt actaaaacattttgttttattttttaattaagggcgtagcagatgtatttgaaaaggaccatgataaagatcatgtgtta gacatgctgatgaaagtgaatcgccaagtctctgctgcttcaaatcaggttcctgccatccacagcactttgagattcaa ggtttatttgtaaatgaacagtactgatatcttggcattatcattaaagccttaacagaccaattatgcataaatggctg gaaatatacaagcctgttttgaggagcaatttcagaggttttcaagggcttgggtaccagcaattcatttgaatgttact aatatgaaa |
Protein
Protein ID | aug_v2a.15985.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.15985.t1 MAANSSFAVVISRAEAHYQGHTSVVNCLKCTYHADVHEFRPYGVPFRLNNEEDGFIFHNSFLRKQEINEGTVIETFSGCY FSKNTGFQLEVSEIIRHLKFNDNEGVVVFRGIADAFPKATIQEKGIIQNDRPHPFHHYALISVLRAVTLDGRIIVSTRLG EPINLSNRSVTCYKKNIETFEVPIRQPVSDEDVGDVILIALGSKPTKQGYYIGVCEGVLLSASSSDEDDPSPISEPECYK IDSKPKGLCLIINNMTFKEKNLNRYDAIFDEERLHDLFAGKLDFEVHAFNDLDNCQMQAICTEFGGKDHCQYDAFVCIIM SHGTCGDKIKGVNGRTIGIDDLMSEFNIERCPSLANKPKLFLVQACRGPAEDRFLCPTDKSQDIVDFTVSDSTLSRSICP QESDFLLAFSTVPGYVSYRRPNFGSFFMQGVADVFEKDHDKDHVLDMLMKVNRQVSAASNQVPAIHSTLRFKVYL* |