Gene
Gene Model ID | aug_v2a.17679 |
---|---|
Locus | scaf9094 : 1091 ... 8725 : - |
To GenomeBrowser | scaf9094:1091..8725 |
Genes list of scaffold | scaf9094 |
Manual annotation
Study field | Autophagy |
---|---|
Gene name | ATG13 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.17679.t1 | gi|585662779|ref|XP_006816811.1| | PREDICTED: autophagy-related protein 13-like [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
aug_v2a.17679.t1 | gi|657792123|ref|XP_008322926.1| | PREDICTED: autophagy-related protein 13 [Cynoglossus semilaevis] | 0.0 |
aug_v2a.17679.t1 | gi|432849894|ref|XP_004066665.1| | PREDICTED: autophagy-related protein 13 isoform X2 [Oryzias latipes] | 0.0 |
aug_v2a.17679.t1 | gi|736156576|ref|XP_010773566.1| | PREDICTED: autophagy-related protein 13 isoform X2 [Notothenia coriiceps] | 0.0 |
aug_v2a.17679.t1 | gi|657588782|ref|XP_008298747.1| | PREDICTED: autophagy-related protein 13 isoform X2 [Stegastes partitus] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.17679.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.17679.t1 ttgaggagactggcactgcaaacaagaaatgtttaatggcggctgatgttgacgaaaaacgggtgacaacagcgttggtt tagagcttcaaaactattttcacgctccgttttttgtactaatcatacttgtatcaatggtggaaatggcagagaaattt aagaatcgagaagatcaagaagaacgtgatctcaagaaatatttaaaatttttgtcgttgaaggtaacaactctgaatta cggggaacgaggggaacacatgaagtttcttgtgttttatatactggttctgaagtagtgtacaagaatggtagtcatgg gttatatattctaagtcttcaaacccccggcatagacatcagttcagctattatgaaactgtggttcacattatagtttc ttttgtgtgtttgtcgttttttttatttttatggtatcaatgtaaaaattaattttcattgaaaatgagtcaaataagtg gacacgttgattgttgtgtgtgtgtgtgtttttgtaggctattcaagtaatcgttcagtcccgtcttggtgagaagatcc atacaaagtcgaagccaaattcgatgggccaagactgggtaagattgtctggtgctggaaacgtcatatcagctccgtta tctgttcacggtggaagtttaccccttatcaacttgtttgatagcaaattttagcgtcccacttagcgacgccacactac agtttcaaactaacctttcatgcccttcgactaaagctcaacagtggtaccgtgtgtattagttttcattatagtcttca cgacacagttcacagcagctgtctaatttacccttaagcgacatgtacatattgtattgcattgtgatgcacagctgagc ccacaatggtttattttggcaactgagtttgtttgaaatttgctggtatttgaaccagtagtgtttcattgtcaagatca agaatgattgtgggttagagtgatttaatagttagcaacttcctcagacttatttgtttttgtcttcagttcaaccttgc aataaatgatgatccagatgtttctgctgaagcaaaaaaagtcactaatggaaagcttccttcacaagaaagcccaatgt gtgttgaaatatctctaaaaaccagtgaggtgagatcatttataggagcctttcaggttcaatattcagttgatatagtt gcaaaacaggaacagtagataacaggatataacacaaaatgggctggatgctattacaatttgattccatttgggttttt tgtgctgcccgtgccatcatctttccaatctgttgttgaatcagtcaaatttagtatcaagtggacagtcgcgtctgaaa agttgattctcaatcgtgaatgattttgagaattaaatagtaagtttcatagcttgattttttgagaatcaaattttgga gttgagtttcaagaccatctatcatttacctttttgatgactttatgtatatcaatcttgacaacaactccatgtcaatc aacataaagtgagtgtatttggctgtaatataaaaggagagggattgtgtccaagagctgaaagtacaaaagtaaaaaag gaaatatgttacgattaattttagttaagacctgacacccatgaggctaggttaatgctccagatgaggcaagtctccta aagcttagtgcttgagtatccacattagaaatgagaaagtcactgggtcaacttctaaagaacagtcgtcataacgggct tctattttttccaaattccctagagacaacatccaaaaagtgtcatctctacaggaaataattaccagattaaacattca gcaccgtcttacataattactatttatttttttttccatttaaaaactgacaaagttaactgtttttttctacttgagaa gcaaacatatattaataaaattgttttctagaatattttatctatctattacattggtccataatttacagtatggccct cagcctcggttagtaagtggtatgtagtaaatgttgtgggtctttttttcttttgtaggatgaatcaatggtattggaga cttggtgtcttggtatcaatgatcgagttgattcaaatacaaaagtgacatacacattttacaacaggattggaatgctg ctcaaatctctagtgtcagtcacaagagtaactcctgcctatcaactttcacgaaaacaagggaaagacttcatgatgtg ttacaagtgggtagaagtcatttatgttttttgaaatatgcgatttttgcagaaatctcaaatttcacatacaccagagc aagaagcttgggtgtgttattatttagctaacttttgtgttggttttagagcatgcaagtaagtggtattggacagcagg ggaatatggagctccgttgtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctctaatgtcgtggcctatatcttgttcagtaca aattaagataataattccctggctggctgacacctgccctagttttcttagcaactgagagtattgctttttctccctga atgaaatgtttacccactgtgggaccacccccaggggtttattacttaaagccatttagatacagtacactaatggatca ggagagatgacatttagtcaaatttctttcctgaaaaaggaaacaatgcaatcacaagaccaaacctcaaaggtctgatc tttctatctgaagcccaattttcccacctgtatattattatgtctctacaatttgcaatgtgagcacttatcagatttcc aaatttgatgtgatttttgttgattgttgaaatggtattttatatatttccagggtttattttggtgaggtcaggtttaa ggagttgggagaaggcaagtaaataccggtacttcaaaaaatgcaaaaccataaatttgcttgtcttttaaagcattaag cattaagctattaaattattttgtattgaaatgctgacacctctttacttaaaaaaatgccgacttccgaaatcattacc atttattttcaaggcacaaattggatatgtctaggcaaaatttgactcctggcaatgacttttttcatcatttttatatt gttagtcaaaacagtttgtgagatgtaacatatgctttcaaatttcaaagcgcagttgttgagacctaagttaacccagg attagcagaaacttttgtaaccatttgcctacgaaaccagattgaacaagattgaaaaagtttcttccttaggttttcaa agagatctttatttttctgtcaactttcaaatcagcaaaattcaaattgcttttcttgttttatcttgggttaatgttga aagccgtttgatcaactgggcccacagtaagatatcctggagcttccactgtgggcagccagttccaagatggagactgc actgatggctggcaaaacctgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnggtgatccacaaagatcaacagagtgagccaattgtcgttatggccatcaaagcagtgatctgcaaagat cagcagggcaggcaactgccattatgcgagtaaatctcacacgcaagtacgtggcaatgcaagcccctgcggccccccct cagatcatgaagagtcgagaagaccgctggacccattgcctcgatattaacttagcccaagttacattaagccacattca actttgttaaccagtcgtttatttaacccaacaacaacctttagatttaagtcttccttgtcagattttcgacaatgtgg tatctaacgagttgatgatggtcaaattagcagcttaaggagattgcaaaagctgacgtagagaagattatccttcgcca tgacgaagagctaacgcgcgaagcgtcaacctcgccaacctccctaccaatcgggcatcacagtttctttgagaactaaa acccatcgtttgtctgaagtgttattgtaaaaggataactttgttgtattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttacttaaatgcctttaagaatcgttttctcgcaatttttttatagctatttgctt tgttaccgcaacaaaaccataaccgtgccgtaacaaaaccattcttgttttgatcgcttgtccaaaggtcaacaagttcc accaaacctttaaattggaagcaaatgaaatcaaagggggcttttgtaagtgaaaccgacactcctgtaaaagtaagtat tttcaggtatttgtgaacacgagaggagaatattgaaggaaacgtttggtattttagcacggggttttggtcagagaaga cctaccactccacatccgactggcgaaagacaacccgttaacccttttcctcctatgagtgtcaaatggcacttaataga ttttactctgtctaacgccagacgattttactcgtcaatggggaaccccttagggtggaaagggttaacttgttgtgcgt cgtgaattgcagcttaaagtaggtcaaagttcatgagtacagaatggccccagtctggagcttttcctcctgagaatttt tagattattttcagctgactactactataagagaagattttatatgtctcttttccctgtcgagatttgaggagtgagtt gttgaggcgacacgattgaaacagtgatcagatgtatgtagacggcgactacgagacgtggttacgctgtgttacgcgtg tttcgcgaaagcccatgcgtgtatgataactgacttagccgctttggtgcttcttctcctataagcgtcacccaaaattt tatctacctacaagtatcttttcgtttgtaatttgctcagtaacttggttgtaatttttgcctcggcagcccttccttcc gaatctgtcttcgagtccgccttttgcgtctcttttgtgtcgcaaagatgacgaatcaatcggcttgccttcagagaaca ccttcgtgaattcgccacccgggcttaaaagaaag |
Protein
Protein ID | aug_v2a.17679.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.17679.t1 MVEMAEKFKNREDQEERDLKKYLKFLSLKAIQVIVQSRLGEKIHTKSKPNSMGQDWFNLAINDDPDVSAEAKKVTNGKLP SQESPMCVEISLKTSEDESMVLETWCLGINDRVDSNTKVTYTFYNRIGMLLKSLVSVTRVTPAYQLSRKQGKDFMMCYKV YFGEVRFKELGEGKSTSSTKPLNWKQMKSKGAFVSETDTPVKPFLPNLSSSPPFASLLCRKDDESIGLPSENTFVNSPPG LKRK |