Gene
Gene Model ID | aug_v2a.18117 |
---|---|
Locus | scaf9609 : 1307 ... 4832 : + |
To GenomeBrowser | scaf9609:1307..4832 |
Genes list of scaffold | scaf9609 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 20-16 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 20-1. This gene model contains TPR_1 and TPR_2 domains. |
mRNA evidence |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.18117.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.18117.t1 aaatggatcagttactgggtgacaataacaaagccattgagtaccttgaaaatcatttgaaaattgcaatagaaattggt gatcggggcagagaaggagcagcatatacaaatcttggtaatgcttaccagttactgggtgactatcaaaaagccatcga gtgtcataacaatagattaaaaattgcagtggaaattggcgatcggggtggagaaggaggaatatatggaaatctcggta atgcttaccagtcactgggtgactatcgaaaagccatcgagtatcatgaaaaacatgttgaaattgcaatagaaattggt ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntactctttttctagca attgaaggccttacgaccaacatctggtttctgagaaaggggaaaaaagttatatttcgcaaagggaggctggagtgtga cagaagagaggaagatcctttactcgccttactgcaatcatgtttaagaaaaatcggagctgaaagtaaaaaaagatgtg aagatccctttaagccattttacgatgcagttattgatccaattcttgacatgcttgaacctcaagacgacgagttggtc attgttcctagtggtgtgctgtgctttaccccatgggcggcagtcattgaacccattaggattcgcactgttccatcgct gacaagttatcaattgatcttaagtgtacccgaaggacatcacatgaagaagggagcgcttttggtcggaaacccctgtt taaaagagttgaagaaaccccaagatgacttaccgtgtgctcaagaggaagtagaaatgattgcaactattctcaagact acacctttaacagggaaacatgcaacaaaagccgaagtgatgaaacggatgtcgtcagttggcttaattcacattgctgc ccacggaaacgaacacactggagaaattgctctgtctccaaaccctggatggtcttcaaagttccctcaaacaaaggatt acatgttaaaaatgtccgatgtacaggctgccaatcttcgagctcgtcttgtggtgctaagttgctgttacagtggaaaa ggcagaatgaagaatggagagggtgtggtcggcatcgcacgtgcctttttggctgctggtgctcgttccgtgttggtggc cctgtgggatatagatgacgaagctaccaaggtgttcatgaaaagtttctaccaacatctgaaggaaggaaaaaccgcca gtgctgctgttcagcaatcgatgaaattccttcgtgaatctgaagagttttctgagacgagatactgggctccatttcaa cttatcggagatgacgtcaagattgaattcgaggcagatgatgacatcaaaaaatgactaataagtttttttccattcct ttgtcaccataataaccgacggaatacgtttctctgggtgttttacttgtcagtaacaccacgtaacagaacagttacga taatgtgcagtggttttgtcaggcaaagatagacgttcttactacagcaaggcagatgtgtttaagacacactcaatctg actgagtcgcttgacgtaatattcgccatagggaccacctttataatcagaattgcgatacagacaatattcctttttca agtctgatccacttgcgtccctctggggtagatttgcttgtaaccggtcttccttgacaaaacgcgatgattggtgatac actcggtgattctgtgtcttctttgtgaattattctacggaattgtattctgaattatattgtataagttattccgaatt actgaattcattttcactagctttttgttgttgttatttttcataactttggagtatcattgaagagataaaacttggtg ttttcg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.18117.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.18117.t1 MDQLLGDNNKAIEYLENHLKIAIEIGDRGREGAAYTNLGNAYQLLGDYQKAIECHNNRLKIAVEIGDRGGEGGIYGNLGN AYQSLAIEGLTTNIWFLRKGKKVIFRKGRLECDRREEDPLLALLQSCLRKIGAESKKRCEDPFKPFYDAVIDPILDMLEP QDDELVIVPSGVLCFTPWAAVIEPIRIRTVPSLTSYQLILSVPEGHHMKKGALLVGNPCLKELKKPQDDLPCAQEEVEMI ATILKTTPLTGKHATKAEVMKRMSSVGLIHIAAHGNEHTGEIALSPNPGWSSKFPQTKDYMLKMSDVQAANLRARLVVLS CCYSGKGRMKNGEGVVGIARAFLAAGARSVLVALWDIDDEATKVFMKSFYQHLKEGKTASAAVQQSMKFLRESEEFSETR YWAPFQLIGDDVKIEFEADDDIKK* |