Gene
Gene Model ID | aug_v2a.20020 |
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Locus | scaf12165 : 3740 ... 14085 : - |
To GenomeBrowser | scaf12165:3740..14085 |
Genes list of scaffold | scaf12165 |
Manual annotation
Study field | IP3 pathway |
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Gene name | Adi-TSC2-1 |
Description | Named thus because a bi-directional best his result was obtained by BLASTP searches. See Homo sapiens TSC2 (P49815). |
mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.20020.t1 | gi|156404600|ref|XP_001640495.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.20020.t1 | gi|585706681|ref|XP_002740570.2| | PREDICTED: tuberin-like [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
aug_v2a.20020.t1 | gi|736188481|ref|XP_010770719.1| | PREDICTED: tuberin-like isoform X2 [Notothenia coriiceps] | 1.96182e-44 |
aug_v2a.20020.t1 | gi|736188478|ref|XP_010770718.1| | PREDICTED: tuberin-like isoform X1 [Notothenia coriiceps] | 1.96182e-44 |
aug_v2a.20020.t1 | gi|597734642|ref|XP_007229614.1| | PREDICTED: tuberin-like [Astyanax mexicanus] | 4.06377e-44 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.20020.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.20020.t1 caatactcagaagtgtttgaggttattttaaagtgtgtgcaagatgtaagttccccttttttcttttaattctgtgtttg attttgaatctcggcgcattgagcttgttgaacagggcgaccatttgatttgaataacaggcaaccccataattcctgta tatgcttgacaaaggtgcaacactcgaaacgtctgcaatgttagttttttacagtggtagtttgttcctcatcaactctt ttggtaacaaactttcgtacctgagtttcagacttaaacaaagttgtatattaagggactagtggccactattgcttatc gccaaccttgtctcggtttgacagcgtatattgttctccatccttttaggagtgggattggactgtactggaacacgttt taaaagccctacccgaggtcctacaaaataagagcctgatactttcagccaatccagctcttaatgccatgacatcagtt ctctgccacatggtaatctcgcttctcaacatcttgtagtgcgtttctcagcaattgtttggattctgaaagatgtattt cacgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn 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Protein
Protein ID | aug_v2a.20020.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.20020.t1 MTSVLCHMVLEPSYIHDLHRVPSGVGRVGLLALIFQVLTVLATYHSNLDRRRQVELVRALELGLGTKCAVRCVSSLTLCT MEMQAVMKSFQDSQYKSVFAICLPYTDPYRYSQYTLTLAYHVIAAWFVRSRLAYRKAFVGFVSKGLKASAVNPERFDPRP DSPALATAKSHSNNVSNQPSPQTAPRSISPVTKKETDSSCELHSEMKFSNSVRQHHESESDKTMEPAQLDPVLIYSPTGS LTSPSSTTAQSLESEPYETRDRLLSQSPRKPANVFTLASDEENVLSRKVEDHRERTDLQMTRDSADANGKAALTLSLDSG SRVAQLRELETESQAPKKSKLKKSSSTNSPIRNMSVLSQSLHSPFASPLQSRRSMAKKSKEAEDRLGLTSASGQPKKSSS SPELSSPPAFPRALGKTSSSRIVSHGGRPQSISKSDKSAPLPGDVADTGPKEPPILVTPSESFRYSLDPSFVFLQLYHAS FLGSSNEKPEPLPDSEVIERAIKCLDRIPPYDTHKIGVIYVGPGQHDNEAAILGNVYGSSRYMTFLSGLGTLVRLRDCPP AEIYTGGLDRNGEDGEFAYSWQDDICQVELLRKVKRMKGSVSKGTVVQRW* |