Gene
Gene Model ID | aug_v2a.20120 |
---|---|
Locus | scaf12290 : 27246 ... 36801 : + |
To GenomeBrowser | scaf12290:27246..36801 |
Genes list of scaffold | scaf12290 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
solute carrier family 12 member 1 isoform x2 | GO:0015377 GO:0016021 GO:1902476 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.20120.t1 | gi|697013997|ref|XP_009581953.1| | PREDICTED: solute carrier family 12 member 1, partial [Fulmarus glacialis] | 0.0 |
aug_v2a.20120.t1 | gi|512827428|ref|XP_004912655.1| | PREDICTED: solute carrier family 12 member 1 isoform X1 [Xenopus (Silurana) tropicalis] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.20120.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.20120.t1 nnnnnnnnngctgtggtcacttggttaacaacattatcaatgtctgctgtttgtaccaatggtgaagtcaaaggaggtaa tgataatattaattattgatataagaacctggtttcataaataagcaagatagaaatgtcaagcatgtttttctttgtaa tttgcttgcattttgtgtgttaaccctttcatgttcaaggggttccccattgacgagtaaaatcgtctggcgttagacag agtaaaaactataagtgtcatgagtgcgcccacggaccttaaagggtccaatggaagaataagactatggatcttctgat ttcctagacttgcacacaataacatttgctattcatgtttcattttcttcttgtctgtaatagtttttttctttttataa attgaattgattactataaagaaatgatgcattcctttttttcaggcggggcctattatttgatatctcgcagtcttgga ccggagtttggtggctcaatcggtttgatcttctctgtggccaatgctgtggcagttgctttgtacgtggtagggtttgc cgaaacagtcaaagatttgatcagagaaaatggtggggatgtggatctcattggtgaactcaacataattcggattgttg gcattggaacggtcatactgttactgtgtgttactctgatcggcttggagtgggttgtgcgcacgcagatgtttcttctc tgtatcctcttggtctccattgttgacgttattgtgggagcaggcattggtcctttaaatgaagcaagcaaagcaaaagg ctttgtgggcttgagtacaactctgttcaaggaaaactttggcccagcttatagagaaggcgaaaatttcttctcggtat ttgcagtgttttttccagctgcgactggcatcttggctggtgttaacatctcaggggatctcaaagatgcacagaaaggc atcccaaagggaactctgtgggctattgttatcagtactattgtgtatatcgcacttgactggttggctgcagcaagtgt gttgagagatgcatccggactgatggctgtagcaatcaatgcaaccatttcaaattcaagtagttcaatacaagactgct ctgttgacttcacctgtgaatatgggctgatgaacgacttccaggtgagatgttaatagagtgttgatcgatatatggac ccatgcatcggcgatatatatcgatccaggtatcctaaaagaaacatgatccagaagtgctttgtttgcttcataacagt aaaggcgcttgaatatgatttctttcaccatccttcatcctgtgcatgtgtagcatgctttgagctaagctaaaaggata aatctttttgtcactctcaaagaaagaagggttgctcaccacttgagcatgcatgtgtatgttgggcacaaaagttgagc tatgattggatttcattgcatcaaagtgatacaaaaaaggagtttaaggagctatgatggctgcctacaacaaaaatgtc acttaaaaatagaactttgcgttcagccaagtgttgggattattacatgttggtcccgttgcataaaataagcaaagttt actttcgcttgcttggcaccaatggttttcatgtaaaggcaaagaatggaagatttactgctgcggcctcatgctgatgt tagaacctcaaatatgaaaattttacgtcctcatctgacagactaagtcaaaaatttgtaccaaaaagcatgtcgcatgt gtaacacaataatgatttatttttccccattcaacaaatcataccattgatttctagtgttgttgtttccattgctattg ttgtttcttaaactctctattccctcttaaactctctattccctgataaaaaaatgagcatttaactttagtgaaatggt tcaactccaataaaatatttggccatttcgcaaaaggctattgttaggcaaaataatatagtttatactgtagataaaca ttaggccatgataagagtaaacacttgttttttcctatattgtattctgcacttcaaagttcacaaaattggccattttt cacaaaaattgttgtgaaaaatggctgatttaaggggtaaactttgaagtgtagaatagatacaaaaaacaagtgttatc atggcctaatgtgaatctataaactctaaaaccattgaggatttgttcaattaaaaaatgtccaaaaaaagaccttgtgt ttgagaaacgacaggattttgaaaactggtgaaaacagttaccatgcatttggccattttgtaaagattatagtgacgca aaatggatataatttcatctaaaatcgttctgcagttgctaatcttggaacatgtctcctctctaatcaggtgatggaga aagttgcagcctggggtccaattgtcacgggtggaatttttgcagccacactgtcttctgcattggctagtctagttgga gcaccaaagacgtttcaggctctttgtaaagatgaactttttccaggaatcagttattttggtgtcggagtaagtagaga tatgaaacatgatgcattcatgatttgcatcaaaattgcatgctacccacatttatttttcacgaaaggttttttctaga caactagtctttgtttgagggccattctcctttgtgttctgccaaaccagttaaggatccttcttttaccactggctgga tttaactccaaagtccctgaattctaagttctgctgtggtttgtaaaagttaaaagctggatggcaactacaatgattag cctctggcctaagatttacaaggttattagtatgtttgtgtgacatcccttgtgatttgttcatattttggacgcataca tgtccaatactgtgacataatgagattcacggtacttcacaatagacatcacaaagtgtcctgttcttcatgcattgcaa aaccgtttctattttgttaaggattagggttaggggacacattgtgatgtctatcacaaataatcatgaatcttattatg tcacagtattggacaactctctttggacgagtgtcagagcagaaagatgcactagcaaattttgccagctttaaatactg tctgatccctaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatcgatagggtttaaatcgatgatattttt ggtctgtctttctctttccttagcacctagtttccgggaaggtgtgcgcatcatgttgcagacggtgggcctgggtaaga tgaagccaaacacagtgatattcggtttcaaacgagaatggaagaaattgtggaaagatccatccgaacgagcagtcata aaggagtatgtcaacgtggtacacgacgcgtttgaactaaattacggtgtggcgatattgcgattgagaggagagctgga tttgcaagagcttgctaagtttgaagaagaggattggctggccgaagaagacgaaatagccgtgaattcagctccacccg aaatacaagtcagcacagagcagggtgttgtttcttctgaagttcagagcgaaagtagcggaagaatttttcatgttgag aaacgaagtagaccaagtgaggaagagtttgttcttgatgctgtcaaggacaaagaaaacgataatttgctcccagagaa agatacgggggaagaccaggcagaggaggggaaggaagaaagtccaagtgtagtgaagaccgggaagtttaaagtgactg tgagcaaagaaccattggaagatgatgctgaagacaaatttgacgagacagtaaaattgacggattctgttgttgagact catgatgcgacaccagttgaagctgaagtggcctttaaagacaaacctaaaggaaccattgatgtgtggtggttgttcga tgatgggggtttaacaatacttatcccctatcttctgtccattcacaattactggaaagattgcaaactgagaatcttta ccccagcttcgagtcatgcgctgaagagcaacgagctgcgaatggccaatctgttgaagcgattccgaatcgacttctcg agtgtcgtcgaagtggaaggcatcaacaacccgccctcaagtgctagtgtccagaacttcatgaaattgcccgtgaggga cgattttgcagacataaaggaactggaaaaagaccgcaaaactatgcacaacattcgacttggggagctgatccgagagc attcaaacgatgccaagttgattgtcctcacacttccggtgcctaaagttgaaatgacgtcaccgcagttgtacatgagc tggttagaagtgttgtcagcggcttcccccccggtgctgatggtgcgtgggaatcaacagagtgtgttgacattttacag ttagtacagctaataccaccatccttagatactttttgatgtgaagtgatacatgaaatactttttgatgctgtaacaaa ttttaggatgcctgaacctctaattttcatacctttttttactgacaccccacctctaaccagtggtttaaatcacacac aatttcaggggaaacaagtttcgagatttcacctgagtagtaatcagtactgtcaaaacttacgttgtcgtcatatttaa tttttttcgttagtttttccaaaaaaaaaaagtcgctcgggtattctaaccaatttgaaacaatcctaattgacgcatgc gccaatacgtttccagcaatttgattacgtcaatggaaagacttttctggttggcctaagtgactgcacaatgttaaaaa aaagtgctgggcaccatttttattcatattttgcccacagcataactatttgtatcgcacaggggcaagggaaacttcgg tgatttcgaccactgatacttaattagttaggttatgtgccagtcaagtccaaatgcgcccaacctccccccccccgggc attccccgttcatttgacactaggatagctctgtatagtggaaaacgaaacgaaaccttatgggcgggcatttgaccatc gacaaataccttggtcagcagtcgctatctggaaaatagggattttaagatgcaaggacgacaacagagctcaaaattaa acatgaactcggacacttttttaactcgttcagtttgtgaaaactaggtgaatccttctggaataactataaactgttca aattaagcaaaaagcgctggaaaaggtttttgaagtggttttgaagtctttttacttcaattaaaatttcctcttgcacg gagtgttgggtatttggcccttttgtgatgccctaatcggtggggcatttgacggtgtctttccacatgtgaccattttt tttttgtgaaagtcaaattccctgtgagggggtgggataggcgctcttggagttatctgatacnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactc ttttcaacaattgcaagacaactcgaattgaataaaaattacggcaccgttttggtccttatattgaattcaaagtaatt atatgataatttaaaaattggctgacatcttaatttaaaattatgctattagaattttaattttaactgaggcaatttga aggaatttctgaatcatgattttaatggaattgaaagtctgtggtcactgatgtacaatggacggtttattatagcaata gtttaatgctgacacggctttttcaagtcggcgtgattttcgttggtaactgaacatttggcagtgagttgcacaatatt tgcacgtatgtttagtggttaaattttcttggaaattttgatgtggtttcgtcggctagtccgtggtttcgtcgccagat aggtacagaaactataaagaaaacatctcagcgacatcctagaattccaacagcaaggagacttaactacttcatgttgc taacaatgaagaaccagcggaagattcaattaaataacggggcttcgattcgcgcgaggtactggggacgagggcagttg tgggatcaactttgaaagcaaggagatttatttagtattgaagcgttttgtaacaatttttctatctttcttcacgtttc acattgaattcactaaaataaatcttagcaatttat |
Protein
Protein ID | aug_v2a.20120.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.20120.t1 MSAVCTNGEVKGGGAYYLISRSLGPEFGGSIGLIFSVANAVAVALYVVGFAETVKDLIRENGGDVDLIGELNIIRIVGIG TVILLLCVTLIGLEWVVRTQMFLLCILLVSIVDVIVGAGIGPLNEASKAKGFVGLSTTLFKENFGPAYREGENFFSVFAV FFPAATGILAGVNISGDLKDAQKGIPKGTLWAIVISTIVYIALDWLAAASVLRDASGLMAVAINATISNSSSSIQDCSVD FTCEYGLMNDFQVMEKVAAWGPIVTGGIFAATLSSALASLVGAPKTFQALCKDELFPGISYFGVGVTPSFREGVRIMLQT VGLGKMKPNTVIFGFKREWKKLWKDPSERAVIKEYVNVVHDAFELNYGVAILRLRGELDLQELAKFEEEDWLAEEDEIAV NSAPPEIQVSTEQGVVSSEVQSESSGRIFHVEKRSRPSEEEFVLDAVKDKENDNLLPEKDTGEDQAEEGKEESPSVVKTG KFKVTVSKEPLEDDAEDKFDETVKLTDSVVETHDATPVEAEVAFKDKPKGTIDVWWLFDDGGLTILIPYLLSIHNYWKDC KLRIFTPASSHALKSNELRMANLLKRFRIDFSSVVEVEGINNPPSSASVQNFMKLPVRDDFADIKELEKDRKTMHNIRLG ELIREHSNDAKLIVLTLPVPKVEMTSPQLYMSWLEVLSAASPPVLMVRGNQQSVLTFYS* |