Gene
Gene Model ID | aug_v2a.23992 |
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Locus | scaf17640 : 19656 ... 30644 : + |
To GenomeBrowser | scaf17640:19656..30644 |
Genes list of scaffold | scaf17640 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-DHC-f7-46-63 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See chlamydomonas DHC-alpha (AAA57316) and DHC-gamma (AAA50455). This is probably a fragmented gene model. Dynein_Heavy domain was found by Pfam search. |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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dynein heavy chain axonemal | GO:0001539 GO:0003777 GO:0005524 GO:0005858 GO:0005874 GO:0007018 GO:0008152 GO:0016887 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.23992.t1 | gi|545816577|ref|XP_003125019.4| | PREDICTED: dynein heavy chain 6, axonemal-like [Sus scrofa] | 0.0 |
aug_v2a.23992.t1 | gi|10440249|dbj|BAB15685.1| | unnamed protein product [Homo sapiens] | 0.0 |
aug_v2a.23992.t1 | gi|655606117|ref|XP_008252409.1| | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: dynein heavy chain 6, axonemal [Oryctolagus cuniculus] | 0.0 |
aug_v2a.23992.t1 | gi|585712673|ref|XP_006900461.1| | PREDICTED: dynein heavy chain 6, axonemal [Elephantulus edwardii] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.23992.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.23992.t1 tccaggcttcaatgggctgcccgattacagggactatattgacagtttaccaattgctgatgaaccagagatatttggga tgcataacaatgcaaacattgctttccaggtgagaagtggcatatgttgtgttaccctgcacttaatgtgtttactgtga ttgaggtgtcaagtggtgttcttttgagcacgtgatgtctaagatttcacttacagtattaagattcatatgaaggaaag gtggtgtcacatctttgaggaggtgaaaagctagattttggtattgaatgagttgatgaagatcaaattaccaccatgaa ggatttggaaatctgacatttcaagcactagcccttcatcacagaaaagggctaactcttgaatcattagctttccaagt ctttcatggtggtaattcgacctttatcaagctgtgtgacaaaaccaaatttccatgtttttctctcccactggtgcagc accacagtttcctaagaaactaaaaatttgttcttatgtgcacatgtggattataaggtgagtatacaaacaatattctt ctttgaaaggtgctccctggcgtcctcagattccatcaaggatttgggaatgtagtagtgtgaaggtcgccagcccattt tcaatctgttatttatctctgtgaataaattttcaaagcacaattggatttaaagtgcttaacaagtttgtcatgaagga agattttcaagtggagcagcttgaatggcgcattgctttgaccttaagccaattaggagctgtgatttgacatcagattg tcaatcagttgtccaagatgttgtttcttctcccttaatctagtttttttctcttgcagtatttttgatgtgaccaatgt gtggcaatttcattgttagaagggtttaatagggacctatttttttttatttccagactcaagaaacaaatgccctgata 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Protein
Protein ID | aug_v2a.23992.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.23992.t1 MWSNAAYPSLKPLGSWVKDLLLRCLFIEQWIEFGAPKSFWISGFFYPQGFLTGTLQNHARRYNLPIDQLSFHFNVLPHYR NQEEVSEARTKIDPDQTLPMDSEIESPYDGVLVHGLFLDAARWNDDKMMLGDARDGEMNPVTLPTLLLLFICPLIYLPTS GLRKEQLYCAS* |