Gene
Gene Model ID | aug_v2a.24522 |
---|---|
Locus | scaf18410 : 704 ... 4855 : - |
To GenomeBrowser | scaf18410:704..4855 |
Genes list of scaffold | scaf18410 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 35-3 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 35-1. |
mRNA evidence |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.24522.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.24522.t1 nnnnnnnnnnnnnnntctgaagaagttgtacttgatcagagaactggcatgattgagatggccacagctgcagatgacaa ggaggtgcgggtaattgtgcgtagtataaaaagtacagtaagccattttgttggagatgaaaaaatattcgagcacatga gagtagaaacaagaagttcacaaaaaagtaattatatcccgatcattaaaatctttggttagtgtctttaatgaggtaac cagaaggaagtgaaattgtttgtaaatttaacctcatgcagtagaattaaacatttttacatgtgcggcacatgtcaatg aaaagaacatcgtttcttaagtatgaacacaagactaaaggaatgtacccatgatgcagttacaaagattttgtgtattg atttgcaaggagatcgtggaccttgccttgcattaaaatctttggttagtgtctttaatgaggtaaccagaagcaagtga cattgtgtataaatttaacctcatgcagtagaattaaacatttttacatgttcgacacatgtcaatgtaaagaacatcct ttcttaagtatgaacagaagactaaagaaatgtccccacgatgttgttacaaagattttgtgtattcatttgagagcaag tcggtgatcttctctttttaaaaactagaaacctacatttttaaagttgtgaaccttttaactgggatcacagaagcaca gacatgcagttgtagtggatagtattttttgttagtatttttatttatttaccttttctattatgtttaccttttttttt cagggtaatgaggaagattcagatgagacgattggaataaagagggccactcctttatttgctgttctagttttttagtt gttttttagttgtactttatcggagaactggcatgattgggacgggcacagctgcagatggcgaggaagtgctggtaatt ttgcgcagtatgaaaagcgcagtaagccattttgttagagataaaaaatatctgagcgcattagagtagaaacaggaagt ttacgaaaaaaaattatgtcccgatcattaaaatctttcgttagtgtctttaacgaagtgatcagaaacaaatgacattg cgtttaaatttattttcaagcagtagaattgaacatttctacatgtggggcacatgtcaatgtaagaacatcgcttctta aatatgcacattagacaaaagcaatgtccccatgatgctgttgcaaagattttgtgtattcatttgcaaggagatggttg gtcttgtctctctgaaaactaaaaaagtacatttgcatagttgtgaagcttttaactgggatcacagaagcacagacatg cggttgtcgtggagagtatttgttgtcagtatttttattgattcatttttttattatgattacgtacttttttcagggta ttagacaagtttcagatgagacgattctaatgaagagggccactccttttttttgtaaagaaattgtacttaatcagaga actggcatgattgggacggccacagctgcggatgacaaggaattgctggtaattttccgcggtatgaaaagtgcgggaag ccattttctaggtgatacaaaatatctgagcgcatgagagtagaaacaagaagttcaccaaaaaaagtaattatatttcg atcaataaaatctctcgtcagtgtccttaacgaggtaaccagaaataaatgacattgcgtgtaaatttattctcatgcag tagaattaaaaatttgaacatgtggggcacttgtcaatataaagaacatcgtttcttaaatatgcacagtagactaaagg aatgtccccatgatgctgttgcaaggattttgtgtattcatttgcaaggagatcgttgatcttgtctctctaaaaactag aaaaatacatttgcatagttgttgtcgaaaacgcacgaaaacacgtttcctagttaatcagctctttattcgaagaatca actcacaaaaacgcctggcatcacaacagcatcaactactaatcgatcgagtgccggattgttattaccttacaagatac ttgatacctagtatgaaatgcattctgagagattgattgaagtcatttccactcatgcataagaacaacaataacaacta aacgatttaacacattgtacacggttcccgacagttgtgaaccttttaactgggatcacagaagcgagagtatttgttgt cggcattttctaaatgtatatttactattatgattacgtattttttgcagggtaggaaagaaggttcggatgagatgatt gtaatggagagagccgtacctttattttctggagaagttgtacttgatcagagaactggcatgattgggacggccacagc tgcggatgacaaggaagtgctggtaattttacgcagtatgaaatgagcagtaagccattttgttggagataaaacatatt tgagcacatgagaatagaaacagtaagttcacaacaaaagtaattaaatcccgatcattaaaatcttttgttagtgtctt taacgaggtaaccagaaatgaataacattgcgtgtaaatttattctcagtcagtagaattaaacatttccacatgtcggc cacatgtcattgtaatgaacatcctttgttaaatttgcacagtagactaaaggaatatccccatgatgctgttacaaaga tattctgtatgaatttgcaaggaaatcgttgatcttgtctctctgaaaactagaaaagtacacttgcatagttatgaacc ttttaactgggatcacagaagcacagtcatgcagttgtcatgcgagtgtttgttgtcagtagtcnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnngttatgattacgtatttttttccaggggaataaagaagttttatatgagatgatttctttggagggcgccactt ctttgttttctaaagaagttgtacttgatcagagaactggcatgattgggacggccacagttgcacatgacttggaagtg gaggtgattttgcacaggatgaaaagtgcagtaagctattttgttggagataaaaaatttttagcacatgagaatagaaa caataagttcgcaacaaaagtaattatatcccgatcattaaaatctttcgtttgtgtctgtaattaggtaatcagaaatg aatgatctttcgtgtaaatttattcttatgcagtaaaaataaacattttcacatgtggggcaaatgtgaatagaaagaac atcgtttcttaaggacggtgcctactattgttattgcgcatagtttctgcgcatctccagatactcggatttcctatcgg caatgcttactaatacagggatctttttgcgcggtttaaaacaatccggataaagtagatcttagtaagtactcttggta tccaaaaagaaaattatgtgggaaattgcatgattggcacggccacagctgcagatgacgaggaagtgctggtaattttg cgcagtatgaaaaatgcagtaagccattttgttggaaataaaaaatacctgagcgcatgagagtagaaacaagaagctca ccgaaaaaaagattgtatcccgatcattaaaatctttcgttaatgtctttgatgagctaaccagaaataaatgacattgc atgcaaatttaagttcatgcagtagaattaaacatttttacacgtgggcacatgtcaataaaaagaacatcgttccttaa atatgcacagtagaataaaggaatgtccgcatgatgctgttacaaagattttgtgtattgatttgcaaggagatcgtgga tcttgcctctttgaaaactagaacagtacatttgcatagttgtgacgcttttaactgggatcacagaagcacagacatgc cgttgtcgtggagagtatttgtcagtatttttattaattaatgcttattattatgattacgtatttttttcagggtgagg aacaagattcagatgagatgatcggaatggagagggccacttctttatcttctgaagaagttgcacattatgaaggaact ggcatgattggcacggccacagctgcagatgacgaggaagtgctggtaattttgcgcagtatgaaaagtgca |
|
Transcript ID | aug_v2a.24522.t2 |
Definition | - |
>aug_v2a.24522.t2 nnnnnnnnnnnnnnntctgaagaagttgtacttgatcagagaactggcatgattgagatggccacagctgcagatgacaa ggaggtgcgggtaattgtgcgtagtataaaaagtacagtaagccattttgttggagatgaaaaaatattcgagcacatga gagtagaaacaagaagttcacaaaaaagtaattatatcccgatcattaaaatctttggttagtgtctttaatgaggtaac cagaaggaagtgaaattgtttgtaaatttaacctcatgcagtagaattaaacatttttacatgtgcggcacatgtcaatg aaaagaacatcgtttcttaagtatgaacacaagactaaaggaatgtacccatgatgcagttacaaagattttgtgtattg atttgcaaggagatcgtggaccttgccttgcattaaaatctttggttagtgtctttaatgaggtaaccagaagcaagtga cattgtgtataaatttaacctcatgcagtagaattaaacatttttacatgttcgacacatgtcaatgtaaagaacatcct ttcttaagtatgaacagaagactaaagaaatgtccccacgatgttgttacaaagattttgtgtattcatttgagagcaag tcggtgatcttctctttttaaaaactagaaacctacatttttaaagttgtgaaccttttaactgggatcacagaagcaca gacatgcagttgtagtggatagtattttttgttagtatttttatttatttaccttttctattatgtttaccttttttttt cagggtaatgaggaagattcagatgagacgattggaataaagagggccactcctttatttgctgttctagttttttagtt gttttttagttgtactttatcggagaactggcatgattgggacgggcacagctgcagatggcgaggaagtgctggtaatt ttgcgcagtatgaaaagcgcagtaagccattttgttagagataaaaaatatctgagcgcattagagtagaaacaggaagt ttacgaaaaaaaattatgtcccgatcattaaaatctttcgttagtgtctttaacgaagtgatcagaaacaaatgacattg cgtttaaatttattttcaagcagtagaattgaacatttctacatgtggggcacatgtcaatgtaagaacatcgcttctta aatatgcacattagacaaaagcaatgtccccatgatgctgttgcaaagattttgtgtattcatttgcaaggagatggttg gtcttgtctctctgaaaactaaaaaagtacatttgcatagttgtgaagcttttaactgggatcacagaagcacagacatg cggttgtcgtggagagtatttgttgtcagtatttttattgattcatttttttattatgattacgtacttttttcagggta ttagacaagtttcagatgagacgattctaatgaagagggccactccttttttttgtaaagaaattgtacttaatcagaga actggcatgattgggacggccacagctgcggatgacaaggaattgctggtaattttccgcggtatgaaaagtgcgggaag ccattttctaggtgatacaaaatatctgagcgcatgagagtagaaacaagaagttcaccaaaaaaagtaattatatttcg atcaataaaatctctcgtcagtgtccttaacgaggtaaccagaaataaatgacattgcgtgtaaatttattctcatgcag tagaattaaaaatttgaacatgtggggcacttgtcaatataaagaacatcgtttcttaaatatgcacagtagactaaagg aatgtccccatgatgctgttgcaaggattttgtgtattcatttgcaaggagatcgttgatcttgtctctctaaaaactag aaaaatacatttgcatagttgttgtcgaaaacgcacgaaaacacgtttcctagttaatcagctctttattcgaagaatca actcacaaaaacgcctggcatcacaacagcatcaactactaatcgatcgagtgccggattgttattaccttacaagatac ttgatacctagtatgaaatgcattctgagagattgattgaagtcatttccactcatgcataagaacaacaataacaacta aacgatttaacacattgtacacggttcccgacagttgtgaaccttttaactgggatcacagaagcgagagtatttgttgt cggcattttctaaatgtatatttactattatgattacgtattttttgcagggtaggaaagaaggttcggatgagatgatt gtaatggagagagccgtacctttattttctggagaagttgtacttgatcagagaactggcatgattgggacggccacagc tgcggatgacaaggaagtgctggtaattttacgcagtatgaaatgagcagtaagccattttgttggagataaaacatatt tgagcacatgagaatagaaacagtaagttcacaacaaaagtaattaaatcccgatcattaaaatcttttgttagtgtctt taacgaggtaaccagaaatgaataacattgcgtgtaaatttattctcagtcagtagaattaaacatttccacatgtcggc cacatgtcattgtaatgaacatcctttgttaaatttgcacagtagactaaaggaatatccccatgatgctgttacaaaga tattctgtatgaatttgcaaggaaatcgttgatcttgtctctctgaaaactagaaaagtacacttgcatagttatgaacc ttttaactgggatcacagaagcacagtcatgcagttgtcatgcgagtgtttgttgtcagtagtcnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnngttatgattacgtatttttttccaggggaataaagaagttttatatgagatgatttctttggagggcgccactt ctttgttttctaaagaagttgtacttgatcagagaactggcatgattgggacggccacagttgcacatgacttggaagtg gaggtgattttgcacaggatgaaaagtgcagtaagctattttgttggagataaaaaatttttagcacatgagaatagaaa caataagttcgcaacaaaagtaattatatcccgatcattaaaatctttcgtttgtgtctgtaattaggtaatcagaaatg aatgatctttcgtgtaaatttattcttatgcagtaaaaataaacattttcacatgtggggcaaatgtgaatagaaagaac atcgtttcttaaggacggtgcctactattgttattgcgcatagtttctgcgcatctccagatactcggatttcctatcgg caatgcttactaatacagggatctttttgcgcggtttaaaacaatccggataaagtagatcttagtaagtactcttggta tccaaaaagaaaattatgtgggaaattgcatgattggcacggccacagctgcagatgacgaggaagtgctggtaattttg cgcagtatgaaaaatgcagtaagccattttgttggaaataaaaaatacctgagcgcatgagagtagaaacaagaagctca ccgaaaaaaagattgtatcccgatcattaaaatctttcgttaatgtctttgatgagctaaccagaaataaatgacattgc atgcaaatttaagttcatgcagtagaattaaacatttttacacgtgggcacatgtcaataaaaagaacatcgttccttaa atatgcacagtagaataaaggaatgtccgcatgatgctgttacaaagattttgtgtattgatttgcaaggagatcgtgga tcttgcctctttgaaaactagaacagtacatttgcatagttgtgacgcttttaactgggatcacagaagcacagacatgc cgttgtcgtggagagtatttgtcagtatttttattaattaatgcttattattatgattacgtatttttttcagggtgagg aacaagattcagatgagatgatcggaatggagagggccacttctttatcttctgaagaagttgcacattatgaaggaact ggcatgattggcacggccacagctgcagatgacgaggaagtgctggtaattttgcgcagtatgaaaagtgca |
Protein
Protein ID | aug_v2a.24522.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.24522.t1 MIGTGTAADGEEVLGIRQVSDETILMKRATPFFCKEIVLNQRTGMIGTATAADDKELLGRKEGSDEMIVMERAVPLFSGE VVLDQRTGMIGTATAADDKEVLGNKEVLYEMISLEGATSLFSKEVVLDQRTGMIGTATVAHDLEVEGEEQDSDEMIGMER ATSLSSEEVAHYEGTGMIGTATAADDEEVLVILRSMKSA |
|
Protein ID | aug_v2a.24522.t2 |
Definition | - |
>aug_v2a.24522.t2 MIGTGTAADGEEVLGIRQVSDETILMKRATPFFCKEIVLNQRTGMIGTATAADDKELLGRKEGSDEMIVMERAVPLFSGE VVLDQRTGMIGTATAADDKEVLGNKEVLYEMISLEGATSLFSKEVVLDQRTGMIGTATVAHDLEVEVILHRMKSAILVST LGIQKENYVGNCMIGTATAADDEEVLGEEQDSDEMIGMERATSLSSEEVAHYEGTGMIGTATAADDEEVLVILRSMKSA |