Gene
Gene Model ID | pfu_aug1.0_465.1_00315 |
---|---|
Locus | scaffold465.1 : 11071 ... 15545 : - |
To GenomeBrowser | scaffold465.1:11071..15545 |
Genes list of scaffold | scaffold465.1 |
Synonym | pfu_aug2.0_1299.1_31601 |
Manual annotation
Study field | Biomineralization |
---|---|
Gene name | Aspein |
Description | Blast best hit to ddbj AB094512 |
mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 | gi|37991666|dbj|BAD00044.1| | shell matrix protein [Pinctada fucata] | 4.0e-13 |
Expression profile
(Color code: FPKM>10&<50, blue; FPKM>50, pink)Libraries | EST count |
---|---|
>Embryonic/Larval stages | |
mix | 1 |
>Adult tissues | |
mantle | 3 |
Transcript
Transcript ID | pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 |
---|---|
Definition | - |
>pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 atgaaggggatagccattcttatgtgtcttgccgcgcttgtggcagtaagcgttactttcccagtggctgaccagacaac aaatgaactaggatcatcaggcgcagctgccgctggtgctgtagtatcggagcccagtgatgctggagatgctgcagacg caggagacgccgatgctgcagacgccgatgcagatgcggacgccgatgctgacgcagataatgatgacggagatgatgat gatgacgacgatgatgatagtggagatgatgatagcggagatgatgatgatagcggagatgatgatgatagcggagatga cgatgattctggagatgacgatagtggagatgacgatgacagtggagatgatgatggtgatgatgatagtggagacgatg atgatagtggagatgacgacagtggtgatggtgatgatggcgacagtggtgacgatgatgatgatgatgacagcggagat gatgatgatgatgatgatgatgacgatagcggagatgatgatagcggagatgacgatgatggtgatagtggagatgatga tagtggagatgacgacggtgacgatgatgacagtggagatgatgatagcggagatgacgatgatagcggagatgatgata gtggagatgacgatgatagcggaaatgacgatagtggagatgacgaaagcggagatgacgatagcggagatgacgatgat agtggagacgatgatagcggagatgatgatagtggagatgatggtgatgatgacgacagtggtgatgatgatgatagcgg tgatgatgatgatagcggagatgatgatgatgatgatgatgatgatagcggagatgacgatgatggtgatagtggagatg atgatagtggagatgacgatggtgacgatgatgacagcggagacgatgatagtggagatgatgaaagcggagatgatgat agcgaagatgatgacagcggagatgatgatagtgaagacgatgatagtggagacgatgatagtgatagtggagatgatga tagtggagatgatgacagtggagacgatgacagtggtgatgatgatggtgatgatggcgatgatgatgctgacagtggcg atgatgatgacgatgacgatgacgatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaacctttcaatag |
Protein
Protein ID | pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 |
---|---|
Definition | - |
>pfu_aug1.0_465.1_00315.t1 MKGIAILMCLAALVAVSVTFPVADQTTNELGSSGAAAAGAVVSEPSDAGDAADAGDADAADADADADADADADNDDGDDD DDDDDDSGDDDSGDDDDSGDDDDSGDDDDSGDDDSGDDDDSGDDDGDDDSGDDDDSGDDDSGDGDDGDSGDDDDDDDSGD DDDDDDDDDSGDDDSGDDDDGDSGDDDSGDDDGDDDDSGDDDSGDDDDSGDDDSGDDDDSGNDDSGDDESGDDDSGDDDD SGDDDSGDDDSGDDGDDDDSGDDDDSGDDDDSGDDDDDDDDDSGDDDDGDSGDDDSGDDDGDDDDSGDDDSGDDESGDDD SEDDDSGDDDSEDDDSGDDDSDSGDDDSGDDDSGDDDSGDDDGDDGDDDADSGDDDDDDDDDXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLTFQ |