Gene
Gene Model ID | aug_v2a.00131 |
---|---|
Locus | scaf62 : 14007 ... 18495 : - |
To GenomeBrowser | scaf62:14007..18495 |
Genes list of scaffold | scaf62 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 20-10 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 20-1. This gene model contains Rapsyn_N, TPR_4, TPR_3, TPR_1, TPR_2, PPR and DUF2977 domains. |
mRNA evidence |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.00131.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.00131.t1 attttcgacgacagacaaacaagcgagcgaactacaagagcacgcgaaatacacgagcacgcgagactcgaaggacacgc gacgatacgacaaagaacttttcgaattttttttcacgctcctgtcgcgtctgtgtctttgcctgtttaataatgcattc atttacttatcaatttttttaacaaccttctcaagaagaatggatgacaagacaggaaaagaaaaagcctctaacaatcg cggtacagatttccactcacggggtgagttagaaaaagccatcgagtgtcatgaaaaagatttggaaattgcaacagaaa tcggtgatcgggccagagaaggaaacgcttatggaaatctcggtaacgctcaccgcctacggggtaacttccgtagagcc attgactatcatgaaaagaatttgaaacttgcaatagaaataggtgatagggccggagaaggagaagcctatggaaatct cggttgcgcttatgactcaatgggtgacttccacaaagctattgagtatcatgaaaaatatttgaaaactgcaatagaaa tcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnatcgaaaagccattgagtatcatgaaaaacttttgaaaattgcaaaagaaatcggtgatcgggctggagaaggaaga gcctatggagatctcggtaatgtttatcagtcactgggtgactatcaaaaagccattaaatctcatgaaaaacatttgca aagtgcaaaagaaatcggtgatcttgctggagaaggaagggcctgtggaaatcttggcattgcttacaattcactgggtg actatcgaaaagccattgagcattatgaaaaacgtttgaaagttgcaaaagaaatctttgatcgggccggagaaggagga gcctatggaaatctcggtattgcttaccagtcactaggtgactatcgagaagccattgactatcatgaaaaacatttgaa aattgcaaacgaaattggtcatcgggctggagaaggaaaagcctatggaaatctcggtaatgtttaccagtcactaggtg actatcaaaaagccattgactatcatgaaaaagatttgaaaattgcaaaagaaattggtgatcgggccggagaaggaacg gcctatggaaatctcggtaatgcttacgatacattgggtgactatcgaaaagccattgactatcatgaaaaagatttgaa aattgctaaggagatcggaggtcgggctggagaacaaagagcctttggaaatctcggtaatgcttaccagtcactaggtg actatcgaaaagccattgactatcatgaaaaaggtttgaaaattggaaaagaaatcggtgatcggtctggagaaggaaga acctatggaaatctgggtaatgcttaccagtcactgggtgactatcaaaaagccattgagtatcatgaaaaagatttgaa aattgcaaaagaaatcggtgatcagggcggagaaggaggagcctatggaaatctcggtaatgcctacgnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnntgggaagtgcattcgaagatcaagtttcgtcagcagcatgtggagacctacactgccttgtg gaggtcatcgctgacgattggaaagatccacgaggctttgccgtttgctgctggacaaggacttgcgcagactctgtctg acaatttgttgattcaatatgaactcgctccgaggccctcgtcaggtgctaaatttgagtccaaaaatacaatatctttt ctctgaacagatctttctacacctattattttttattagcaattaaattattttttctagcaattgaattatttttttct agcaattgaaggaataacaatcagcataatcaacatatggcttttaaggagggaaaagaaaattacatttcgaaagggag gctagctggtgatataaccggaaaaatatccaattcgcgtcttactagtgacagcctttaaaagaattggagctgaagtt tatgaatgacgtgaagattttgcatttaggtttgacaatcctcttaagccattttatgatgcacttatttgacccattgt tgacttgcttggacctgacgacgagttggtcattgtttctaatggttagctgtggcttacccatgggccgcagttattga atggattaggagtcgcattgttccatcacttattattcgttatgaattggtcttaagtgtacccgaaacacatcacaaga agacaggggcccttttggtcgaaaatccgtacttggaagagttcgagggataccggggggacttgccaggttaaccactt acgcttctgtagagtggattagctaggaaccagtcatcccttacaaagcactactactgatgcttggtgacatagtgtct gctttgcgaaatattatattacatggacttcaagtcattctggattactgaatttattgggagattttagtagtgtcgac tttggagta |
Protein
Protein ID | aug_v2a.00131.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.00131.t1 MDDKTGKEKASNNRGTDFHSRGELEKAIECHEKDLEIATEIGDRAREGNAYGNLGNAHRLRGNFRRAIDYHEKNLKLAIE IGDRAGEGEAYGNLGCAYDSMAIEYHEKLLKIAKEIGDRAGEGRAYGDLGNVYQSLGDYQKAIKSHEKHLQSAKEIGDLA GEGRACGNLGIAYNSLGDYRKAIEHYEKRLKVAKEIFDRAGEGGAYGNLGIAYQSLGDYREAIDYHEKHLKIANEIGHRA GEGKAYGNLGNVYQSLGDYQKAIDYHEKDLKIAKEIGDRAGEGTAYGNLGNAYDTLGDYRKAIDYHEKDLKIAKEIGGRA GEQRAFGNLGNAYQSLGDYRKAIDYHEKGLKIGKEIGDRSGEGRTYGNLGNAYQSLGDYQKAIEYHEKDLKIAKEIGDQG GEGGAYGNLAVAYPWAAVIEWIRSRIVPSLIIRYELVLSVPETHHKKTGALLVENPYLEEFEGYRGDLPG* |