Gene
Gene Model ID | aug_v2a.01939 |
---|---|
Locus | scaf663 : 108706 ... 117493 : + |
To GenomeBrowser | scaf663:108706..117493 |
Genes list of scaffold | scaf663 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.01939.t1 | gi|156395862|ref|XP_001637329.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 5.0e-27 |
aug_v2a.01939.t1 | gi|556984405|ref|XP_005998128.1| | PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: lysosome-associated membrane glycoprotein 1 [Latimeria chalumnae] | 3.0e-18 |
aug_v2a.01939.t1 | gi|573903280|ref|XP_006639363.1| | PREDICTED: lysosome-associated membrane glycoprotein 1-like [Lepisosteus oculatus] | 6.0e-15 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.01939.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01939.t1 tttgtcatgtgactacaatattcccaataatttctttttccatctaagtccaacgcagtgtagagtggaaggtgaagtct ttcgagaaaaattgaaaaaggatcatcgagatgaagcttattgcagtccttgctatcgtcgctgtgatttttggtacctg tattctccatttgtgtacagttttcttttgatattcaagcccattgtggacatttccactctaacgcctttctagtctta gctagccttagttttaattttagcgttattgtggtcacagtagcttcagtgtgctgctgtcgcgagtggtttctctttgt taatattgtgaagcctttgcagatattctctttattcgttttggctcttaggtttgagaatggaagcgtaactgcttagt ttccatacgcatggaaactggtcgtatatttgctttcgaaatcgacacgagagtaacttatggcgcctttggttttcgaa ttatcgattttacggcatcttgttcgtcctagataaatcgtcgctccttcttagttgccttgaagtctttggcttacatt gacttaaactaaaattatgcgatgatgcgagcgaaaagttcgcgttatcatcttcaaagcatgttcgtccagaaactttc cttgcacttattaatttgaaacgataactggtagagcaatttttacggatgtatctgaatattcactaaatagaaaggct tggagttttacaagactaacaaaacctaggttataattttcagacaataatgtttatttccctatcaaatcaaactggtt tctttttgagtcagatcatccctaatacgagtaatagtttaccctctatgaagatgttcatgggagtttcatgggaattt catgtgatgtggaacatgtgaggtgacatcaggaaagagagaaattgaatttctagtttctaaaggaactgtggtgctgc gtcggtgggagagatcaaaacaaaaatttgattttatcaaacaagttgataaaggttgaattaccaccgtgaaagattta gaaagctgacgtttcaagctttagcccttcgtcagggcgaatagaggaattgtgggttgttgtggtttatgtgagagtgt agaggggctttgccattggtgaagatatggtctcatgaattatttgtgaataaattagtggagtgagaggtgctcattaa ttccgtgtggagagagtgtacccagtttaaaaattaatttttgttcgagatttttgcagctttctgtgttcccgtggtgt aaggatagcctgcaaatagtcatatagtggtggcagtggttaggaagagtgaaatggtgcgcgactggtttggacacgtc tgtgttgttttgttctgcatctcgtaggtgttcgcggaagcgtcaaccagtctcctccctgtttcgcctatgtagatttt cttgcatagcatgcaggttatgcaatagatgatgtttgtggagatgcaggtgaaatggtctgtaactttgacggatcaat tgggtcctgagatcttacctgtgttagaaataaagggacaagttttgcatcgtgtgcgtttgcatgtgaatgttcttggt tggttgttaaacttgaatgctctcctgactaagaaattgcctaagtttttgtcgtggttgaatgaaatgagtgttggtag agaaaatatgtgtttagagaaattgcttgtacctccgttttgagcaatctctgccaagctttggtgaaagctgtagtgaa accatttaattgttgccccttttcctcccaactgcaagcttgtgtttcctgtttacagggcaagtgtattactttgggac tttgaaattgaaatttttcattagccgtgatgacttaacccatttttttccattattttgctatgatttctatagggaac agggcaaatgcaacaactccagcaggtgaatctgaaaatacaaatccaggaaagataacttctattccaaatgcaaactc tactactgccaaacctgcaaccaatgctacctcctcatcaaagctcacttctggaaatagcacaactaatgttagcacaa caccaaagcccacttcaaatagcacaactaatgttagcacaacaccaaagcccacttcaaatagcacaactaatgttagc acaacaccaaagcccacttcaaatagcacaactaatgttagcacaacaccaaagcccacttcaaatagcacaactaatgg tagcacaacaatgaagcccactactgcaattagcacaactattggtagcacaacaccaaagcccattactattaaaccaa ctcctcctccttctcctggcaacttcagtctaaaggagaatggctcttattgcatacttgcccagtttgttgctgaattt cacattacatttgaggtcaataacactggtggaaatctgaaaaaaaaggtatgaattttgaggaaatattttgttaaaga aaaagtgtgcaattctttttgaaagtataatgaaacaaattctaatacaacatagagcgttgcaggtaaaaatgctcact tgctctggttcataattcagggctttaaattgctaccaatatggtcaccaatgtaaccaaaactttcaccttggcgacta aacattctccttaagttgccaacttggtgaattcatttctgaaaaaaaggtgaataaatgagaagtgattcaggttaagg aggcactgcaattgcttagctgcaaaagatgtggatcagttcaaataattgtctgtaacttcaatagatgtggattttgc tttcaagtttcaatgcaatgcctttaccagtggtgttacttctgtgtaaattgtgggtccagcattttatagaaagacca aagttcttgatgtttgctttgcttgtgtaacctacaacatgacagctagcgtggattttggcagttttatttgctttctt tgcattttgcttgcacatggagcatgtgccttctgtcggattgaatttacttattggcaacttgtctttctcagttagtc accaaaagacaacttcacttctttttatttggagccctgcaatagttacaatattattataatatgttttccagtttata agtgatctctatttttgaagccttaagttttttagctttgtaactttttttttaccggtgtttcatggtgcttgcagcac aatgaaagttagtaactggcactgcagagacaattttaaattggtggagctaaaaattctggccaagatagagaagcatt aggggtcactgtttcgccgttaatcatgcacttgcatgctatcatggttattctagtattctaaaaaaaaaaattagcca aatcaaaaaagtggtagggctacagccctactagcccccccccccccaccctcttgcagtacttcagtacttcagtacta gccaagggtagggctgaaaataatggccggtcaccggacaatgtccagccagattaggaatttgacgggtcaaatatact attcgccggtcatgttgaccggtcaaattcaacaatcacatcgaaataaaagaaagtttccatgctcatctgttgtttgc gatgagttaaagtaaaattcgtctcgcctaaattcatattgtcgaactttaacctggaattaaaatggaatcgttgtttg acgcttgtttacaagattcgcaacccgtaacatacaccggcattactttcggtctcagaataatcgacagaagttttcca tattttcgtgtcagtctcttggaaagtttgaagtgacgcagaaccggaggagaggtagattattgcgtttgaccgctgtg aaggtgcgttcaacacggtacagttcgtgtattggataaaataaaacgatcagtgaatttctggtattatttgaagcttt acaaaaaaactgtattttgcaaaccagttcgccttctgaaagcaattgtgacgtcctacatagtatatccgtttgtgcca cgaaaataaatcccttttgccaacggcattatatataacagctatttgctttcggctggttttgtgaggtaagtaatatt gctctatcggttcacacattcaattgcaaaacactcaaagttcacatcatgttctcttagaacggttttggttatagctt aattggcgagggctaacgatgtgtatttaattaggcaaaagtttcaattttcattttatatttgaccagtcagaaacaag gtatgaccgagctaaactttagtttggccagtcatcttgaccagccaacatccagccgttgttttcagccctgaaggata ttggtgcaaccatggaatccttataccttttcagggaagacttcttttttttctgtgtgcattttttagacttggagtca gactcttggcaaacacagtaatgttacaatatcaggaaattgtggacccaaaagtgaaagtactcttgtcatttcatggc ccaagaatgagtctctttacagcctctccttgaaatttatgaacacttcaaatagttggtcactttctttattcaccttc aatgtttctgtgggcaagattcctgcatttgcaaatgcaacaggtgggttgtttttttttttgtgtgtagaggcaatgaa tgttattacaggggattacttaccaacccaatacttaccccaatagggtggtgagggagggcaaagcaatattgatttcg aaagtgatatgactgtaccatgggacagcaagcaaacatgaagcaactatggaaaaatcttgccaagtgcggggtctaaa gcaatccaagggacaagcagtaatctctgttttgattttaatcttagcaaattccaattgacacatttaaaatgcatttt agttgagtacaatgttgcagtacatgctccattttaggtgaggtgttttaagtttcattcagtagattgtggcctcaatg ctttgatgttaaattatatgagagaaatgatggaacaatgttgaatgcacctttgctgaaaatgttaaattatacgagag aaaatgcacctgtgctgaaaatgttaaattatacgagagaaatggtggaacaattttgaaggcacctgtgctgaaaatga tgtaatgacagttgataggcaacaattgaaggaatgcattttttggacctacaacctggtggttactggttgcatgccct gagcattgagcttgaagaaatctttgtgagctggctggtttgaattctttgcatatcatatatttcctgctggtacttgg gccttgacatgtgatttttcattcaacatgaaaagatgatgaaataacacctgagtgcaccagtgccagaaaaaatatga tgataaactatattacagtattaaataaattatttgttttttacccaagtgaagggagaagtggaaagcacctacagagg tagccaagagtcaagtccacatgggcaagtgggtggcaactatctttgtaatgatgcggcagcttttgctttcaataata ccgagacacactttgaagtgaatgcaatattcacggatttcagagttcaaccatttgctaatgcattgaaggaagatgac tttaacaagaatggtgagtatatgatgttaccctgtagtgttcctttcagtgctaactacgtaaacttcccctactacct cattccttttgcttaaagaggctgggtcaggacttgggcatgtgcaccaggaaccgaccaacttcataaacatctggctg ctttttatcaagttgtctaacattgcaatgctaagtcaccatggccagttcatacgctactttactccctttccattctt cattttaaagttgctgattggggtagataaatacaaatagattacttcatagaaagtgtgctgtacgggtttttattcac gcagtgaacgagtgagtttctaaagttttgcattgagtgaataaaatccgtacaaagcactttctatggtgaaatttgtt tgttgtatatataaggccaatttcatgtaataaaccttccaaatagagttctgtctttttcacacggtgaaatataaaga atatagaattctatatggaaggtttattacatgaaattggccttatatatataatagctgaccctttacaatcctctcaa tgggcgcccgaagtgagaagtgatttttgttgacagcccgacttcaaccaacaggtgtctagggaagaacacatgtggtt agtttccaaacggacttgccgtacaaaatcatagtataacatagctaatgcatcgcctggctcagattatagtgactgcg attattatgtcaatatacctatttgaactgagggactgaggggataagcaacaaattttcacgagaagaaccaaaaattg aatcaatttgtttgcgggagattgttttagcagaaggaggaggattgttttagcagaagcttttttcttttatacttaag ttatcaagacaaacgaggggaagttaggggaagttaagggtgcttgttatgattcaaactgctagtttatgagccataat tatcataaaaatttcgttttatcaatcgagttgataaaggttgaattaccaccgtgaaagatttagaaagccgacgtttc gagcgttagcccttcgtcaaagagaatggcgaaggactaaagctcgaaacgtcagctttttaaatttttcacggtgataa ttcaaactttatcaactcgtttgataaaaccaaatttttgttttcatttcttccaccaacgcagcaccacagtttcttta gaaactagaaatccataattattatatcctgtactgtaattgcaccaatgaagacactgcattagtgactacttgcaatg atggtccatttttatttactttgcagtgacggcggaatgcaaacaggattccccaacaacatcaacaactcgaacaccaa ctacgaataagcctagtgacgtcattccaatagctgtgggctgtgcactggctggtctcgtgctcattgttctcattgcc tacgtcatcggacgacgcaagagccacagtggatatgaaaaggtgtaaggttgaaaaaacttgggtgatgtaactgtcag aactgaactatttttaatagtgatgacgctattaagtgctaactatggtcctgatattcctttttacgacaacagaattt cagttttgaacccttcctttgtgggtagaatgccaggcgtgtattaataattacatgctttgtattttcgtcctaattca ccagactaataattattttagatgcattgaagaggtactagtgtacaagagcatttcaacatcgttttttcatttttcat ctctaattcagctctaactcggtatcctgagagcggaaattgagcaattgtaagtctaggcctgcatgtgcgataagtga gttactttttgccgtaaattgaccagcaagttactgagaacaagtgactacgcctcttctgcagggttgtacctcttcat tttgtttgttacttttattttcacaagtccgcattattttggcagttggtatttcggagtgataaattacaattagttgg aagtgggcagtctcttatcatcggactgtatgtaagtgttcctttataaaaagctaatttgaagtagcagcttgcaacga gtgtctagatttgcaataattattaccgaggtttagcttctcctttccggaaaacagtggcaatcgttggccgcaattat gtttgttgtcaactgatttttgtgtgtttgcagcatccatagaccgttgtcttaaatatgagagaaaataaaagtttcct gtttgtttgttcgttttttaacaagcaggagtcgttcgttggacgtttgctggaaaggtgaagcttttagactgactaga aaaacaaaatagggaaaaaatgatcacctcattaattattggtttctagttatatcacctttatttaacatttttgtgta gttattcaaccatttcgtggttgtgcacttcaacttttgaataccctaataacctgtctttgccagatcgttgtgcagtt ttacaataaagagggatatgactgttatgaaaggtgttatttcatcgatgtttggaaatttgatgtctggtttctttggg gtaggcctgtgtttggagacgtgtaacctgcatgcgaaataaccatctttcattttgtttgttttgagaagcacagttaa gtacacgagtcgaataaaagttgttttgccatcgttgaaagacgtctcgcaagcgtcttcagtcagttttactgataaga ataggatatcagaaggaaaaatcttcatcatttgcaactgattctttcataggcttcacatcgaataaagtatcgtcctt tccttttctaacgctccacttcctatcgtcttcaattcctgacgttcataattgcacgggcttccgagtgggaatacccg acgttgagtttcggcttcgcaattcgttctgcacggtcagaaatcacgctctagcttgtaaagcgcaggcgcgaagttaa cttaagcgcttactgtttgtctttcagatattcccattagttgtttactaaatttaatgtgcctgtcaataatgtggaac cgttgaacagttcagtctggcaagaaaaacttgtctagtgtaccttagtttaaatttcaaaagttgaggcgatttaattt aaatatattgcaacctcacttataggttttcatgtctcattaaacttattacacaattgccttttgaa |
Protein
Protein ID | aug_v2a.01939.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01939.t1 MKLIAVLAIVAVIFGNRANATTPAGESENTNPGKITSIPNANSTTAKPATNATSSSKLTSGNSTTNVSTTPKPTSNSTTN VSTTPKPTSNSTTNVSTTPKPTSNSTTNVSTTPKPTSNSTTNGSTTMKPTTAISTTIGSTTPKPITIKPTPPPSPGNFSL KENGSYCILAQFVAEFHITFEVNNTGGNLKKKTWSQTLGKHSNVTISGNCGPKSESTLVISWPKNESLYSLSLKFMNTSN SWSLSLFTFNVSVGKIPAFANATVKGEVESTYRGSQESSPHGQVGGNYLCNDAAAFAFNNTETHFEVNAIFTDFRVQPFA NALKEDDFNKNVTAECKQDSPTTSTTRTPTTNKPSDVIPIAVGCALAGLVLIVLIAYVIGRRKSHSGYEKV* |