Gene
Gene Model ID | aug_v2a.01950 |
---|---|
Locus | scaf663 : 184690 ... 191755 : - |
To GenomeBrowser | scaf663:184690..191755 |
Genes list of scaffold | scaf663 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
beta-secretase 1 isoform x4 | GO:0004190 GO:0005768 GO:0006508 GO:0016020 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.01950.t1 | gi|449663210|ref|XP_002166168.2| | PREDICTED: beta-secretase 1-like isoform X1 [Hydra vulgaris] | 0.0 |
aug_v2a.01950.t1 | gi|156379353|ref|XP_001631422.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.01950.t1 | gi|426370638|ref|XP_004052268.1| | PREDICTED: beta-secretase 1 [Gorilla gorilla gorilla] | 0.0 |
aug_v2a.01950.t1 | gi|512989645|ref|XP_004856728.1| | 0.0 | |
aug_v2a.01950.t1 | gi|395520218|ref|XP_003764234.1| | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.01950.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01950.t1 ctaaaacttccaacatggcgtgaaatatatcgctaaatattcctccaacattgatgagtttggattcgagcgatcttcgt acttttgaaaactctttttacgaagacgagcttcgcaagcgatcccacgaagtgcgtaatgcataaagtttacaagcaag tgtggcgtgcatttctagcactttgtttatgctgccacttgacatcgtgtggaaagaaaggaagctatagtgttcctctc cgtcgtaccaagagggatctgagagatagccgtggaaatcccactgaaaacttaaaaggtcgccctggacagggatacta catcgcgactgatcttggaacacccgcacaacgagtgagttgatgaagctgaaatggattgtatgatatcgaatcctctt cacgatacgtacaatctcacattgcccttgtttcttaattcctctctgacatctgtttggtatctttatacattgtcgga gtgtataaactcgtagaagctttcatgtttccattggaccatccagttttattttatgccgaagtgaaatgagaatgtta gcaagtaaaggtaaaatgagaattctaacaaatgcttgggcagccgtcttatacaaagaggaagtcttttcaagaattag ctgttctgagacctgaattttagtcgatatttacgactatagattctatgttgttgtaaaacgactttctcgatatgaaa gaataattttttcttcaattatttgtctcgtaaaacataaataaattaacacagcgcactatttttgtttaacttattta catatttctgtgcaatgcatcgtcgatccttttggaaaggtttcttcaaagagagaagtttgtgtagtcttttattatca agtggactagtgtaagcttccgtaacaaaaaacgaaaacaaaaacaaaggtgtcggttgatttcaagaaatcaggagcat gcacatttcgcaagataaaaacttaacaatgtcaagacatagtacccaggtgccatgtttggaaaatcaaatgaaaaatt tgttgattcgagtttcagtgtatcagttaccatctatgcattgttgagattatactttagaggaacacttaagaaagatt tccagtgtgccatatgttttgaggcatacgatagctgtcaccaatgcgtgaaaactttcaaatttcaacttgggatcatt atacaactatccctcaaaggggaggtgaatagtggtggatatatacagagacacgaagcttcgaggtatatatccaccgc tcttcaccaaccctgagggggatagttgttttagtatttagtgtttaatttatttagtatttttttcagatggataatta aaaaacacttcttcaatttcttcttctgaaacttttgcgaaacaaagcgccatttttctctccgttcacaaaacagtgaa tatccaaggatattccgagttatgggagccaatcaaaacgcgcgaaaattgctatccactgatttggtaaatatatttaa ctaatgaaatttataatccatcaaatattttcactcgtgcgctattggtctaagcaggtcacgtgggcgaatattcccca gtttttaaaaccgatggataataaacacaatagcctcaatttggctgtgaaaatatgctcggatatttgtccttggacat tatctgttcctcgaagctcacagttttcctcgagcttcgctcttggaaaactgtccacttctcggaacagataatgtccg cagacaaatatcccagcatattttcacgccaaatgaaggctattgtttacatatgtaacatgtttacagaaaaacatcaa aatatattgaaaaatttactatgtaaaatcagtcaatgcaaatttgtgtgaagaataaattcctctcctttaaaatacca ttttctagttcatcatcctctatttgaaatactttgttgtgaaagtcagttttaattcatattgataacagaactattag tttaagataattaaatgatcaggtgcatacacttgctttgaaaaggagactgaggtgaatgaaataaaagagtattgtca ttttaaaaatcctacagatcaatgtacttgtggatactggaagtagcaactttgctgtagcagcatcgcctcatccttac cttcctatctattatcacatagacaagtgagtgaaccttagtatattgtggctgaaatgccctgtaacgggagtttcaat aaatgtatgcatgtgttgtggtttaaatttagtcttggtgcaaaatttttagaactggtaaaatttttattttcttttgt tgtgttttcattaccataatctggaacaatggcaaataaaattgaaaccagttcaaaaaacttcaagacaaggattaatt taaaccacaaggccatcccaataaatgttccatttcacatcaccccgcctcttgtgatgctgggcctgtcatttgggcaa aaaaatgaaaagttggaataatttgtgttccagtttacttttgcatgttcaatttcttatttaatctgtaggatatacaa tcagatggtaaaagatgtttgttaacgcaactatcaataatttctaaacaacctttgaaaaacacagtaccgagtgtcaa ttaaaagacaagggcatcacataataccaataattggttaataaaacaagattgtgtgcctgtaaataaaagttctagct tctttgatcagtaaatctggaatttgttaatttttttttatttcttactataaaaaagggggtcagtcaggtgatgggaa acaagacattatattgggatggctttacctgaaaactaagggaaacaatgacaaatactcctccaattaatgatgtcaag ctcaactgttaaattgatttgtcatctaagatgtccatacacatccttttttattgtctaataagtgatccaccattcat atttacctgaccttcatttgttcaccatctgcctctctctttaccttaaaatgttttcctctttccctttttaagatcaa cttcatataaagacctaaacagaccggttgctgttccttatacccaaggaaattgggaaggagagctgggttcagacttg ctgcggtttgtggagggtccaaatgccactgtgcgagtgaatgtggcagctatcttgtcatctgaaaatttttatattaa tggctccatgtgggaaggaatcctaggtcttggatatacaaggttatcaaaggtaaatgacaacactaagatactgtagc acatactcaactagaagtggtgttgggaatgaaaggggtatttttttcccaaaagaaatttaaaaaacaactaagtgaag gctgatgtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncattcacatgtacagtgcacaccatccacccatcacgccaacttt attttttttgttcttattctttccctcagtacaactatgacaagacaatagttgacagtggcacaacaaatcttagggta tcagaagaagtatttgatggtatcctggaccgactcaagaaatttgacaaagtaagaacataagtaacttttaaagcata tgtaggcaatcaattcaataattgtgaaggcaggggcagtttgaaaatgaagagcacaactgagttggaatgagacaacc agttttctgtttataaggatggcaacaaattcagaaatcaagatgacagcagtccctcttggggccccatgcacttacac ttaaatagaaattggtgagttataaagacttatcagattaatccctttccatgtgatttttccatttccagcttggtgta ccggatgatttttggataggcagacaaatgatgtgttggaactacgataaaactccgtgggaggaattcccagacatgtc aatatcacttctatcttcaattagcaattccaaagagtttaggctcaaaatacctccacaggtatggcatcatgcatttt ttcctgagtgagatatgtaatgatgaaacatgtcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaggtcagagctgtacaggagatgactaagaaacaatagttagtaggag catcaagcagtttcaaaagagacttgatattttcacaacttgacaagcaaaacctttccatttgctgtgctgcataaaca tgattcgaagctaaatctttgttatgcatacagcttgccttgtccgcgaccattctatcccgcccaaagtaaatacacca agggcaattattttaggggagctcttgtgcacaaagcacgcacagcggagcaccatgggtaagaaaatgtggtaacctac ccatccaataaaatttggcattcacc |
Protein
Protein ID | aug_v2a.01950.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.01950.t1 MHKVYKQVWRAFLALCLCCHLTSCGKKGSYSVPLRRTKRDLRDSRGNPTENLKGRPGQGYYIATDLGTPAQRINVLVDTG SSNFAVAASPHPYLPIYYHIDKSTSYKDLNRPVAVPYTQGNWEGELGSDLLRFVEGPNATVRVNVAAILSSENFYINGSM WEGILGLGYTRLSKYNYDKTIVDSGTTNLRVSEEVFDGILDRLKKFDKLGVPDDFWIGRQMMCWNYDKTPWEEFPDMSIS LLSSISNSKEFRLKIPPQLALSATILSRPK* |