Gene
Gene Model ID | aug_v2a.02171 |
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Locus | scaf724 : 7146 ... 11861 : + |
To GenomeBrowser | scaf724:7146..11861 |
Genes list of scaffold | scaf724 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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ap-5 complex subunit mu-1 | GO:0015031 GO:0030119 GO:0046907 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.02171.t1 | gi|156381336|ref|XP_001632221.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.02171.t1 | gi|291223145|ref|XP_002731573.1| | PREDICTED: AP-5 complex subunit mu-1-like [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
aug_v2a.02171.t1 | gi|754344999|ref|XP_004349404.2| | hypothetical protein CAOG_02654, partial [Capsaspora owczarzaki ATCC 30864] | 0.0 |
aug_v2a.02171.t1 | gi|260818617|ref|XP_002604479.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_79220 [Branchiostoma floridae] | 0.0 |
aug_v2a.02171.t1 | gi|733890999|ref|XP_003206856.2| | PREDICTED: AP-5 complex subunit mu-1 [Meleagris gallopavo] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.02171.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02171.t1 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntccacctcaccttttcttaggcaatgacagtagagctcta tcagatcactgattatttctgatttcattttgaaagatgcatagtcacatgtagatagtaaaggttcctgcagggctact gtactttaaatcaacctaaaataattatatgtttgcagtttgacaaagatgttgattcatgcagcaaaccagagcataaa cccatcattgaagttaaagtcaaagctggttctttatggcctgtcgtcgtaattgaaaaggtcagaattcgctgtcatta tcaaaacactataaactataattattacactataaacagttcttattaggtttgtctttttcatctttacaatgtagttt ggtttggttttcacttgcattccattagtggagtctgatctgagtgatggcaatccacctctagttaaactgtgagttgt tttttagtaatacttcttgctatccttgcttctcttttctttcatctttactctacctttttgatatgtatgctaaaacc aaatcaatgactgtgtaggagatgattgtactaccaatcagaatttatgggaaatcttgtttttttttatctgtatcaat gcaattgctggcttctttggctactgatatacaggatatttatggggtgtcattttggcaaaaaactattacttcccatg gagcgtccatcaataaaagaacctatgatggtgctagttagtggctgctagcagggttggttccagctaaaggggctgct ttgcatacctccctgccaggcctaaatttgcccgggagcctcatcaacctttagactccaattcccaagctcatctattg gcaatgaatttgaatatcattgtgcccacttgcatttaagatactttccaatattaagtgattaaaaaaacaagtatatc ttgaatttgttctctcaatgttaattttatttaggcctggtgtgactttgggttattcctttcttcattctatggttgaa tttgtgggtggctggacatccaaggagcaggtagaaacaaataaggaaaccttgtagaaggatgttgaatatgtttaatt gtcataataatcattgctcatttagaagcttgacaaccagagtccaaccatagctatcacaagaatttatttgaaagagc atgtcaaaaattttgctgtcaaacttaccaactcaattcctaacgctaacccctgactgactgctcttatacactaggct aacagaaagtggtcggtctctgctattatattgaaagactaagattaaccaaggtagaatcccaatattattttaccagc atatgtggttctgtatattaatgtttgtgagtgaagtttacgtactttggattgtataactttgtgtgcatcaaaatgag gttaaggttgaaatggttttcctaaccctcagaagggagataaacaaagaaaatgatgaatgaaactaggttggaattat ttacatcagaatttcattttgacttctagctcatgcgtctttaataatttcttagcttgttgtccttgtttttcagttac aggccaaagcaaatgagttgcacaagtttgtttgtgtggcggctccatttggaactccaattgatacaaactccactact attcaagcacttatcaacaacaaagatatcaacatacctcaaaagggtaaggtatgttacttgggcaaacatcaaaacat gcctatattaaacgataattcatttttaatagtcatttcatgtatttactaaaatgttgattttgtcaagtattgttctt ttcatataaagcaacctgcatggaagcctgttcagcataaaggaaaacaacagcttactctcaatgtgagagaagaaatt agagctgctcaggtttgttcagcagttaggaaaaaaattgaaggcacagatgtaaatacagaaaaaaagcacctgtgtta gtcttgctttcagtcagcaagattcaaataatgaactaaaatgaaaaccattggaaatctattctagataactatttaaa ctgcactttacctattccatatcacatgcgcctagccttttagtagctatcttagctgagtgctgatgcccctatcaaat taggaacctatttaggcaaagttggaaaaatcatggttctcatacatggttttttactgtatattacagaacccacacaa tttgtgaaggcctggttactattctctcctgcaaatgtggcccgcatggcattggtttgcagataggcttgggtgcatga agtaacctttgtagaaattgccattacatcaagggactatggtgattgctgagatatgcagcagatagataatatctggg tacataatatactgcctataaactttgctccttaattccatttttcagcacgtcaagaaggaagttcaaaatgaatgtca acattttgggattatttcatgcaaggtatgtcccatgcataaagcaatcaattctgcatgcaattaaatgcttgtagcct tcgttgaaaccaaatttctcgtttttaaagaaactgtggtcctgtgttggtgggagagtgaaacataacaattttcacct ctctttgaaaatgttcagctttgtttttgttgttgttttgtctaaggtacatgttagcttcctgttcattgattttcttg cttgtattttttcttctagttaaataatttagaacaatcccttaactattcctaaatatgtaggctgacatggagggaat tccagaaataacagcaagcatcacctcctcgtggttggatttccttgtggttcatccttgtgttttagaaggtgacaccc atgtgcagcctcccatgttccagccatcacagatgctcaagggttcagaattggttgcaaggaaactgcgtttcagacca ctgacagagtcatttccattatgtcactattctgccaagacaccacatggtttgcctattcaaggaatatatcagatgca ggtgaaaggttttcagacctagatagaagctaacagtataaatgaaacattgtgcttgcattgttttcactcatgtttgc atctgcatgtactcagtcaatttttttttcatttctagggtgatgcaaattctgtgcaggtgtctgtgcagttaaagctt agtaacaaagtgaagaatttgtttgagtactgtgaactgcatttacccttctttcataggtttgttttggtcttcaactt gggagacttattgctaataataattattgattgggctatcgagtctatttagtaatgtccttctctgttctcattgagtg aggtgttgtctaatctcaaacttgctgctttggtcattttccttgcaggggtcctgtggttcaagtggattctgcagggc catctacaggtgctattttgctttctgctgacaaacgacgccttgtgtgggacataggtcagtttgcaacagcagccaca tttatggggttaaatagcaaatggaaagcctacagcatgcttccctcttccttgatcgttctgtgcaccagtataaataa taatctttttatcggtttatctaggtcagaaatttccttcgaagactcttgaggtctcattgaatgcaaccatccacttt ggtgaaagaaaacaacaaacaggggatcaaagtcaacaagatgctggatttgttgaagatcttttttgtactgggataaa cagttatgcccaggtactgaaattgaaagacaatccagcatgtgcatgtagtattgttaaattgttatttaggagaggta ctgcattgtttctattgtgtgaccatttctttgcttgttgaatggagtaatctttgtgtttgcccaggtgggatttctgt catccattattcttaactgtatagatttctaacccttgaaatgttatttttattgtatatcaggtctttttcaaaataca agacttcactttatcaggatgtgcaattgatcctaagtcaatagttgtttatccagcaggaaaattcaaacttaacttaa gtatgtaaagactactcttgtttatctaagtgctttggaaaggcatttttagttcttttctcttccaaaattacatgttt tccattggcaatccttgaccacaatcctttagaatcaacatcatctgtcattgatgagtgaaaatgacagtgaaatgtga tgcatagtattggcagtttatttatgggactccttttttatgttctctgatagtggcttatttgttacttttgtctttca acagcatatgaattctcaacattagattacaagatctggaacactaatggagatgccatatttgcctaccctctaccaga aaattaatagcgtcatagttatgaatctttttgttttaatacctttatcaagtgaacaacaaagcaagcagaatatatta tatttctttcacacatatattaattcagtgacagtatcttgtaccttttttcttcattttgtctcctttcatccaacaac ttgcacacattgtttttcaagttgtcatcatttagagaatcatttaccaagaaaaaaagcccaaggtatggcttttaaat tccactgaaaaatgttccgagattttgtaacaattaggaaaggtacatatagtataagtaaaaatatttttaaaaa |
Protein
Protein ID | aug_v2a.02171.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.02171.t1 MTFDKDVDSCSKPEHKPIIEVKVKAGSLWPVVVIEKFGLVFTCIPLVESDLSDGNPPLVKLPGVTLGYSFLHSMVEFVGG WTSKEQLQAKANELHKFVCVAAPFGTPIDTNSTTIQALINNKDINIPQKGKQPAWKPVQHKGKQQLTLNVREEIRAAQHV KKEVQNECQHFGIISCKADMEGIPEITASITSSWLDFLVVHPCVLEGDTHVQPPMFQPSQMLKGSELVARKLRFRPLTES FPLCHYSAKTPHGLPIQGIYQMQGDANSVQVSVQLKLSNKVKNLFEYCELHLPFFHRGPVVQVDSAGPSTGAILLSADKR RLVWDIGQKFPSKTLEVSLNATIHFGERKQQTGDQSQQDAGFVEDLFCTGINSYAQVFFKIQDFTLSGCAIDPKSIVVYP AGKFKLNLTYEFSTLDYKIWNTNGDAIFAYPLPEN* |