Gene
Gene Model ID | aug_v2a.03869 |
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Locus | scaf1419 : 39466 ... 43789 : + |
To GenomeBrowser | scaf1419:39466..43789 |
Genes list of scaffold | scaf1419 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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bardet-biedl syndrome 1 | GO:0000226 GO:0001764 GO:0001895 GO:0001947 GO:0005113 GO:0005119 GO:0005813 GO:0005930 GO:0007608 GO:0008593 GO:0008594 GO:0009566 GO:0016358 GO:0021756 GO:0021766 GO:0021987 GO:0030534 GO:0031514 GO:0032402 GO:0033339 GO:0034464 GO:0035058 GO:0036064 GO:0042048 GO:0042445 GO:0044255 GO:0045444 GO:0048854 GO:0051216 GO:0051219 GO:0060027 GO:0060028 GO:0060296 GO:0060972 GO:0061512 GO:0070121 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.03869.t1 | gi|156383636|ref|XP_001632939.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.03869.t1 | gi|291224566|ref|XP_002732274.1| | PREDICTED: Bardet-Biedl syndrome 1 protein-like [Saccoglossus kowalevskii] | 0.0 |
aug_v2a.03869.t1 | gi|115675647|ref|XP_783764.2| | 0.0 | |
aug_v2a.03869.t1 | gi|524889247|ref|XP_005101184.1| | PREDICTED: Bardet-Biedl syndrome 1 protein-like [Aplysia californica] | 0.0 |
aug_v2a.03869.t1 | gi|676451851|ref|XP_009052841.1| | hypothetical protein LOTGIDRAFT_115648 [Lottia gigantea] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.03869.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.03869.t1 aaccaacgaggagacctgggtaagacgccagcgaggctttctgggactggaatttatgatttcagtcgcaatcgagatta ttttcctaccagaaaatgagttctcaggtagatacctcctcggatggagcaaatcaaaggtatatatttggattttatag atttcgatatcagggattttaattctccttaatctttgtatttgcttgaaaaccgcctcttcgttctcacaataataaca ttggttgctgtcaaaaccaaaacacctgcatgagagtgttagctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctattatttcttaactctttctttttgttcatgtgatagggatgaagaagaatct ccagaaaagagtatttggctcaatgctcatctcgacccaatggcatgcctctataccttctccacctcaatttcattagc agacctgaatgctgattcagattacaaacttcttgttgctgaccttggtactgggacgtttgacatgaaactcaaagtgt tcaaaggtaccagcttatacatggagagcgccatcatcgatctaccaatagctcttgtgtcattttacatggacacaaat gatccccgtacaccagcaatagctgttgcctctggcccttttatttatgtgtacaagaacttgaggccatatttcaagtt caccttaccaccattgtcagtcaatgcagttgagcaagatctttggaaccaagctaaagaagacaagattgatgtccacg tcctgagagagatgcttgaaagcttgaagaatgatggtagcgaggggatgctctctgttcgttccctaaagttgctttct cttcaaccagaggaagttgaaagtttcgctaatgtccataaacatgcaccactgaagagacaaaccgttatcacatgcat gggaacaatgaagaagagtgtagcagatgatgatgctgtcagctgtcttgtgattggcacagagagtaaagatgtttatg tcctggatcctgaagcctttactgtccttgcaaagatgagccttccaagtgttcctgttttcatttcagttaatggcctg tttgacgttgagttccgcattgttgttgcatgtagagatggaaaagtttacactttgaagagaggtagcaagatggcaaa agcgtgcattgagcttgcagctcaggcagttggtctggagcgcacggggaagagtatcatcgtgggctgtatggacaata ccttgcagtgttactcaactaaaggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaattcaaatctctcagggtttaatgttctttgtgtgttggattta catgataatgtagcattcacatttaaatggcatggaaacgctttgagcaaaacgttttttttccaaaggatttgaattgg gtacaacattgactgagccaaatcgttctattctctgacattacatctgacattacctggaaaccattcatgcttataca atgaaaggacacctcatctacatggcctcatcacaaaacactaaacctacagcaaattctgttttgaagtgacagtttca ttgcaatagctgtagcaccttcttaaacttgcaactgtttggcattgcagctgttttaattgtttttaaatctaagttct tgagagacattttttgtgttgttcagtcttcattcagttctggtattgagccaatcacattatacactgttccatatgag atctagagctgcttcatccttcagtgaaacaagcaatcaaatcgaatacatgtacatattaagtgttgtaagaaaattag acaaaggcatgaaacaataagaggttcatagttttaagatcaagtcacaggccatttttgccgcagctatgagttagcac aacagaaaaaaaacttacatttatgttaacagtgacctttttggagcagcaaaggaaaagaaggcagacatgggtaatta aaagagaatatcttgatattgcccatgtcatttaattaattattaatctaaaggcctttttgctccaagtcccacttata agcagggcttgcatggtttattattgttgcaaacgttgtttccacggtgtattataattaattttgttgcaaacattgtt gccactgaacacggacttttttatgctgggtttcacaaatgccacagtttcacttaccatcaatagtaaattgtttacta tttt |
Protein
Protein ID | aug_v2a.03869.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.03869.t1 MSSQVDTSSDGANQRDEEESPEKSIWLNAHLDPMACLYTFSTSISLADLNADSDYKLLVADLGTGTFDMKLKVFKGTSLY MESAIIDLPIALVSFYMDTNDPRTPAIAVASGPFIYVYKNLRPYFKFTLPPLSVNAVEQDLWNQAKEDKIDVHVLREMLE SLKNDGSEGMLSVRSLKLLSLQPEEVESFANVHKHAPLKRQTVITCMGTMKKSVADDDAVSCLVIGTESKDVYVLDPEAF TVLAKMSLPSVPVFISVNGLFDVEFRIVVACRDGKVYTLKRGSKMAKACIELAAQAVGLERTGKSIIGLMFFVCWIYMIM * |