Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.04588
Locus scaf1694 : 60759 ... 68525 : -
To GenomeBrowser scaf1694:60759..68525
Genes list of scaffold scaf1694

Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.04588.t1 gi|156397291|ref|XP_001637825.1| predicted protein [Nematostella vectensis] 9.0e-23
aug_v2a.04588.t1 gi|449667424|ref|XP_002160221.2| 2.0e-06

Transcript
Transcript IDaug_v2a.04588.t1
Definition-
>aug_v2a.04588.t1
cgagatatggcaatgtcgctggggttgtcccgtgaacaagcgatttgatatggaaatttgtgtatatcgattggatattt
attgatttttacttaggttgatccaattatgcggtgggtgaaatcctgaaatactcgaaaatgttctgaaaatgtgccac
gtttgaaaaagaaccgaggctttctccaactcctgtcaagatggcggcggattccgtaagcagcacagatgcaaaattac
tgaagaaactaggtggagtagggctggtaatgacaattatcttcgccatatcggtaagttaaatactaaatcagatccta
atttggtgcttgcggaaaaacttgattgccaaagtataggacattgccatagctatatattttatgcacctatcagtgtc
aagcccgagggagggtgggtcgggcatagggtctggattttggcattttctgaaaaaaattatcaaaatctccaccccca
ggcaaaaaataattgtcaaagtatcaaaaattccacctggggcaagggaaggcagtcatatacccttcagttcttgttgc
acacaagaagaaagcaataaacaatgtaacaaagcctcaattaaacttttatacagaatattaacaaatggtttacttct
tttctgctgtttgtaacaaactgtattaaaacattacagaagagtaacaaatggtgtacttatttgatgctctttgtaac
aaactgtattaaaacattacagaagagtatcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttgtgttg
gaagcatcagataaagttgttttgcatgtctatcttcctgatacaaaagtaaacaaccattagaaaaagcactttgatca
atgacgtgcttaattattgttgttgtttgatgagatgtcttttttctcaactgaataatccttgtatttgttttttgaat
tccctcagatcagtacacaagaagctacaagtatagaatgaaagcaatggacaaaatgactgaactaggtcagaagagaa
agaacttagatgcttccatgctaataatttcattgtatcctaatcacaaaaatttaattgtgaaggtgtgaatcaacact
agagcactagctaatagttttctgaggaaaccataggtaattttcaagtatcaaaataatgaaatgtgggttgtaattgt
aagagaatcaacccaacactgattactggtgccttatttacattttgttcttacagatgatctgctatgcacaattgact
tcaagtacagtcgcaagaagaaacaatctgtaagggatcacctcaaatcactgcagaagtcaccttatagtgtgatacgg
ggtggagatgatactattaatgaagtatctggcatgtatgaacatgcaagatatgaaacaaaggtacccgatgagaaaat
ttaatggtagagcaacccagctgtaacaagatcagttctgggccttaaaagccaccaatccaaaggaatctacccccaac
accatgacaaaaattcatactagtccactgaaggtgctgtttaaacccccaattaaaactttacctgtgctaactcaccc
ctcccctgttaaaaactgtcccagttcaacctttgtcctctaatgaaataaattttaatggggcttacagtatgttaaaa
cgttttacttgtaagggaggaatctcttatcaatgcctttttgcttttgtcaaacatgggtgcaatttaaatttaattat
tcttattcttgcatgagatttgcacttcaataatcatgattcatgcagtttgctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgttt
gtgttggaagcatcagataaagttgttttgcgtgtctatcttcctgatacaaaagtaaacaacccttagaaaaagcattt
tgatcaatgacgtgcttaattattgttgttgtttgatgagatgtcttttttcgcaactgaataatccttgtatttgtttt
ttgaattccctcagaccagtacacaagaagctacaagtatagaatgaaagcaatggacaaaatgactgaactaggtcaga
agagaaagaacttagatgcttccatgctaataatttcattgtatcctaatcacaaaaatttaattgcgaaggtgtgaatc
aacactagagcactagctaatagttttctgaggaaaccataggtacttttcaagtatcaaaataatgaaatgtgggttgt
aattgtaagggaatcaacccaacactgattaccggtgccttatttacattttgttcttacagatgatctgctatgcacaa
ttgacttcaagtacagtcgcaagaagaaacaatctgttagggatcacctcaaatcactgcagaagtcaccttatagtgtg
atacggggtggagatgatactattaatgaagtatctggcatgtatgaacatgcaagatatgaaacaaaggtacccgatga
gaaaatttaatggtagagcaacccagctgtaagaagatcacttctgggccttaaaagccaccaatccaaaggaatctacc
ccaaccacgacaaaaattcatactagtccactgaaggtgctgtttaaaccctcaattaaaactttacctgtgctaactca
cccctcccctgttaaaaactgtcccagttcaacctttgtcctctaatgaaatacattttaatggggcttacagtatgtta
aaaagttttacttgtaagggaggaatctcttatcaatgtctttttgctttgtcaaacatgggtgcaatttaaatttaatt
attcttattcttgcatgagatttgcgcttcaataatcatgattcatgcagtttgctannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatttcctttcctccttg
actcttccttcccttattactcttaagcatcttaatacagagaggactgcagaccatgatgatgataataattccagtac
atctctgtagggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgttatggaacacacctctcaagtcttacagtatttagtttaaa
agttgggttcatttgtgtatactcatgcattattttcatgaaaaaaaaaaacgaatctctcaagcacagtcatgattagc
attgctaaaacaaaactgtgcaagcaagcatggtgtattgctgggatctcaatgtaaacagcagtttgcattcttgtagt
ttcttcctaattctccttattgagagaaaggttgataagagcacaaagtgcagtgcttagttatagaaaaggacccacac
aagtgtggagtaaaagtttgaccagggtgcgaaatgaactcactgactgactgagctacaaggccagacaggagcaaacc
atgagtagtaaggatattaagtcatggcaaactaacatgaactctataccctttcattagctatggagagatcactataa
gaagaagcaaggcaacagagtattaaaatactaatggctttcctctctggttaacttcagcaataagtgtttaaataaaa
accgtaatttttttgttaaatagtaggtcaagtttattagttaaataacaacttctgtggcttgtaaagttcttaaattg
agtaaatttcaaaataaaaaagtacaatagagactaaattggtggtttgaataataaagattgttgagcattgtttcatt
cactgctcctaaagagcatttgcattaagaggaaagaataatacagcaagaatagccagcagtgcttacaataaaaaaca
ataaaacctgtgtcttacatttcacgttgctttgcatattatgggcaacaaaaaagcctgcctgattttttatgtgttgt
gtgatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngctcatgataatgattttccagctttctgattggttccctaag
cccatcatatgagccattatcgttaagtttgaccaaataaggaaaaactgatgacgaatttcttgtgctgaaattttgga
ggtcggaaaaaatttttttcgcagcctcgtcggtaaagaaaatttcacgatttgaggaggtttcacccgaagaaatcaag
agaattgcttgaaaagttactaaaacagttattcttctcggacttgccagatattagccgataataaccaactcagccta
cggcctcgttggttatatgtatcagctcatatccggtgcgtcctcgaagaataactgttaattattagcaatttaggttt
aaaataatattttccatctagttctcaggttggagaaagagtacccaaagggaacaaggctgccctagtggctgtgtact
tccgtctgttacttatgtcattcatatcattttgtagggtgcggctttatgtaaatgttcctggaagtctgatagttgct
ggctccagtaacaagccaatcaggaaacccccatcaagcaccaagatggagccagtagcagctcaggatgctgacactgc
agctacaagcaaaatgactgcaagtggtgcaatcagattgtgacatctgaacaagcttcaaaagctgggcactgggaaaa
tggaccagccatcaacataactttgctcagctagtttcatcttcattgattaccaatcactttattttttttctaagaac
atatgagcataacaagatgcaaaaacttgatgaactgtccatttaataaaaacaatgaaaatttgaggtaaaaggtcttt
catgcctcctacatacgtatgtcttttgaattacttagacacatctgtaaactgaaatgttatttttctttttggcatag
ttaaaaacggttagaaactgaaattctttcaaacaataaagaaattccccaagcaaagctggtactgatctgtcctgctg
accactttttcttttcccacattgagaactcaagtgtaacctcagtcactgtcatcactatccacttctatgggtttcct
ttcctcttcttggcattcatcatcatcgcttccactttgctcctggatggtctctctgtatcttgtgaaaaaagttaaga
tcttgca

Protein
Protein IDaug_v2a.04588.t1
Definition-
>aug_v2a.04588.t1
MKAMDKMTELDDLLCTIDFKYSRKKKQSVRDHLKSLQKSPYSVIRGGDDTINEVSGMYEHARYETKYTRSYKYRMKAMDK
MTELDDLLCTIDFKYSRKKKQSVRDHLKSLQKSPYSVIRGGDDTINEVSGMVRLYVNVPGSLIVAGSSNKPIRKPPSSTK
MEPVAAQDADTAATSKMTASGAIRL*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495