Gene
Gene Model ID | aug_v2a.05033 |
---|---|
Locus | scaf1862 : 12438 ... 23765 : - |
To GenomeBrowser | scaf1862:12438..23765 |
Genes list of scaffold | scaf1862 |
Manual annotation
Study field | Retrovirus |
---|---|
Gene name | Adi-Retrovirus-related 13-4 |
Description | DNA sequence of this gene model showed similarity with that of Adi-Retrovirus-related 13-1. This gene model contains PAN_1, EGF_CA, EGF and Fibrinogen_C domains. |
mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.05033.t1 | gi|156350207|ref|XP_001622188.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 3.0e-29 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.05033.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.05033.t1 gataaagttaaatcaaagagaaaagcgtctagaaaaacagaaaggagaaaacggcccaaacaacgcgaaactgcgcaact tgcattgtaagaaaaatatgcaaatgtttgtaatttaagtcccacatgagatttcccgcgtaaatccacaggcgctagat gagttacttgtttataaactcttctccaaaatagtttttcctcgatatcttgcgattattaaaatattttaacttttttt tcaccaaaatttcaatccatgttttagttatatcatttatgagcaaaaaaaaaaatcataaaatttggcctttgaaggtc aacagtaaccttaaaaggagaaagaatgaaacgaagaaaaaaagtcttacaacaacatgagtcgacgtataatgtcctct tcctttcaggtattgcataacagtgaagagatggccactcttctgaggctctgggttgttcttacgatttgcaatgttgc tgagaaaacgatggcccagcaatgcccaactgaaaggtccatcagcggacggatgttgcaacgacacgtctataaaacaa tgttggccgatattgcccatcactgtttgtcaagttgcggcgcagatgaccgttgccagagcttcaattttgtgatatcc tctcgcaagtgtgagttgaaaaatcgaaccaaagaagccaaacctaaagatttcatttctgatccagacagatattattt cagaaaacctgtcaatcgaggtaacttgaatattatcatttttgtctcaaaacaaaatacctcgtcaagtaagtgattcc agctttgtttgatccttataagtcccattgggttccatccctgagctagcggccgagtcctgtaaggaaattaagatgag cgagaaagaagcaaccagcggcaagtattggctgtcttcgataaagccgggtattcccttagttgcattttgcaacatga caactgaaggtaaatgagatatgacatccatttataaaatatttgttctgttttattataattatccatgtgtcatcatc annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnatgttcattttcatcttctgtccgagccttatctcagtttatccttactagctatctttacttttgtcctcctcat ctttatcttctttaccctcacttacctttgaatttattccttttctttatcttcatccgcacgcatcttaatccgcgctc ttcacacgtacgttattgatgttgttgttgtttgtagtcgaggatacactacacgtaaaaacgactattgatagcagtga gaatatgcaagtttgtcactcactcagatgtcagtaaatcgatatgtcaacggcagatctattggtatcgattttcccaa ataatgccggaacacctctccaaaataataacgcgacgctgaagtaaacgatttgactcgtcctcgtgagggtttcgacg caattagcacatgtgtaactgagtcaaagctgtatgaccaaaagcgtgatagagacgccactgaggtttcaccagaaaat gtctcgatcgaaagcataacgtaaggttatcgatgtcgagtcgactattttttgccaattgttttcttggcccaatctta gtgtcatccaataaaatagtgagatttttctgcttgagccacacaagggttgccttttttccactgatgaagaggcagca gcctcgaaacgtatggtgatttacgcattttccgcgcaaataaatctattcactagtttcttcctcaaacaaccttttgc gcaacacagttttcatcttggttctttagttgattctcagtgattctgtcgctggcacagccttgtacaattttccattc gttaacttttagcggcagctataacatgcagtgttcgatttcatctagaacgaacgcagttactaaaacgacccaaaacc actttgaagtttaggacctttgaaacgacgaatgacacacattagtgtggaaagcaccatgtgtcattgagaatgccata gtcacgcaacataattcaaccatgccgtaattcaatgtgatacttgcggcgggtgttgcttcgtcttatcttggtggttc aagatcgttgcgaatgggtttctgatgggtctgggtcgttgcattttctagtaacaacactctcccagcaagaaaacgca gcagctcgatatggttccgagtagttttaactctatccaagggataaacccatgtttacaaaggaatttacttattttca aaccccattcaaatatataacaactaatcgtaacagagcttccattttgtagacagcgtatactccactttttgacagtt ctccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcaatttta gatatcaatgaatgcacggcttcctctccggtatgtcacgtaagcgcgcaatgcaacaacattattggttcataccaatg tatttgcgatcctgggcacaccggtaacggaaaaagatgcacaggtacgtaaagcgaaatgtcattaaggagaatagaac atgagctccttttttttttctgatgcatcttaggggcctgactagtaaatacatttttttttaggtttcaggttatagcc agagagagctcccgttcttgtcgaacggggcatttggagaagaccaacttattctcagcccttcgctccatctttttttt cagtcatttccgttgtcaaagtatctttcttacctacccaacgacatgtcacgaaaacatccagtttcctcgtacttgat ttgattgaaacgttattcgttttcgcttcagatattaatgaatgcaccgctttgccttccgcctgtcacgtgaacgcaca gtgcaacaatactattggctcataccgctgtacttgcgatcctgggtacactggcaacgggaaaacatgcacaggtaagc gaattagaatgaataatgacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttagagtttttttttctctttttttttt gtaagcggtcttctgtctatcgccaaaagactgtttgcggcatattgctcaaaactgttatgacgtaataaggcagtcat gtgacttgccatgtgcttaagttgttgttgccgaaccgccattaaaaacgttgttgtcaatcagttgaacctattgaagt cgttcgaacctaaacaccacaaagttggcgacggggatttggattattaaaatgacggaaagtgtggcaagtggttcgca gtccgccgaagtccaaggaggaagttctacttcaagtagctctccgatggttagttatttcggtcgaatggacgcttttg acccgaaagtagaagagtggtcgacgtatgtggagcgtcttgagatgtttttcgtggtaaataatgttcccgacgataaa aaagcagccagtttacttaccttgatcggaggacggatgtatgcattattgaagagtttaacaacaccgactaaaccgac ggagttgtcgtttaaggagattgtggagattatggggcgacacttgacaccaaaaccgattgtcatcgggagtgttctag atgtggtaaacataatcattccccagacaagtgtttccataagctttcgaatgccatatttgcaaaagaaagggacacat aagtccaaaatgccctcagaaaatctctagtaaaccgccagcttccagcaaacctaaacaagctgaagccaaacaaaaca agagttttaagaaaaagaagaaaagttcaaaaataaaatttgttgacactcaagcaagtagttctgaaagtgaggtgccc gaagatgaagattttagcttaagatatgaatttccaagtgaatggcctatgttcgccatacgtagcccctcaaggagaaa agctgacgaaattctggtaccagttaaaatcaatggtatttcttttaaaatggaactggacacaggagcatctgttactg tgatcccagaagaaatgttggagaaagaattaggatcagtgcccttagtggagtctagtgtgacactaaaaaattattct ggtcatgctatacctgtagttggtgaaaccactgttcatgtccagtatcagacccaacaagtgaatttgcccattgtgat cactaaagggaaaggtcttgctcttatggggagagattggttgtcaaaacttaagttggactggcatcaaattagtaaca tccaacaagccaatccacccaaaattaaattggaagacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngactcatcttttcgatcttcttttccccttttcatatttgccgtttcctttt ttttttgcagacgttgacgaatgcacatcgacgcctgtctgtgctatgcattccggctgcaccaatacattagcttcctt cagatgcgaatgcaaggctatcggagaaagctgtgagggtaagaaatcaacgtattaagccctggtcaaaaggactcgca agtagtcgcaagtagcggaaagttgaacttgcgaagagacttgcgttgggtggccaaacggtaaaaaattgcattgactt gcgtgcaaatttgatctcgaccaaagtgatcgcaagtcattgcaagtcaacgcaagtgcacgcaaggcctggccaaacgg atttgcaagtagactcaagttttcaacttgcaactacctgcgagtccgtttgaccatggctttatgtgttcatgtctgtg atggctgaattaaattaatccatttgaggaaagatgaaaccattcatacacacaggatgtccgctaacattctctccaag acaaagcaaacaaccagatatccaagttttcacaataatgaatgtatcacgagttagaacattatcacatgacgtcacta ggttatgtgtcagtaaaacaaatgaagatggcgagaacaataatattccttgatgaaaaagattggagtcctccgcaggc ctcttcttggctattgatgtttcggcgaaattgatgaattttgcttatatgtgatgggagaatgccaactaaaattctta aattatcgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttctttgctttagaaatact ttgcaatggacagcggacaaatagggctctcagtgacgggttatacacgctatcgattacttcaacttcatttcaagtga gtgcaatgccacgttacgacaaaatttcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnncttcatgggaaagcgtatgggaacgattatggaaatgttaccatttgtttttaaggccta ttgtgacatgacaacttctggtcaatcttggactctcattagtcggttctcaaacaatgatgccaagaactggatgaaag acagcggggaatggtggtacaataagagtgtaggcgttggagatatagcggacccatcagtcaacacagacatgctctcg ccaacattctggttggtcagaggtctcgaattcaagatcacgcgcagtgatgacccacagcacacccccttgttacggac cacaggtagctgtctcggtggacagacattccgacagaaaatggaaagttatggcaactttaggagtggtgcagtttggg caagcgatgactgccagggaaattgcaatgttcaatacggaggccagtttcaaacaaccgatggattcggacaagctgca tgcaatggatcgattcaaaacgcaacacaagtcggcttctggtgtgactgggacagtggtgatggagcagtgttgatgat tggtggaggagggaaatcctgtgatcgggcagatcacgggatcgcaattaccgaagcagaggaggcttcttttcgggaaa caggacaaggagaacacgattttggcaactacggggacgctggcacagcaaacagcaaagcctactctttgaacctttgg ataaattagtttacaagtttaaacgtcctattaatctgccatttatcgttttaattgaatgagttttatcttttcctctt tcgaagaaaactgtttttggctggacttaatgaaatggtttattttaa |
Protein
Protein ID | aug_v2a.05033.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.05033.t1 MATLLRLWVVLTICNVAEKTMAQQCPTERSISGRMLQRHVYKTMLADIAHHCLSSCGADDRCQSFNFVISSRKCELKNRT KEAKPKDFISDPDRYYFRKPVNRVPLGSIPELAAESCKEIKMSEKEATSGKYWLSSIKPGIPLVAFCNMTTEDINECTAS SPVCHVSAQCNNIIGSYQCICDPGHTGNGKRCTDINECTALPSACHVNAQCNNTIGSYRCTCDPGYTGNGKTCTDVDECT STPVCAMHSGCTNTLASFRCECKAIGESCEEILCNGQRTNRALSDGLYTLSITSTSFQAYCDMTTSGQSWTLISRFSNND AKNWMKDSGEWWYNKSVGVGDIADPSVNTDMLSPTFWLVRGLEFKITRSDDPQHTPLLRTTGSCLGGQTFRQKMESYGNF RSGAVWASDDCQGNCNVQYGGQFQTTDGFGQAACNGSIQNATQVGFWCDWDSGDGAVLMIGGGGKSCDRADHGIAITEAE EASFRETGQGEHDFGNYGDAGTANSKAYSLNLWIN* |