Gene
Gene Model ID | aug_v2a.07179 |
---|---|
Locus | scaf2695 : 113396 ... 122134 : + |
To GenomeBrowser | scaf2695:113396..122134 |
Genes list of scaffold | scaf2695 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
---|---|
Gene name | Adi-Rib72-2 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit results was obtained by BLASTP searches. This protein has DM10 repeats and EF-hands. See chlamydomonas gene (AAM44303). |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
---|---|
ef-hand domain-containing family member c2 | GO:0005509 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.07179.t1 | gi|118344122|ref|NP_001071886.1| | EFHC2 protein [Ciona intestinalis] | 0.0 |
aug_v2a.07179.t1 | gi|573902549|ref|XP_006638999.1| | PREDICTED: EF-hand domain-containing family member C2-like [Lepisosteus oculatus] | 0.0 |
aug_v2a.07179.t1 | gi|597731016|ref|XP_007227884.1| | PREDICTED: EF-hand domain-containing family member C2 [Astyanax mexicanus] | 0.0 |
aug_v2a.07179.t1 | gi|156359408|ref|XP_001624761.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 0.0 |
aug_v2a.07179.t1 | gi|602656573|ref|XP_007434019.1| | PREDICTED: EF-hand domain-containing family member C2, partial [Python bivittatus] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.07179.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.07179.t1 gtgttccactacctccacccaatgatgaagagttttacaccgtggagaatttcaatgttggtcaggaaatcacactttac tctcgcacatttaagatcactgtaagtataaagacattgaatgaaaaagtctgtgcaattttatgagagaagtttgcatg cgggagatatagcatttgatattaatgattattttgatttcatttttgatttacagggctgtgatgattttacacacaat tttctccgcaaacttggggttcgaattggtaatcagaacaacatcccatctgatccatacacagaacatcgtaaaaaggt ttgttctcttacggaatactagctttaagcattgtatatcattcacacacctgcaaaacagttcatttcacattattgat aggatgagaattaggcttcaaaatagtaattgcaggggtgcctggagaaaagccttaagtgacttctgataaattaccag attcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnagccagtgactttttgctgaaataagaggcctcgtctgtctataatttacaaaattagaaattttag aattgtaaaacatctgttgtttttgtcccacaatatgacctactacaaaccatttgtggcgactggtagatagagtatac atgccactctgaagatcttttgagtcgatcattactcttaatcttgtccaagggaattttgatttaagtgcacaggaagc accgattgttatatttaaaacattatacagtgagagggaagtttttaaattttgggttattttaacacacatgcgaatgg gacattatgctgtcaagccaatggtgtgatctctgaagtttcactcaaaggaaaaatgctgcatatcatttttcttcaat ttttttgaaatcaacaataagacagcaacaaaagaaactcaaagacactgagcaagctgctcacaaattctattataaaa taatgtagctttcctgtgtaagtgtggaaattcatctgcagatttcgagtatgctggcatttttaattgagcctttatgc acttcaccaatggaataggggcaataatatcccggttccatgtgtgtttggaatgggtggaagagctattccattggtgg aaaagtgaataaacatgtggctattataaatgatgcatgctcaattttgataaatgatgtataaaagtacttgagtgtct tattttaaaagttaaagcataagtcacctttttaacttcagaattgtgttcacataattttgttaaggtcttttctccta gtccaagtttctctaagcatttggtttaatcagtgcttaaaccagactgctaagtctacatagaaacgtttgctggtttt gatacttttttagtgcttacgatgccttgagcttggtcagcactaaatacttctttagttccttttgttagcactacttc tttggtgcttataaccatacttttagcaactggcccctggaggagttgggggggatatcacctcatgaactgtaactgag gctatctgatttaatttgtttttatagcatgtttggtgatgtccgcgagatggagctgcattatttccttgctgacgata ccgtggagatctgtgagagaattccaaacaacagtgggagagatgccgtgcccatgtttcttcgacgacagaaattgccc aaggttggtcaattttttgacctgttatttgtagatttaaggaaaacaccagcttctgtcatttctgattgaagttctgc tcttttagaattcaaagtaactacccgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnntacgggtaagtgtgcaatttgcctacacagctctgtagggacaaccagttcagtcaatagc aactctataattgtggcaggttatatactaataatttttttaaataactttgtccaggagcccacttcacttcgtcaacc tggagagattactggtaggacggtcttgaacgtttttggtcccatgggtcatggaggaagatggattcttgacagcttaa aggtaaatttcaccagttcaaaagtgctttatactggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcaagtggaggctgtgggca atcaagcaaaagcttggcatgatgagggtacttgggcataaatttctattaaagggataagacccaattggctaaatcaa ggttgtagcgctgccattaattcaaatctctctctttgtgtattgtatttgcattataatgtggcattcacattttaaat gatactgtatggaaattcctgaaacaaaacgtttcattaccagagggtttgaattgggtacaacattgatttagctcaga ttcccctacatcacgacttaatcattaaatgctcttaatctgtggctatacacattgtgcaatgcttttgtcactgaaga tgtcgttctccggttgttttcgttgtcagactggtgctgttcatacagattattatcatgacagtgacctcacgattggc tctgtcatcaatgtctggggtcgcaaattcctcatttgtgactgtgatgagttcaccaaggagtattacaagtcaaaata tggagttggtaagtattggttgactagcctctcctttgctttggcacaggtccttggaaaaaacactattaatacagaca actgtagcttttcaacagtgaaattaagtgcatttaagcacatacatacatatttacactgctccttggttatctgctgc cttctttgtgagaaacaacaaccattttataaattatgaaacagacacaaaatctgtcgtgttgattcactcatttgtgg cctactttgcatggcagccctcagtgtattgttagcttctgctgttcattgtcaggccattgttaggcctgattttggct ctgccaggccaaaaactattctactggaactctgttaattaaaagatgcgaagaccctgtcaggcaataatgtggaacgc caatatgttttgatggctggtggctttttttctggatgttgcaggtgattttgaaagcatcagtttcaaagctgatccag tgtccttgccaatgcgagagatccccccctataatggatttggctctgaagaggattcccttgccacatgtctcagcctc agacccaagcccactcggcgagattttaagaaattcatggaaaaagacaggtacaatcaaatttagaaaagactataata attattgttgagcgggttgcagaaatgatcttattcgtatgtcatgggcttaattcccaccctggttagagtttttctct gtccaggttgtttccataactagggctaatactcactttgtcactcaaatggttcattttggtaaaaaaatttgtcaggt agtatttcttaagctagagttggttcataattctcttaccaggtgaatacttttttaatcagttaaaacnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnngatatcatcagtaaccaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnattacagttgagcccgcaaacaaaatttcaaaatgtcagccaccaaccctcccctccccctaccggggtcaacgac agagtttttgagttgtaaaaattaaacttactccgttgcattgcaggacctttacatcggtgcaaatgtcgacttccata actttaagttcatcctaattgacgccgatgagtatgctgtggtttacatggaaaaacacgccccggaatttcctcaagca aatgtacagatcattctgcccaaactcaagcctatcttggaccagaaatatgaggaaatcaagcgcgagtttcaggcgtt tgatatcgaaaacagcggcaaaatgccggccaaaaatttccggtgaatttttagtttctttgattatattttcatgatcg cttttgctcgacgctagacgtttaaagggaaaagtggcaaaagaaactgaggtgcattcgctcttgtacatgagggagac agagtagaacttctttacgcactaaccgttctcttccatggaagcgtttgagacaaactttttgccgttcgtatggcctt gcttgtgaacgttttggctagaatgccattttagaatatgaatatcacttttggctagaatatcatttatattagccgtc cttgtcagtaataatccactcagtttgtccaatctctttcagtccccggtcaatttttgtgcgcggcgagtcccctgctg agggtgtgggtgtggtctaattgaggtcatcttttgtgcccattcgttctcgataaaatgctgagtaattcgatcattga tttattttcttaatgttttgctttcagggaaatccttcaaaggtttggacaaggcatcttaacagtacacgagcaactga ctgtggcaagacattatggagatgttcaggtctgaaataaagaaggacatttcctttttagtttgccttcgagtcgtttt gtggtgtgaatagaccttttcagcttgtacattttgttttcccatttcaggccacgtgatgctactcgagggaatagttt ctttcaaatgtcgtcttatacacgtgcaaatgtacgcataactaatgaaaaaacaaaaggaaaattcccatgagggcatc acgtggtctgaagtgggaaaacaaaatgtacaagctgaaaaggtctattgtcagagtactttaaaataacgtcgttgaac aaagttctgagcgaccaaggaaatttgccatcaaagtagtttataccaaaattaccaccgaagaaagaatacaaagctat gcatttattgtgaaggcttgcagctcaccctagctcacctattcaactctttcgatgccaagtcttcgtgttacacttta ccatcgacgcagtgccttagttaaaagctaaactcgtctaaagttcatagccgtttgttttaggtcgaggaagacgactt tcagttgttagtggtagcgatccaggagcagttgagaaaagctaacttcgaggattttgccaacatgatggattcctgta aacacgaggacgtacttgg |
Protein
Protein ID | aug_v2a.07179.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.07179.t1 MLVRKSHFTLAHLRSLAVMILHTIFSANLGFELVIRTTSHLIHTQNIVKSMFGDVREMELHYFLADDTVEICERIPNNSG RDAVPMFLRRQKLPKEPTSLRQPGEITGRTVLNVFGPMGHGGRWILDSLKTGAVHTDYYHDSDLTIGSVINVWGRKFLIC DCDEFTKEYYKSKYGVGDFESISFKADPVSLPMREIPPYNGFGSEEDSLATCLSLRPKPTRRDFKKFMEKDRANTHFVTQ MVHFGKKICQDLYIGANVDFHNFKFILIDADEYAVVYMEKHAPEFPQANVQIILPKLKPILDQKYEEIKREFQAFDIENS GKMPAKNFREILQRFGQGILTVHEQLTVARHYGDVQVEEDDFQLLVVAIQEQLRKANFEDFANMMDSCKHEDVL |