Genome browser

OIST Marine Genomics Unit since 2008

Gene
Gene Model IDaug_v2a.07515
Locus scaf2820 : 2296 ... 9625 : -
To GenomeBrowser scaf2820:2296..9625
Genes list of scaffold scaf2820

Manual annotation
Annotation by Blast2GO
Annotation GO
kelch-like protein 20 GO:0004842 GO:0005802 GO:0006895 GO:0016605 GO:0019964 GO:0031463 GO:0043066 GO:0043161 GO:1990390

Blast Hit to nr / sp
query Subject ID Subject Name evalue
aug_v2a.07515.t1 gi|156346368|ref|XP_001621522.1| hypothetical protein NEMVEDRAFT_v1g195679 [Nematostella vectensis] 0.0
aug_v2a.07515.t1 gi|585679074|ref|XP_006819450.1| PREDICTED: kelch-like protein 20-like [Saccoglossus kowalevskii] 0.0
aug_v2a.07515.t1 gi|390364741|ref|XP_799147.3| 0.0
aug_v2a.07515.t1 gi|470638138|ref|XP_004324308.1| PREDICTED: kelch-like protein 20-like, partial [Tursiops truncatus] 0.0
aug_v2a.07515.t1 gi|704189086|ref|XP_010138218.1| PREDICTED: kelch-like protein 20 [Buceros rhinoceros silvestris] 0.0

Transcript
Transcript IDaug_v2a.07515.t1
Definition-
>aug_v2a.07515.t1
cttgtcgtcttttaatcgaaacattgactaatctcatcaaagtgtttgtcgcacgattttacaggagcttgctaggaaga
tagaaactcaagattaatcagaaaggtatttttatgacatgctcctattttaattcaatttttgcattgaccacagaaca
ggaaaactcttcaattcaattacctcgatcctctctgaactattgatcgcttgtggattgcgtctttgtttggagcttat
ttctggattattctgaataatttcatagatgccaccatagttagtaactatgattccacgcgctaatgcaatgttttatt
gctgcccacagcgtgaactttagctctccatggacttcgacagtgtttcaccggacccatctgttcagcagcttgacaat
gagacatttaagtttgaggcggggagcaaacacggaatcaaggcgttgatggtgatggatgatttgagaaaacgccgcca
gctttgcgatgtaacgatatgtgtcggctccaaaaaaatatacgcacatcgtttggtcttgtcatcgtttagctcctatt
ttctcgccatgtttaccaacggaatgatggagagtgttgaagaaaccataacactgaaagatgtagatggaaatgttgtc
gaactattgattgattttgcgtacagtggaaaacttgatatcacaattgacacagtgcaatccttgctttatacttcatc
tttatttcagctgactgccattcagaaagcatgttcggattttcttcagcgacagcttcatccttcaaattgtttgggaa
ttcgttcttttgctggcactcattcttgtactgtactgctccaggcctctgagaagttcatccacgaacattttaatgat
gtcgtacagaatgaagaatttttgcttcttcctcgagaagaacttgccacgttgttgtcatgtgaagaaattaatgttaa
ctcagaagaagatgtctacaatgctcttatagcgtgggcgagacaggatgtagacgaaaggcagtccttcttggctgagc
ttcttgaacaaattcgcttgccaaccttatctccccattttcttgttgatgaagttgaaaaggaggaacttatccgtcaa
gatattgcctgtagaaatctcctcgacgaggcaaaaaattttcacatgctcccagacagacggagtaaacttggatctca
gaagtctcgacctagagaatctacctttagcaagttatttagtgtttgtggaatggactcgacaggccacccactcagaa
ctgtagaacagtacaactttcacagtggaaaagtgaagtatattcctcctctgaacactcctcgcagtgggctaggtgtg
gctgtgcttgatggcaagttgtatgctgtgggaggacatgatggaacctcctaccttaacaggttaggaaaacatgctgt
ctaatattagaacattttccaaaggtgctatctttgcatttttgaaaatgtcagattgagatgcacatgcaactcaggtt
tggtgtcattggccactgaacattggtgcattgtattcaactacatagctcataataggagtaccaacaacctagcctgg
gtttgcttgaaccataattatcattaaccaatgttaactaccacagaaacatataggttttgataccaatggctagcact
aaccacgtcctgagtaaccggccctgattgtacagctgacttaaaagagaacttacaccattgtcaacatgcaagaattg
ttggaaagtttctatttggttacaacaataactattatggtgaaaatcctttttttaattatcagtaaagtactccatca
cctatggcaaattgttggagctgtaagcaataaatttttttctcttgtaagttttggtgtgccagcacagatcatctaat
gtccttaggggaattttcctttaatcttgtcttatttttgtaatgacaattcttgtggtctgtatttggaagaattgcac
aagttaaagagtcctattaattactttgtttactttgttttgttgacgttttttttttcacacatggtacttatctagtt
catgatttatacacacagtctttgcagaatctgtcagctatctgtctgctattaaagattatatgtttgatgaaatattt
ttattttgctaaaaaacaaatatgtgcacttttcttggaatgatttgttaggtacttgtccaatagagatcaatgcactg
gtgcagctcatctaagagagtgaaatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaagatttagcaacagag
tcaataaagaaaaaaagctgttacactcgcttcagttgttaaaatcaacatgttctcggttgcgcaaagagtgtttaaaa
ctggtacttttgtgcttcccaatgagaataaattgcttttaattgtgtacaacgaaatatggagcgcgctcgaacgccga
ctgaatttaaacatgaatgaaaactaccataggttgggatctagcaaatttatcttttattcgacgatgcaaaaatgtaa
gagaaaacaaccagaaaaagaacggcacactgagttatcgtgaacatgacccgcccactgtcagcccttgacctcgcccc
ccttttagcattctggtcaccggagccttcgatcccttgtcttgagacggaagcaccgtggaatgaaaaaaatccacctt
agcctttttttttagatattcttgaaaattcatttaaagagaagttcaagttcatcatacaataaggtgtaaataaacgc
cgggttgaaactgaccaatcagaaacgttgttttccagatccttcgtctctctcagattggagttatgtaatcgtttatc
gacagaaggtgaagattatctcaaatagccgtttctccgtcactttctgtctgtctggttcattattcgagcaaacagtt
gctctccttattatggagaaggaagctgaggatgatatgtcaaagggaaacttcaacaaagcacgagaaaagttcgagat
gctccttcaacaggataaatcgaaaactaagttttggctcttgggcaaagctgattgtttggcctgcgaggggcgtctgc
atgaatctctgccagtatattgtgaggcctttaaatacggaaaagtaaacccagatcgtctccatcgctttgtaaaagca
ctttcgaagctgatagagaaagatagctgtgcaacggagcaacaaacgccggtcgaagatagtaatggattgcaatgtgg
agtgtgcacagggttactttatgatcccgtaactttaccctgtggtcattccttttgtagactgtgtttgaaaaagcaag
agagtgagaaatgcgtacgctgtggtaatcaattctcctacagtcgcttgaaaacaaatgtgatactgcagcatgtgttg
gagaaatcttttaaagtagaactggaagcgactggattgcgtcttcaaggaaaccaattacatcggaagaaaaatagcct
agaagcgatcgaaaaatacgaagaggctgaaaaattaagtaagtagtcag

Protein
Protein IDaug_v2a.07515.t1
Definition-
>aug_v2a.07515.t1
MDFDSVSPDPSVQQLDNETFKFEAGSKHGIKALMVMDDLRKRRQLCDVTICVGSKKIYAHRLVLSSFSSYFLAMFTNGMM
ESVEETITLKDVDGNVVELLIDFAYSGKLDITIDTVQSLLYTSSLFQLTAIQKACSDFLQRQLHPSNCLGIRSFAGTHSC
TVLLQASEKFIHEHFNDVVQNEEFLLLPREELATLLSCEEINVNSEEDVYNALIAWARQDVDERQSFLAELLEQIRLPTL
SPHFLVDEVEKEELIRQDIACRNLLDEAKNFHMLPDRRSKLGSQKSRPRESTFSKLFSVCGMDSTGHPLRTVEQYNFHSG
KVKYIPPLNTPRSGLGVAVLDGKLYAVGGHDGTSYLNRLRCTCNSDWSYVIVYRQKVKIISNSRFSVTFCLSGSLFEQTV
ALLIMEKEAEDDMSKGNFNKAREKFEMLLQQDKSKTKFWLLGKADCLACEGRLHESLPVYCEAFKYGKVNPDRLHRFVKA
LSKLIEKDSCATEQQTPVEDSNGLQCGVCTGLLYDPVTLPCGHSFCRLCLKKQESEKCVRCGNQFSYSRLKTNVILQHVL
EKSFKVELEATGLRLQGNQLHRKKNSLEAIEKYEEAEKLSK*

  • MGU Home
  • Genome Projects
  • Information
  • Genome Browser
  • Blast Search
  • Keyword Search
  • Downloads

Gene ID:



Keyword:



  • Login

copyright © Marine Genomics Unit 2015
Okinawa Institute of Science and Technology
1919-1 Tancha, Onna-son, Kunigami-gun, Okinawa, Japan 904-0495