Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.07959 |
|---|---|
| Locus | scaf3017 : 63006 ... 76715 : + |
| To GenomeBrowser | scaf3017:63006..76715 |
| Genes list of scaffold | scaf3017 |
Manual annotation
| Study field | TF not for publish |
|---|---|
| Gene name | Adi-CBP/p300-3 |
| Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See Homo sapiens CBP (Q92793). |
| mRNA evidence |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.07959.t1 | gi|156383389|ref|XP_001632816.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 3.0e-16 |
| aug_v2a.07959.t1 | gi|542178279|ref|XP_005468443.1| | PREDICTED: histone acetyltransferase p300-like isoform X4 [Oreochromis niloticus] | 1.0e-10 |
| aug_v2a.07959.t1 | gi|548535380|ref|XP_005752311.1| | PREDICTED: histone acetyltransferase p300-like [Pundamilia nyererei] | 1.0e-10 |
| aug_v2a.07959.t1 | gi|542178275|ref|XP_005468442.1| | PREDICTED: histone acetyltransferase p300-like isoform X3 [Oreochromis niloticus] | 1.0e-10 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.07959.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.07959.t1 gtctcgctgctgactgcattgaccaatctcacctccattaattgaggtaaaatttaagtgaaaccgttgtgaatgtttgc tttcttggcttcttaatgttagcgtaaaaacgaaacgtgacctcctttatgttaatttctcctcccattgttgctgctga ctgcatagtgattttcaacttaagaagcactgaatcaatgcttctaggatagtttttcgtttattatatggtcaggtaaa atgtcttgtgtaggcagctgttgtgaaacgatgtttagcagatcgtacggcctgtccatccaatcaattgcgaattacac gtcctaatcgtaaatgatgttttatagctaacaatacgattacgtttgttagtttcgtgagtatcaaagtttaacaatca caagttgctagtcaagtctcattccaacagcacatcgtagcgatattaaaagcgacggcaaaggaggccgtagatgcaaa atgattaaagcgaaagtgaatcgagagaatatttgtaaactaggaacactcgatgctacaaatttaggggaacatgtatt tttcacgtttatttaggaaggcgagggtttgcagggtaggctcaattcatttgtgtatcgcgtgactttagctttattac ttgttcgattagtccgtccgcttcagagccatgaatttgagggaaaaggtacatgcaaattgattaaagcgaaagtggat cattagaatatttctaaactaggaacccttgatgaaacgaatttagaggaacatctattcttctcttttatttgggaagg cgaggagctgcagggtaggctcaatattcatttgtcgatcgcctgacttaagctttatcagttgttatactagtccattt cagaatcatgaatttttaaaagcacgtgttgattttccttgttttcttttagggaaatggtgatcgccttacgttcatat 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Protein
| Protein ID | aug_v2a.07959.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.07959.t1 MATGSEYTEEQLNFFKVCFITTEELTDGLRTIFKQEWDNRYATTLGEWKDEPQNGQELKNSESPRNQARNQELLATMING NRAEWDCTMLFYAILYSDCIGRGLNAVVRSNVDDLRKFRNEVFAHAPQGQISQPKFQSAIAKVQGAFRALGLSTVKIQEI RNQANFPTSHLKKVLKEVDRLKQQVKVLEGQLHSETTPFCILPPKPSHDIAARNDEVAKVTQALKQLKETNESRLSYLYI SGNPGSGKSQLAGLVAEQIFKESADAFVMTLNAANLDRLLDSYVSFARHLKCPEYAVANTLNDKDLKTEEKIAYIKSLAG TKVELYASWLLLVDNVVSIPEMHAHLPDKGNSHWSKGQLLITSQDTTSIPPDNSFIKQMSVSKGMALSDATSLLATISGI ADDETAKKVAHALDYQPLALASAATFVKQLCDSKPSSNVGWRDFLKKLDEGQLKNTETFLSNTNATYPYSMTTAIALALE KSMSSDKVLKHSFNVISVFAPHPLNLDIVTNYIQKAEENSDKNTEGEFNDKDVIGLRISKSSLLLLEEDSGEIYVRIHQV DYDLCIRRDKDKGHEHKMERLGLDLDLDRQQEQDDRKERPQLTAQEERRLKIQRLIESLAHATNCTKGTAKKWECAVPFC RHIKLKLRPQQRQFAQTQTPVCRMAATQRQSMQPQPQIPGKSMPPTVGAGMGQSYQTLQPKQELPPYQQSVMPQKAVISH PPPRAVEEAQKIAQAATMQAVGSAVPMDPVYHIHSKVFPNSSLPIWPHRLDQ* |
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