Gene
Gene Model ID | aug_v2a.08157 |
---|---|
Locus | scaf3115 : 83386 ... 93245 : - |
To GenomeBrowser | scaf3115:83386..93245 |
Genes list of scaffold | scaf3115 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.08157.t1 | gi|632946156|ref|XP_007888419.1| | PREDICTED: interferon-related developmental regulator 2-like isoform X2 [Callorhinchus milii] | 7.0e-22 |
aug_v2a.08157.t1 | gi|602627545|ref|XP_007420718.1| | PREDICTED: interferon-related developmental regulator 2 isoform X2 [Python bivittatus] | 8.0e-22 |
aug_v2a.08157.t1 | gi|156408229|ref|XP_001641759.1| | predicted protein [Nematostella vectensis] | 8.0e-22 |
aug_v2a.08157.t1 | gi|602627543|ref|XP_007420717.1| | PREDICTED: interferon-related developmental regulator 2 isoform X1 [Python bivittatus] | 9.0e-22 |
aug_v2a.08157.t1 | gi|632946154|ref|XP_007888418.1| | PREDICTED: interferon-related developmental regulator 2-like isoform X1 [Callorhinchus milii] | 2.0e-21 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.08157.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.08157.t1 tagtcattcttgctatggggagctaggtgagtagctttaggattgtctcattttcgtcttcagttagttccagaatgctt tagctttgtttgtatgaagacaaattaatgactaaggtcatgcataatttcattatttttatctacgtttcctacttttc caaagagttcttatgttttatctccctaccctccctaaaggcatcccttgcggactcgcagtccatcacgttttcacgga tcttttacgtcatcgccggcattttcttcatcccacttgttgggtaaggtctactatcgcatctaccaatgaattttcgg aggtttcagctagaaaatactacttgttactgtttcattgctagaaaaagaagaagtatacgaaagaaaacgttttgtgt tttaaaataacacattaggaacaagatttaacgttagatttttgaaaacaaccatgcctaagggagactcaaaaggtaaa agcaaagggaaacgcagtcaacaaactcggaaaaacggtactttttgttttttatgacattcaaattgtattcgttttct aattaacaaagttttcttaaattctgagagaaatcggatggtaggaagttgcttactgttgagcgatcgatctttgttat attttgttgctttgatgtcgatgttgacatctggacagagtagttgcgcgctattcgtcattcattgatcgcgtcttttt tagttcgattcatcggatcgtagacttatctgacattacctcctggttttaatttgttttaggtcgaaggggagacgacg aaagtaatgatgacgacgtggaaacgcaaagtgtagctagctattcatcaacgcctggaacgcacagcggagatgaaggt attagtttcttgtcagcacgtgattatttttatcatatgcttcatggtttggattttacagtgttcactgaggtcttttc aattccttttacttttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnttactttgtgtggaaacactctttataggaaggaaaccattgtggattgtattgaaagatgcctgaagagag gtgagtgcttcttatcaaccttgcccgctactgtgcttgcattccttgcaattcattctaagttatttctttacaagccc taggatttcacagtaacgatcgtttccggtaccgtgttgttaccgtgcttgagaaataacggtatcgaaaaatagcttcc ctttgacatattaaaccttaccgattaaaatttagttgataaattataagcttttcccaatgtgatcccaactagtttaa caattgtttggttgtttctctggctaacacatacaaaactgaaaccagttgtttttcttctcttgttcgccatcttgtat agttcccaaagtgcattgtgcggtagttgcagcccacacacgtagttttacggccatttccacagttgaaagatgctaaa taagcttttgaaaaggcttccaacacggaaaaaaaaaagactgaaaccgcacacattggtttaagaacctttagaaagtg atctttttgtgacaatttcacagtggaaacagataatgacgatcaatgctccttcctgaaatgtaagatttgtaacaaac atttcatgtgggtacatttccttgtatgcttcgatcttagttcaataattgttgaagaactttgcccgttttcatcttca taattgaatcaaaatatcgcttaatttttagaataaaattatgggcggaagtgaaattgtattaagtattgtaacaacat ttatatcaaaatgggttgccatgaattttgacggaaacaaaaaatagttacttaagggttcccatgatctctgggaatgg aatcgaaaaattgtttaccacaagatttgaaatcctagggcttgtctttatgcaacaaacctttagttttggggcaaaat ttttaaaactggttcaattttcattttcttttttcatgtatttattaccataatctggaacaatggcaaataaaattgga accagttcaaaaaattttaaaccagggataaatttgaaccacaacatatacacatgttttatctttctttattttttcta ccttaactttggcatggtccgtgaaaatgacaacagggaatcatcttttaaaacatcacacttgtgtcgtcatgagcatt gttattgatggtgttaagtttcttttcaaataggttcgagagaagaccgtgtgttgggttcatccattgcagttctgttg tgtgttcagttaggagcaggatcagatggtgaaattgtcttcaaaactctcaaaccacatttcatcacagtcattcaaga tcaaacagcaggatttgttgccagaggcaatgtaagaacatttaatttcatttaatgatagattagaccattgttactac taatgattagtaatatcattcatgttatctattagcaataattaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatttaataattaagggattccggttaa aacaacatctgcaaatgctttgctgggaaataatgttgatcaaatgaaattaatgtgtcaggttaccttaaaaaatggat tttagcctccaaatttcaaagtgacaccgtgctacttcagcgtaaatcacgggcacagcattttacagaaagtccgaatt tttatccatcgtcttgactgtgtttcactcctcataacctacaacatgacagctagcatggatttcggcagttttagttt gctttcttttcatttgcttgcgcattgagcatgtgctaagattgtcttgcaatggatattaaagtaaagttatgaatttg ttttcctgcctctggagttcctataccttccagtgacttgaatatgacttgttgttgacttatctttctcagtacaccat tttacagttgcttgcttagttgcttggcctttgaatgaaagtgaggctggaggtgacattgttttcatagaaacctttct gcttttcttgtgttaatgatgttgttctcatgctaattagtacaaatttacataagaaaaccagtgaggtttctatcaaa acaaggtcacctccagcctcattttcattcaaaggccaggcaactaaacacacaactgtaaaatagtctgttagcaactt cactttttttgcaatttcaagccctggatagtaataccttttttaagtgctttgttgtagagtatacagaatagtatttc ctgctttaccctaataaatttttatttatttgttttttcagtgtgcctctgctctggctttatgttgcttcattgcttct gaagattctgaggtaaattagtactgttcaattttgtgacaatcagtagagaatagaaacggtatactcactgtagaaga gactttaataataattatgagagattctcattcagttgtagggtaattccacggtattttgcatgtcacggaggggacaa ctttgacgataatatctccgatagctcccttataaaataagttttgctaattctgacctttcagtggataaaactacttg tgactcttttttatgacattgtttcaaaattatttcttcaacgagtgggatgatttagtcctttatttaggctgtcacag aggggaccagaaaaatcacaaaaagtgaaagttgaaaattaggctaaaaatcctgtgaacattaaaggagagcagccaca attaagtgcacattatattttgttggcacttggcaattaacagagattaatggaaaaggcattcttcctcctctatatag catggacaacaatgagtgaaagtggttgatgtcacggaggggactgtcacggagggtacattttgtctgttgtttactgg aagacaaaagccattaatagtcactctgccaaaccctctgggcaaacaagtgtttgaaatttgtgctagtaaagcagttg cacatccactattcaatattccattccttcttaaacagcatcactttcagttaatttctctgattttattgagaaatgtt tagttcaactaaactgttacgcaataacaaaaaactctttaaaaggtttatgaaggccttgtcctaagaaaagcatgacc tttttaaaaccttaacttccaagtcttataatttatgcttatctgctaataggtaatggtcaagcttgtctctttcaaca tcttaactgaacacagaaatgcttgccattaactaaaagctcagcaagaacaacttctgaaatatacaatataattatgt gcaatgctctatggaaacaactttaagccaacacttcgcgctaaggacatagcaagcagaatctcactgtgcagaaacct ctgcagaatttcaatgaatgttgcttgcgaacttatcttactgtttgtgctgctttctaatgaaacagtgtactttctca acttcacattgacttgaaatagtaaaaggtcagttgctctccaacaacacaggaccataaaaaatgcaactgtagtgtat tctgtccacgtcatctgttcttggccagtcataggaggtggagcttttgctgtgcaagaacttaaggtcaacaaagcagc cttctacagatacgattcttccaaaataaaaggtgtttacatagtcaacggcataatacatccctgcctgaacccctgta gatggcattgggctgaggatttgaaaatgcaggtcatgaatgatggatcttctaacatccatgatgttcgcattaagtat gaagggacctgaaagagcaagtgctcttgaaaacatgcaaacaaaatcaccacaatcatagcttnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncagaatactggaaattgaattgcgagcttctaaattgcaaattttgctggg ggagcatagacccccctagtggaaaggggtcctatgcccaccttttctgtcatagctgcgtattccacttccagcagccc tctgcaaaaaaaaaatatttaaacccctggcaagtaagtaggtgttcgctaaatgttgttaagtgctacaaaatgtcgtg ttaagcgtaaaagtaaaaagtatacctgtatgatgatttgtgttattgtctgggttatttgttaggttaggatttaggga ctgtttttgttttcatgtggagtatggtttagatgatactccatgaccaatattgtcagttttcctcttttcaagtaacg ttgaagttgatcaaactgtgagggaacaccttgtgacatttgttgaaattgacaggtattaaattacttgcaatcctgag catctgaaatgctgagcaagagttgttttatggtgtattgtaatgttattattttgatttctttttttgtgctcagcaac ttcataacgctgcagtagcaaaggcaaggacacttgtgcgggggaagaacagagacaagcgaaatgcatggaatgttgac tgacatagcagttaattccttgtttccacccttattttccgtttaataacaataattgtttacagttaaaacagtaacag aaacgccaataacagtgataagtaccaaattataattatctcaaagcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgattgata aaagggttgaggttcatccctgcaatatagttacagtagttaaaatttttactatttaatatacaactattccccgaagg ggaggtgaatagtggtggatatataccgaaatgcaaagcgtcgaggtatatatccaccgctcttcacagtccctgtttta gtatttaccagatcagatggataaaaaatgctgcttcattaatggctacaatttcttcttctgaaacgacgcgccatttt tctctctgttcgcaaaacagtggatagtcaaggatattccaagttacaggagccaatcaaaacgctcgaaaaattgctat ccactgattggtaaatactaattgttgttatttacttaattttgttaattgagaatgatatcatttatctcataataccc atttatgtaaaggcattcactggctttcttatttttttatttccttaatcaggagaatgatcttctgcgtgacatatttg acttgggaccaccattgaaaccatcagaagctcacaaggtgtctcgatatcaaagggttagcatttaaaatgttcttgat aatctcctcattactttttctcagcaaatgctcccttcctgcaaaaaacttaaccttactaagcttgaaaatacatgcag cattctagtaattattgctagagtactaagtgtgtcttaagaccagcttatcctttttgctcatacttacacatcctttc atactccattcgttacagtctgcggaaagtgactcagtatgaatgttgcatttaagtccaggattgcaagcaggggtttc aataaaagcgagttactggt |
Protein
Protein ID | aug_v2a.08157.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.08157.t1 MPKGDSKGKSKGKRSQQTRKNGRRGDDESNDDDVETQSVASYSSTPGTHSGDEGISFLKETIVDCIERCLKRGSREDRVL GSSIAVLLCVQLGAGSDGEIVFKTLKPHFITVIQDQTAGFVARGNCASALALCCFIASEDSEQLHNAAVAKARTLVRGKN RDKRNAWNVD* |