Gene
Gene Model ID | aug_v2a.08467 |
---|---|
Locus | scaf3233 : 90556 ... 97277 : + |
To GenomeBrowser | scaf3233:90556..97277 |
Genes list of scaffold | scaf3233 |
Manual annotation
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
---|---|---|---|
aug_v2a.08467.t1 | gi|543731588|ref|XP_005506835.1| | PREDICTED: kelch-like protein 31 [Columba livia] | 5.0e-22 |
aug_v2a.08467.t1 | gi|260813770|ref|XP_002601589.1| | hypothetical protein BRAFLDRAFT_85842 [Branchiostoma floridae] | 2.0e-21 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.08467.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.08467.t1 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgagatgaagtttgatgtgcagacatactgccgcgtcatcttggtt gctaatcgacacggattgaaagacttgaaagaggctacgcaaagaaaaatggcgtcaatgtacaaggaactatgtgaaaa ggaagagtttttgtctgatatgggtgtagatgtattgtcagatcttctctctcgagatgacctcagagctccatcagaga acttcgtcttcaaatcgatgatgcaatgggtcaaatacaggaaggaagaaaggatggatgtggcagctcaagttatcgga gcagttcgtttgggactggtggacatcaaggatgtgatcgaggaactcgatactgaggaaatgcaggcgatcccagaatt acacatgttgttacacagaacagtaatacacaattgcaggcctttgagcagttccgcgtttgcgttggaaaaagcgagac cgagatcaatgaacccggtaggagagagcgtttttcttgttctatcatttactttgcacaagaatctcctttgttgagac gaatttagactttggtttaggattagaaacattatgctctaaatttgaccattatacttaaagtttatagcgtcaccctt aaaatcgtacctttgtgccgaaaattatgcacgtatcagaccattatgcgccgatcaatttgaaacttcaacatcccccc agggcaaatcccgggcatttgaacttttgaagattggatcgttcaaatcactgccctctcaggcctaaatggtgttcaaa atggccaccttatcgacggatttgtctgtcaaaatcccctatttaagaacaatcgtcgtcggcgcggctcctaccgtctt tataaagcttgtgtataaacacgccgacagatgtcttgtgagcccttatattgaaactattaaaaattgacttaataaat taagtcggacaatgtcaataagcaactgtaagcttatttctgatgataccgttttcaccagacttaaggtagctccatat agcttttttgtgggtgttacgaaaactaagacctacgaaaacgaagacctaagacccccggtcttagttttcgtactacg aaaacgaagaccctgtaaaacagaaaaccgtaaaaataataattacaaggtaaacacacattagcagcaacaacgcttag tagtataatacgacatcacacttcacgcgttttttccattattgcctgtgttagaactactggcccgtcttaccggctct gtttcgctatgcgagctaatttggaactaagacccttgagggtttcttcgggtaaacttaccacgcatattattctggaa cagcaggcataattcgaacgctagccgactttgattttatagaaaggattgtgtgacagaataacaaagaacgcgttctg cacaaacaggaaaatattctcttgggttctgtcaataaattgtttatgtctaccgtattttgtagctgaaatgccttgga ttctaacagtcgataagccttctctgctggtaaattctcgttaaaaagtaagcagttctttttgctaagtcagggtcttt cgtaccacgaaaactaagaccctctattaaaagcagaaaagccactgaaagtacgattttagacgtaccctgagcactag caattgttaagttagctcttgatatattggatctaaacttggactcgttgcatagaaaagcaaatgcaacagccgaaagc agtggtgactgaagaaagaccaagaaacaccacgcgcgaacggtcttaacatatcaagagctaacttaactgctgtttca gagtaatatgcgtggtaagttttcccgaggaaatcctaaagaatctcaattccaaattagctcgcattgtgaaacagaga cgataagaagggccagaagttctaaaagagacaatgatggaaaaaaacgtgtgaagtgtgatgtcgtattatactactaa gccttgttgctgcttatgtgtgtttaccttttaattattctttctacggttttctgttttacagggtcttcgttttcgta gtacgcaaactaagactgcgggtcttagttttcgtactacgaaaactaagaccggggcttaggtcttaggtcttcgtttt tgtaggtcctagttttcgtaacacctgcttttttggcgtgcgaggaataagaattattagtaaatttttagctcgggata atgactttccagctttctgattggttccctaagcccatgatatgagccattatcgttaagtttgaccaaataaggaaaaa ctgatggcgaatttcttgtgctgaaattttggaggtcggaaaaaattttttcgcggcgtcgtcggtaagaaaatagggag cttaagaagctacgacggcaactgcaaagaaaacgtctcattaaaattgaactttgcgttaagttaagtctcttgcgatt attccatgttgatcacgttgtacaaaataggcggagtgcactttcgctagcttggtaggaatggttttcgtgtaaaggca aagaagaaaagatttactgctccaagctcccgttgtcgacagaacctcaaatgtgaaaatttcacgtcgtcgtttggcag actacgccaaaacattgcaccaaaaagcgtgctgcacgtgcagcacgattatttttcttcattcaaccaatcaaatcatt gatttgtggcgttgtcgttgacgttgccgtcgtcagatcttaagctccctaatgtcacgatttgaggaggtttcacccga agaaatcaagagaattgctttaaaatttactaaaacagttattcttctcggacttgcatgatatgagctgataataacca actcggcctacggcctcgttggttatatatatcagctcatatccggcgcgtcctcgaagaatgatatattggataactaa atggcgcgagcgcgcgagtatttaaaagaatttctgttttgatgacgtcactaaaaaagggttattaagtgatctaaaaa tgcacatcgggcaggttccagatggtggatttttttgacaattagcacatagataggcttttcctctctctcactgttag gaaaaaatcatcaaattttatacatacattaatgcaatagatatcaaaaacaaaaattgcgaattcctccaaacttttct tgtagctttgtcagttgaaactccttggatgttttctctgtttccccaaaaacaaagaaaattcaccaagtagaaaccta gaaaaaccgtctagaagtcaggtaggttcaagaaaaaagccaagcatctctattactaattagggttccgaaagagtatt tatgcagatgtgatattcaaacctttgtaaaatagtagatagagccaacttaggttaatacaaaaacacaactttaattt tgaaactattagaaatgacttaaaagtgcattaattaagttggagaatgttaatatgcaactgtcgctgctctaactcca aaaccccacaaaggttgtttaacgagggtactgttagtctgtatacatatccacaacagagcctagagattttacgactg aatgtatctcttaaaattgttcaatgtcggttgattacctcaaactgaaaggtttaatttttcatgaataattttgactc tgtggcccatgcaatgacaccaagagctttaggagttcaataattcatgatgtttgagctacaaaaaaactgatgttgat gaccatcatattttccaggtaattgttgccatttttaacaacggtgtcatcaattactttgatgtccagtctaaaacatg gaaagagttgtcatcagtgcagccactaacaggcgttcaagaatgttattgtgctgaacttattggtaatcatttgtatg ttgcagcacaaagcaacggcagatttgttatttgttgttatgacatagtttgtggcacttggagcacactccgaccaatt cctggttctccagctattcaatttggctgcttgtgccatattgaagaacatctctacgtcatttacatgtcaaatgcacc ttacagatataacatagctacaaatcaatggcaatctatggctagctcaaacgctgtttgtaatctgggattttgtaaca aagcagctgctgtgtacaaatcttgtctttatgtattgtatgctcaaggaattcagatggaaaacgggcggtatgtctgt agggcatataattctcttctatatcgttttgatccagagaaaaatgcttgggaacagaaggcatcaaccaaaacaccaca atttgggtccagtcttgtggtagtaaaccataacctccatgttgttgggggatattgcgcattcattccacaaagtcttc aactttctggcggtccagctgctgttgaagtttacaatgaccaagaaaatgtatggtctgttgtagaacaaacacacatt ccaccaaacaaccttagagctgtagaaattgatggaagggtctatttcataatcaactcttttttaattgacagtggtat cacaatcccaccaggggaggtctaccctgctgttctggatgggtgggaaaacttaggaagggttgccagtaatgcagttt tgtgccatgttcctgtaaaaacagagaatcatacaatagaaaatgaataaggtgagctgaaaagctgttggaagcatgat taaggccctaatggcatcattttcaatattgccaatttcagagtttataccttttctctttttttctttctagtaggcct gtgtaaggtacctgtaaccattcaatttttttcatttaagatagtttaatgttaacacaacacataaaggactgtcaaac ccacaattaagtcttcaaatattgagaactagaaaaatgctcatgatgtcacttgtggtgacgtcatttgtccaaaagta caagttgactccaaatgacgtaatatatccaccacattaacagttcatatttagctgcctaaacatgtatatatagaact gcaagaaaatggttattcactgttagtgcaaatcgtatacatacttatcaataacgatcaaaatctttacaaatatatga taaattattattgtaaagccactggtcatgccactgaccatgaaaaagccagaaatgtaattactgttaccatgtttcta ctaatcatattgaaaaagcagccttttagtcacattttaatttcttattgatgttaacagtaaattagctcaagcaactg taacataagacatttgaaatttcagtgttttgaagtcgagtctcacaagaaatcacaaacttcagtgatttatcgatgag atctcagactataatctggagatcgggagatactgtccaaaatcaggagtctcccggaatatctgggagagttgacagcc ctgcacatttttaccatgattgtagatatgacagtgttaggaaatgtcagtaattaaaaacactagaatgcagggtcagg tgttctaactgtatgcggggagaaccaaaaagaaaaaatgaaacaacattaccgttgcaccatgaagtgaaaaccgtcaa aaagtacaaaaacaaagggtgtggtatgtcaaatttgtagaaaataccagcaatcaaggtgtgttgtttttgtagcagtt gtttaaaataaacaatttcaaggtttttgaaagaaatatgggtaaacttggaagtctttttagtttgtacgaacatcaaa cctttaaattagacaatggaagtgttgggtttttcagcagggtggggtaccaagagtacttgacagagaaaacctctcag aggatagaggcaaatcaacatttattacaactcaagggaccaaccagggttggccatcagacagacacaatgagaccgtc tgacaatttactatgtagatgttgcaaacattgcacacagtggattattgtcggtggtcaataataattatcatagaaaa agcatgactgaatgtagtctacgtaatgaatcacagcttaaaggaaattattgctttgcacttcaggttctttgagaaca ggacaaaactatttctccctcaagattttctttttgtgtcatcaccaagcatatcaatgtggcagacaattttgtaggca cacctaaacttaatttactaaaaatatcaacaggccagtttgtgaaaaccttactgagctataattctgtcttattggag actgaaatttctttcccgcccattaggtaaattttcttgaagattttgctgaacaattattacaatcctttccttcatga ttagaagacattattgaagtttattttcaacatacaaagtaattatatggtattgaaactagtatttgacctgtgagaga acaatgaccataaatttccgaatataagctcccccaaaataactctctcaaaaagagcctttaaaaaatgtaagccttgg aacttactttcggaatttaacggtttgttctctcactgaggttaaaataaccctgctttcaaactacttagcagaaaaaa aactaataacattcaagtttactttttcacagtagtaataagtatgtaaaattaatgaattgattaattttaagacactt gtgatttaattactatgttcatttccattaataatcaagcaatagactgatttttctatgactgtgtagcacacaattca ta |
Protein
Protein ID | aug_v2a.08467.t1 |
---|---|
Definition | - |
>aug_v2a.08467.t1 MKFDVQTYCRVILVANRHGLKDLKEATQRKMASMYKELCEKEEFLSDMGVDVLSDLLSRDDLRAPSENFVFKSMMQWVKY RKEERMDVAAQVIGAVRLGLVDIKDVIEELDTEEMQAIPELHMLLHRTVIHNCRPLSSSAFALEKARPRSMNPVIVAIFN NGVINYFDVQSKTWKELSSVQPLTGVQECYCAELIGNHLYVAAQSNGRFVICCYDIVCGTWSTLRPIPGSPAIQFGCLCH IEEHLYVIYMSNAPYRYNIATNQWQSMASSNAVCNLGFCNKAAAVYKSCLYVLYAQGIQMENGRYVCRAYNSLLYRFDPE KNAWEQKASTKTPQFGSSLVVVNHNLHVVGGYCAFIPQSLQLSGGPAAVEVYNDQENVWSVVEQTHIPPNNLRAVEIDGR VYFIINSFLIDSGITIPPGEVYPAVLDGWENLGRVASNAVLCHVPVKTENHTIENE* |