Gene
Gene Model ID | aug_v2a.09061 |
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Locus | scaf3466 : 9686 ... 19398 : + |
To GenomeBrowser | scaf3466:9686..19398 |
Genes list of scaffold | scaf3466 |
Manual annotation
Study field | Flagellum |
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Gene name | Adi-Trp1 |
Description | Named thus because a bi-directional best hit result was obtained by BLASTP searches. See Mus musculus short transient receptor channel 1 (NP_035773). |
mRNA evidence |
Annotation by Blast2GO
Annotation | GO |
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short transient receptor potential channel 5 | GO:0006811 GO:0044763 |
Blast Hit to nr / sp
query | Subject ID | Subject Name | evalue |
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aug_v2a.09061.t1 | gi|704520989|ref|XP_010083218.1| | PREDICTED: short transient receptor potential channel 5 [Pterocles gutturalis] | 0.0 |
aug_v2a.09061.t1 | gi|697513458|ref|XP_009683748.1| | PREDICTED: short transient receptor potential channel 5 [Struthio camelus australis] | 0.0 |
Transcript
Transcript ID | aug_v2a.09061.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.09061.t1 gtctatgcatcaagccatagctaatagaggggaactttgatcaagctaattaatccagcgaaaatgaaaataccttatga acctccagcgacagctgtgattctcgacgatctaacagatgcgcctgaatcaacgaacgaggatcaggtcgagtttctta acgctgttcgagatggaaatgaatccatggtgcgtgtgtacgttttggagaaatcaattgatgtcaagtgtgcgaacttg atcggcgaaacagctttgcaaatagcggcaaacaacgaccatcgtgagattgctaaattcatcgttcaacaaggagcaga tgtgacgcccgctctgctgcaagccgtggccaaagaatcagtggattgggttaaagccttgctcgacttcgtagagcttt caaatgataaacagaactatgacacctcgtcaaacacaagcgacggtttttcgggttgtgccaagaagccccattcttgg atttctcccttgatgttggcagcccaaaatgactgtccagagatcgttcggctttttctcgagaagggatacaaaataga ggaattacagatgcatgaaaaatcatatacatctgaagattacgaaagcctgttgggaaacataataggtcgctcaattt atcgtttaaacagctaccgagcgctggcaagtcctatttatttgtgcatgtcctatttgctcgacgattctaccgaagaa caaagcgtcgaatcgtccaatgatcccatggtgcgcgcctttttgctgaatcacaaatttgaaagcctcgtcgatacgga atatgaatacaacagtgattacaaaaggctctccaaccaatgcgaaagatttgctgtttcgcttcttgagaaatgcgaat cagtggaggaaattagctctattatgagcctttctggaattgaacggctggagcacgtcgaagaacgtggaggaaaagag 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Protein
Protein ID | aug_v2a.09061.t1 |
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Definition | - |
>aug_v2a.09061.t1 MKIPYEPPATAVILDDLTDAPESTNEDQVEFLNAVRDGNESMVRVYVLEKSIDVKCANLIGETALQIAANNDHREIAKFI VQQGADVTPALLQAVAKESVDWVKALLDFVELSNDKQNYDTSSNTSDGFSGCAKKPHSWISPLMLAAQNDCPEIVRLFLE KGYKIEELQMHEKSYTSEDYESLLGNIIGRSIYRLNSYRALASPIYLCMSYLLDDSTEEQSVESSNDPMVRAFLLNHKFE SLVDTEYEYNSDYKRLSNQCERFAVSLLEKCESVEEISSIMSLSGIERLEHVEERGGKEAQKLSMLNFAIANKNEKFVAH PYSQLMLNSVLYNDLESWKDRNLVIKILVGLVFASLLPLWFPIYFFAPNSDLSQLLEKPFFKFVNHGSSSVWFLALLICS SIQDQFFDVLQYSPLDLFLTVSIIGMLVQEAKEVYRQGTERYKSQYWNLVTIFMLFLFVASGVFWFIGYFISVGGHDSWK IPIEAVFSDKNATESAYRFVLLSNVFFSLAMILAFFHASNFFQVSPVLGPLQFSLVNMTGDIGKFLFLFLLLFLSFGFAE RKVYSRYVQAREDFAGNKTDHEFAKIGGTLHYLFWNAFGMTELEDLHTSERFVITQYAGELLLGLYTIASLLVAINMLIA MMSNTYQTVADDADIQWKFSRTRMWMRYLDEGSVMPPPFNLIPQPRVVINFCRRLCSHGWHRQRKSSTSRRKEKKQRIKR RKVMKLLSQRYLASFAKTRDKSSASQPPTERDETTMSNM* |