Gene
| Gene Model ID | aug_v2a.09300 |
|---|---|
| Locus | scaf3553 : 18907 ... 25718 : - |
| To GenomeBrowser | scaf3553:18907..25718 |
| Genes list of scaffold | scaf3553 |
Manual annotation
Annotation by Blast2GO
| Annotation | GO |
|---|---|
| rna-binding motif x chromosome | GO:0005488 GO:0010467 GO:0016070 GO:0043227 GO:0044424 |
Blast Hit to nr / sp
| query | Subject ID | Subject Name | evalue |
|---|---|---|---|
| aug_v2a.09300.t1 | gi|528500040|ref|XP_005173253.1| | PREDICTED: RNA-binding motif protein, X chromosome isoform X2 [Danio rerio] | 6.0e-18 |
| aug_v2a.09300.t1 | gi|657523444|ref|XP_008305198.1| | PREDICTED: RNA-binding motif protein, X chromosome [Stegastes partitus] | 2.0e-17 |
| aug_v2a.09300.t1 | gi|573890371|ref|XP_006632947.1| | PREDICTED: RNA-binding motif protein, X chromosome-like [Lepisosteus oculatus] | 2.0e-17 |
| aug_v2a.09300.t1 | gi|742226293|ref|XP_010899769.1| | PREDICTED: RNA-binding motif protein, X chromosome isoform X2 [Esox lucius] | 4.0e-17 |
| aug_v2a.09300.t1 | gi|432877559|ref|XP_004073159.1| | PREDICTED: RNA-binding motif protein, X chromosome isoform X2 [Oryzias latipes] | 6.0e-17 |
Transcript
| Transcript ID | aug_v2a.09300.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.09300.t1 ggaagacatcttgaaatcaaattcgcctcgaagattatccttacataaaactttaggtgaggcgaactttcttttcagga cgaaatgactggaggtttttctggaaaaaagcttttcgttggaggccttccccctaaagtggacgaaaaagctctgcgag atgtgttttcccgtttctggcatattgaagaaggtttgtctgtacgatcaccacgagatacatacgagaacatacgagag atgccattgatcacagctgagcatttctaaatataacagtgcattggtttaattggtttatagtagtctatgcatagtcg gagaaaacgataaattcttgaagagtagaatgcctagccattacatctttctattctcgagtagcaaagttttaattaat tcattcgcagctaagttgaatggcttatttctaaatatatcgtatgtattacacaatatatggaaagaaagtctttcagc cagaagagctcgagatggctgttaaaaaattggcagtgcaaagcgaacttcatgctgtaaaatgggaaaaatagatatag gcatgattttcctctcgttttgagttgttgcgcgggagttctgattttttctcctgttgtgactggccctagttattact ttggtattggtatttggtcagtcctatcaggctgctataactgatctttgatagcaataggtgtcataagaaaatggttt gagcccaggagtaacatgccttgattgaaaaatatcatctgggtgagcagagtccttagagggactgttgtttgcaactg aggtttcagaaccctgaagatggcttccgcacaggttgtcgaaacgtcagtcacaaacaacagtcgttctcaggagccca atctagatctcccacatgatctttttcaatcaaaataggtgtcatggcccttacaagattggccagccaagcaaatgaga 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cttttactttctgcgaaacattttattagcttcaaataaagatatcttggcgttgtcaacctcaagtagccgaataattt gatttcttaact |
|
Protein
| Protein ID | aug_v2a.09300.t1 |
|---|---|
| Definition | - |
>aug_v2a.09300.t1 MTGGFSGKKLFVGGLPPKVDEKALRDVFSRFWHIEEAIIVTDRETHKSRGFGYVSFLNEEDAKEAMSTMAGERGKEFFNH EMTLEYAKDKDSASSRGGGRGGRGGFRGGYSDRGRGPPSRGPPFRGPPPGPQRGPPSRPRDHRPPPYRGRDTMPPPSRGP PRGPPGEPRRGPPPPDNRYDDYGPPPDRWYPSRDYDRGGYSERERERPPSYSSDHYSSRYPPPERGASSGGSSYSSSDRG YGPPMDRGYGASDRYGADDRGYASDRGYSDRYGGSSAGASSVDRYAQERGSYASDRQDRGGYESGSSSGYGGSDRGYGAP DRGYGPPPDRGYGPPPERSRAGYGPPSDRPYSAGSYSSGGRDW* |
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